GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription
  • CBFB
  • ESR
  • ESR1
  • NR3A1
  • RUNX1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-10 signaling
  • IL10
  • IL10RA
  • IL10RB
  • JAK1
  • STAT3
  • TYK2
Sus scrofa (pig)
Calnexin/calreticulin cycle
  • CALR
  • CANX
  • PDIA3
Sus scrofa (pig)
TGF-beta receptor signaling activates SMADs
  • CBL
  • FKBP1A
  • FURIN
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MADH3
  • MADH4
  • NEDD8
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
  • UBE2M
  • ZFYVE9
Sus scrofa (pig)
RET signaling
  • ARTN
  • CDC25C
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK6
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRB7
  • Grb10
  • IRS2
  • MAPK7
  • NRTN
  • PDLIM7
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PRKCA
  • PSPN
  • PTPN11
  • RAP1GAP
  • RET
  • SHC1
  • SHC3
  • SOS1
  • SRC
Sus scrofa (pig)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
Sus scrofa (pig)
Syndecan interactions
  • FGF2
  • ITGA2
  • ITGA6
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB4
  • ITGB5
  • PRKCA
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TGFB1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Scavenging by Class H Receptors
  • APOB
  • SPARC
  • STAB1
  • STAB2
Sus scrofa (pig)
Adherens junctions interactions
  • AFDN
  • ANG
  • ANG1
  • CADM1
  • CADM2
  • CADM3
  • CDH1
  • CDH10
  • CDH11
  • CDH12
  • CDH15
  • CDH17
  • CDH18
  • CDH2
  • CDH24
  • CDH3
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH7
  • CDH9
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • Jup
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
Sus scrofa (pig)
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Sus scrofa (pig)
HS-GAG biosynthesis
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HS2ST1
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B1
  • HS3ST4
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST1
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST3
  • NDST4
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLC35D2
Sus scrofa (pig)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP11
  • CANX
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSO
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DRA
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GILT
  • HLA-DOB
  • HLA-DRA
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF18A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LC8
  • LGMN
  • LOC100153139
  • OSBPL1A
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SLA
  • SLA-DMB
  • SLA-DOA
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • SPTBN2
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • ADD1
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • GAS2
  • GSN
  • MAPT
  • PLEC
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • VIM
Sus scrofa (pig)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DMP1
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • PAI1
  • PLANH1
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNN
  • TNXB
  • VCAN
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Neurotransmitter release cycle
  • NAAA
Sus scrofa (pig)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • 3b-HSD
  • CGA
  • CYP11B
  • CYP11B2
  • CYP21
  • CYP21A1
  • CYP21A3
  • HSD3B
  • LHB
Sus scrofa (pig)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MYO5B
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Sus scrofa (pig)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • Fgf4
  • KL
Sus scrofa (pig)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • B2M
  • CALR
  • CANX
  • ERAP1
  • ERAP2
  • HSPA5
  • LOC100513601
  • PDIA3
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • TAP1
  • TAP2
Sus scrofa (pig)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • Jup
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6A
  • KRT7
  • KRT71
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT80
  • KRT82
  • KRT84
  • KRT85
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100515166
  • LOC100516036
  • LOC100517674
  • LOC100518807
  • LOC100523123
  • LOC100523275
  • LOC100523670
  • LOC100621639
  • LOC100621844
  • LOC100622826
  • LOC100623393
  • LOC100625168
  • LOC100625858
  • LOC100737483
  • LOC102160031
  • LOC102164863
  • LOC106504189
  • LOC106507258
  • LOC106508044
  • LOC110255272
  • LOC110255312
  • LOC110256008
  • LOC110256282
  • LOC110260665
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Sus scrofa (pig)
Signaling by Erythropoietin
  • EPOR
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
Sus scrofa (pig)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PLCG1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • CALM3
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKC
  • OCRL
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCD4
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCH2
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PTEN
  • SYNJ1
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024