GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 360 of 360 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • KL
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • KLB
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
Activated NTRK2 signals through PLCG1
  • BDNF
  • NTF4
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
RET signaling
  • ARTN
  • CDC25C
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK6
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRB7
  • Grb10
  • IRS2
  • MAPK7
  • NRTN
  • PDLIM7
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PRKCA
  • PSPN
  • PTPN11
  • RAP1GAP
  • RET
  • SHC1
  • SHC3
  • SOS1
  • SRC
Sus scrofa (pig)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PLCG1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD14
  • CD180
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • ITGAM
  • ITGB2
  • LBP
  • LY64
  • LY86
  • LY96
  • PLCG2
  • TICAM2
  • TLR4
Sus scrofa (pig)
Generation of second messenger molecules
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DRA
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DRA
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC100153139
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PLCG1
  • PLCG2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Role of phospholipids in phagocytosis
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLA2G6
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD3
  • PLD4
  • PLPP4
  • PLPP5
  • PRKCD
  • PRKCE
Sus scrofa (pig)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • CALM3
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKC
  • OCRL
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCD4
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCH2
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PTEN
  • SYNJ1
Sus scrofa (pig)
Neutrophil degranulation
  • A1BG
  • ABCA13
  • ABP
  • ACP3
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ADA2
  • ADAM10
  • ADAM8
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANPEP
  • ANXA2
  • AOC1
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APAF1_tv3
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP11
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ASC
  • ATAD3A
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • AZU1
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • BST2
  • C1H6orf120
  • C1orf35
  • C2H1orf35
  • C3
  • C5AR1
  • C6orf120
  • CAB39
  • CALML5
  • CAND1
  • CANT1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD300C
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CDA
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHIT1
  • CK2N
  • CKAP4
  • CLEC12A
  • CLEC5A
  • CLECSF5
  • CNN2
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISP3
  • CRISPLD2
  • CSNK2B
  • CST3
  • CST6
  • CSTB
  • CTL2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSH
  • CTSZ
  • CXCL7
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DAO
  • DAP12
  • DDOST
  • DDX3X
  • DEGS1
  • DERA
  • DF
  • DGAT1
  • DIAPH1
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSC1
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • DYNLT1
  • EEF1A1
  • ENPP4
  • EPX
  • FABP5
  • FAF2
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FCN1
  • FCN2
  • FGL2
  • FOLR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLUT3
  • GM2A
  • GNS
  • GOLGA7
  • GP91-PHOX
  • GPI
  • GPR84
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GST12
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HEBP2
  • HEXB
  • HK3
  • HP
  • HPSE
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1B
  • HSPA6
  • HSPA8
  • HSPCA
  • HUWE1
  • HVCN1
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB2
  • JUP
  • Jup
  • KCMF1
  • KPNB1
  • KRT1
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LC8
  • LCN2
  • LOC100153783
  • LOC100154047
  • LOC100154844
  • LOC100156325
  • LOC100511639
  • LOC100512873
  • LOC100513601
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100517285
  • LOC100521529
  • LOC100522225
  • LOC100525227
  • LOC100525396
  • LOC100624191
  • LOC100624590
  • LOC100736623
  • LOC100739163
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • LOC102163838
  • LOC110255185
  • LOC110255221
  • LOC110258710
  • LOC110260465
  • LOC110261034
  • LOC110261633
  • LOC110261636
  • LOC110261637
  • LOX1
  • LPCAT1
  • LRRC7
  • LTA4H
  • LTF
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MDL1
  • MGAM
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MNDA
  • MOSPD2
  • MPO
  • MVP
  • NAPRT
  • NAPRT1
  • NBEAL2
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NME2
  • NPC2
  • NRAS
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORM1
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PADI2
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC
  • PGRMC1
  • PIGE-108A11.3
  • PIGR
  • PKM
  • PKP1
  • PLAC8
  • PLAU
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PMAP-36
  • PNP
  • PPBP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRKCD
  • PRSS2
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRN2
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QRICH1
  • QSOX1
  • RAB10
  • RAB18
  • RAB24
  • RAB27A
  • RAB31
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB3D
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB7A
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAP2A
  • RAP2C
  • RETN
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASET2
  • ROCK1
  • S100A11
  • S100A12
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
  • S100C
  • SCAMP1
  • SCYB7
  • SDCBP
  • SERPINA1
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SERPINB6
  • SIGLEC14
  • SIGLEC5
  • SIRPA
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SNAP23
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • STFB
  • STING1
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TBC1D10C
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMC6
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRPM2
  • TSPAN14
  • TTR
  • TUBB
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TXNDC5
  • TYROBP
  • UABP-2
  • UBR4
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VNN1
  • VPS35L
  • XRCC5
  • XRCC6
  • try
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024