GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
DDX58/IFIH1-mediated induction of interferon-alpha/beta
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IRF3
  • MAVS
  • TBK1
  • TOMM70
Sus scrofa (pig)
Activated NTRK2 signals through FRS2 and FRS3
  • BDNF
  • GRB2
  • NTF4
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
PECAM1 interactions
  • FYN
  • INPP5D
  • ITGAV
  • ITGB3
  • LCK
  • LYN
  • PECAM1
  • PLCG1
  • PTPN11
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • CES1
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100154047
  • LOC100736962
  • MME
  • REN
Sus scrofa (pig)
FGFR4 ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
Sus scrofa (pig)
Regulation of RUNX3 expression and activity
  • CBFB
  • EP300
  • LMP2
  • MDM2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX3
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SRC
  • TGFB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
CDC42 GTPase cycle
  • ABR
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BAIAP2
  • BCR
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42EP5
  • CDC42SE2
  • CHN1
  • CPNE8
  • DAAM1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DNMBP
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • ECT2
  • FAM13B
  • FARP1
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FMNL1
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • GOLGA2
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • Jup
  • KCTD3
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MAP3K11
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9B
  • NGEF
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD1
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • PREX2
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • SCRIB
  • SH3PXD2A
  • SHKBP1
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • STARD8
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TAGAP
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASL
  • WDR81
  • WDR91
  • WIPF1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Asparagine N-linked glycosylation
  • ASGR1
  • ASGR2
  • LOC110255214
  • UMOD
Sus scrofa (pig)
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • PRKCA
  • PRKCG
Sus scrofa (pig)
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription
  • CCNC
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDK8
  • CDK9
  • E2F4
  • E2F5
  • FURIN
  • MADH3
  • MADH4
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEN1
  • RBL1
  • RNF111
  • RPS27A
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SP1
  • Smad7
  • TFDP1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • WWTR1
Sus scrofa (pig)
Ion homeostasis
  • AHCYL1
  • ASPH
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • DMPK
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD6
  • ITPR1
  • ITPR3
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • RYR2
  • RYR3
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
  • STIM1
  • TRDN
  • TRPC1
Sus scrofa (pig)
CASP8 activity is inhibited
  • APT1
  • CASP8
  • CASP9
  • FADD
  • FAS
  • RIPK1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
Sus scrofa (pig)
Downstream TCR signaling
  • BCL10
  • CARD11
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CHUK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • INPP5D
  • LCK
  • LMP2
  • LOC100153139
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PDPK1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RELA
  • RIPK2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • TAB2
  • TAK1b
  • TRAF6
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Organic anion transport
  • OAT2
  • OAT3
  • SLC22A11
  • SLC22A12
  • SLC22A6
  • SLC22A7
  • SLC22A8
Sus scrofa (pig)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • CDH1
  • CTNNB1
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSP
  • OCLN
  • PKP1
  • TJP1
  • TJP2
Sus scrofa (pig)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • GAB2
  • GRB2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL5
  • IL5RA
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Transport of organic anions
  • AVP
  • SLC16A2
  • SLCO1A2
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO1C1
  • SLCO2A1
  • SLCO2B1
  • SLCO3A1
  • SLCO4A1
  • SLCO4C1
Sus scrofa (pig)
MET activates PTPN11
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
Neurotransmitter clearance
  • ACHE
  • OCT2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
Sus scrofa (pig)
Glycerophospholipid catabolism
  • ENPP6
  • GDE1
  • PNPLA6
Sus scrofa (pig)
Molecules associated with elastic fibres
  • BMP10
  • BMP2
  • BMP4
  • BMP7
  • EFEMP2
  • FBLN5
  • GDF5
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MFAP2
  • MFAP4
  • MFAP5
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • VTN
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • MAP3K1
  • TRAF6
Sus scrofa (pig)
Signaling by BMP
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ACVRL1
  • AMH
  • AMHR2
  • BMP10
  • BMP2
  • BMPR1A
  • BMPR1B
  • BMPR2
  • CER1
  • CHRDL1
  • FSTL1
  • GDF2
  • GREM2
  • INHA
  • INHBA
  • MADH1
  • MADH4
  • NOG
  • SKI
  • SMAD1
  • SMAD4
  • SMAD5
  • SMAD6
  • SMAD7
  • SMAD9
  • SMURF1
  • SMURF2
  • Smad7
  • TGFBR3
  • UBE2D1
  • UBE2D3
  • ZFYVE16
Sus scrofa (pig)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • ARHGAP35
  • MET
  • PLXNB1
  • RAC1
  • RHOA
  • RRAS
  • SEMA4D
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024