GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 76 - 100 of 360 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC1
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
SHC-related events triggered by IGF1R
  • GRB2
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KLB
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Role of phospholipids in phagocytosis
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLA2G6
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD3
  • PLD4
  • PLPP4
  • PLPP5
  • PRKCD
  • PRKCE
Sus scrofa (pig)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
Sus scrofa (pig)
Retinoid metabolism and transport
  • AGRN
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • APOM
  • ApoER2
  • BCO1
  • BCO2
  • CLPS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • LPL
  • LRAT
  • LRP10
  • LRP12
  • LRP8
  • PLB1
  • PNLIP
  • RBP1
  • RBP2
  • RBP4
  • RDH11
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TTR
Sus scrofa (pig)
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • PRKCA
  • PRKCG
Sus scrofa (pig)
Regulation of necroptotic cell death
  • BIRC2
  • CASP8
  • CDC37
  • FADD
  • FLOT1
  • FLOT2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • MLKL
  • PDCD6IP
  • PIAP
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RPS27A
  • SDCBP
  • STUB1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2L3
Sus scrofa (pig)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • GLUT1
  • GLUT2
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
Sus scrofa (pig)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG1
  • ACTR3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BRK1
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • GRB2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IGKV5-2
  • LIMK1
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WIPF1
Sus scrofa (pig)
Regulation of TNFR1 signaling
  • BIRC2
  • CASP8
  • CASP9
  • CHUK
  • CLIP3
  • CYLD
  • FADD
  • GNB2L1
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • MADD
  • MAPKAPK2
  • MIB2
  • OPTN
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • PIAP
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RPS27A
  • SPATA2
  • SPPL2A
  • SPPL2B
  • STUB1
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF6
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2L3
  • ULK1
  • USP2
  • USP21
  • USP4
Sus scrofa (pig)
Regulation of RUNX3 expression and activity
  • CBFB
  • EP300
  • LMP2
  • MDM2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX3
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SRC
  • TGFB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • A4
  • AD1
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMEL
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • ATGL
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CSF1
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FGA
  • FGF23
  • FGG
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • HRC
  • HSP90B1
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP1
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP6
  • IGFBP7
  • IL-6
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC100156062
  • LOC100738836
  • LOC106510284
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • OPN
  • P4HB
  • PAPPA
  • PAPPA2
  • PCSK9
  • PDIA6
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TF
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TNN
  • UABP-2
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
Regulation of IFNG signaling
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTPN2
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • SUMO1
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Regulation of Complement cascade
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • F2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • SERPING1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • AMOT
  • ANGPTL4
  • CDH11
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • Jup
  • PGAR
Sus scrofa (pig)
Regulation by c-FLIP
  • APT1
  • CASP8
  • CASP9
  • FADD
  • FAS
  • LOC100624226
  • LOC100737977
  • RIPK1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
Sus scrofa (pig)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • CGA
  • CHST10
  • CHST8
  • FUCA1
  • FUT8
  • LHB
  • LOC100513844
  • MAN2A1
  • MAN2A2
  • MGAT2
Sus scrofa (pig)
RUNX3 regulates p14-ARF
  • CBFB
  • CCND1
  • EP300
  • HDAC4
  • RUNX3
  • TGFB1
Sus scrofa (pig)
RUNX3 regulates CDKN1A transcription
  • MADH3
  • MADH4
  • P53
  • RUNX3
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB1
  • TP53
  • ZFHX3
Sus scrofa (pig)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • CTSK
  • CTSL
Sus scrofa (pig)
RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription
  • CBFB
  • ESR
  • ESR1
  • NR3A1
  • RUNX1
Sus scrofa (pig)
RND3 GTPase cycle
  • ARHGAP21
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CKAP4
  • CKB
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSG1
  • DSP
  • DST
  • EPHA2
  • FAM83B
  • FLOT2
  • KCTD13
  • KTN1
  • LOC100516390
  • MUC13
  • NISCH
  • PICALM
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBM39
  • RND3
  • ROCK1
  • SCRIB
  • SEMA4F
  • TMOD3
  • TNFAIP1
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024