GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANBA
Sus scrofa (pig)
Adherens junctions interactions
  • AFDN
  • ANG
  • ANG1
  • CADM1
  • CADM2
  • CADM3
  • CDH1
  • CDH10
  • CDH11
  • CDH12
  • CDH15
  • CDH17
  • CDH18
  • CDH2
  • CDH24
  • CDH3
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH7
  • CDH9
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • Jup
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
Sus scrofa (pig)
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Sus scrofa (pig)
HS-GAG biosynthesis
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HS2ST1
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B1
  • HS3ST4
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST1
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST3
  • NDST4
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLC35D2
Sus scrofa (pig)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP11
  • CANX
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSO
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DRA
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GILT
  • HLA-DOB
  • HLA-DRA
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF18A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LC8
  • LGMN
  • LOC100153139
  • OSBPL1A
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SLA
  • SLA-DMB
  • SLA-DOA
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • SPTBN2
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • ADD1
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • GAS2
  • GSN
  • MAPT
  • PLEC
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • VIM
Sus scrofa (pig)
Galactose catabolism
  • GALK1
  • GALT
Sus scrofa (pig)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSD
  • ARSG
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • LOC100621771
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Sus scrofa (pig)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DMP1
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • PAI1
  • PLANH1
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNN
  • TNXB
  • VCAN
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Neurotransmitter release cycle
  • NAAA
Sus scrofa (pig)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • 3b-HSD
  • CGA
  • CYP11B
  • CYP11B2
  • CYP21
  • CYP21A1
  • CYP21A3
  • HSD3B
  • LHB
Sus scrofa (pig)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MYO5B
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Sus scrofa (pig)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • Fgf4
  • KL
Sus scrofa (pig)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • B2M
  • CALR
  • CANX
  • ERAP1
  • ERAP2
  • HSPA5
  • LOC100513601
  • PDIA3
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • TAP1
  • TAP2
Sus scrofa (pig)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • Jup
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6A
  • KRT7
  • KRT71
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT80
  • KRT82
  • KRT84
  • KRT85
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100515166
  • LOC100516036
  • LOC100517674
  • LOC100518807
  • LOC100523123
  • LOC100523275
  • LOC100523670
  • LOC100621639
  • LOC100621844
  • LOC100622826
  • LOC100623393
  • LOC100625168
  • LOC100625858
  • LOC100737483
  • LOC102160031
  • LOC102164863
  • LOC106504189
  • LOC106507258
  • LOC106508044
  • LOC110255272
  • LOC110255312
  • LOC110256008
  • LOC110256282
  • LOC110260665
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Sus scrofa (pig)
Signaling by Erythropoietin
  • EPOR
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
Sus scrofa (pig)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PLCG1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • CALM3
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKC
  • OCRL
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCD4
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCH2
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PTEN
  • SYNJ1
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Advanced glycosylation endproduct receptor signaling
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • S100A12
  • S100B
Sus scrofa (pig)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BRK1
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • GRB2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IGKV5-2
  • LIMK1
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
Sus scrofa (pig)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • MAOA
  • OCT2
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13B
  • VAMP2
Sus scrofa (pig)
Inhibition of TSC complex formation by PKB
  • AKT2
  • TSC1
  • TSC2
Sus scrofa (pig)
Degradation of cysteine and homocysteine
  • ADO
  • CDO1
  • FMO-1
  • FMO1
  • GADL1
  • MPST
  • TST
  • TXN2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024