GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 360 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • HSP90B1
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TYK2
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-7 signaling
  • BRWD1
  • CRLF2
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • HIST1H3E
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • LOC110257900
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SMARCA4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Intestinal hexose absorption
  • GLUT2
  • SLC2A2
  • SLC2A5
  • SLC5A1
Sus scrofa (pig)
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Sus scrofa (pig)
Ion homeostasis
  • AHCYL1
  • ASPH
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • DMPK
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD6
  • ITPR1
  • ITPR3
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • RYR2
  • RYR3
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
  • STIM1
  • TRDN
  • TRPC1
Sus scrofa (pig)
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP7A
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • FXYD1
  • FXYD6
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PLM
  • PLN
  • SRI
Sus scrofa (pig)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACO1
  • BMDP
  • CAND1
  • CUL1
  • CYBRD1
  • FBXL5
  • FLVCR1
  • FTH1
  • FTL
  • HEPH
  • HMOX1
  • IREB2
  • LCN2
  • NEDD8
  • RPS27A
  • SKP1
  • SLC11A2
  • SLC22A17
  • SLC46A1
  • TF
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT7
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • KERA
  • LOC100522551
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
  • SLC35D2
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
Sus scrofa (pig)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • Jup
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6A
  • KRT7
  • KRT71
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT80
  • KRT82
  • KRT84
  • KRT85
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100515166
  • LOC100516036
  • LOC100517674
  • LOC100518807
  • LOC100523123
  • LOC100523275
  • LOC100523670
  • LOC100621639
  • LOC100621844
  • LOC100622826
  • LOC100623393
  • LOC100625168
  • LOC100625858
  • LOC100737483
  • LOC102160031
  • LOC102164863
  • LOC106504189
  • LOC106507258
  • LOC106508044
  • LOC110255272
  • LOC110255312
  • LOC110256008
  • LOC110256282
  • LOC110260665
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Sus scrofa (pig)
LDL clearance
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPA
  • NCEH1
  • NPC1
  • NPC2
  • PCSK9
  • SOAT1
  • SOAT2
Sus scrofa (pig)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GLUT1
  • LALBA
  • SLC2A1
Sus scrofa (pig)
Lectin pathway of complement activation
  • COLEC10
  • COLEC11
  • FCN1
  • FCN2
  • MASP1
  • MASP2
  • MBL2
Sus scrofa (pig)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT1
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT7
  • LOC100513844
  • LOC110255214
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Sus scrofa (pig)
Ligand-dependent caspase activation
  • CASP8
  • CD14
  • FADD
  • LY96
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TLR4
  • TNFRSF6
Sus scrofa (pig)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANBA
Sus scrofa (pig)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • APP
  • ARF1
  • ARRB1
  • CHMP2A
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLVS1
  • CTSZ
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • GNS
  • HGS
  • M6PR
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • EDG7
  • EDG8
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
Sus scrofa (pig)
MET Receptor Activation
  • HGF
  • HGFAC
  • HPN
  • MET
  • SPINT1
  • SPINT2
Sus scrofa (pig)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
MET activates PTK2 signaling
  • HGF
  • MET
  • SRC
Sus scrofa (pig)
MET activates PTPN11
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAPGEF1
Sus scrofa (pig)
MET activates RAS signaling
  • GRB2
  • HGF
  • HRAS
  • KRAS
  • MET
  • MUC20
  • NRAS
  • RANBP10
  • RANBP9
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
MET activates STAT3
  • HGF
  • MET
  • STAT3
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024