GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 360 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
GAB1 signalosome
  • AREG
  • BTC
  • CSK
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
  • PXN
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH3
  • COL7A1
  • CTSZ
  • F5
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MIA2
  • MIA3
  • PREB
  • SAR1B
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • UABP-2
Sus scrofa (pig)
SUMOylation of intracellular receptors
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • FTZF1
  • HDAC4
  • NR1A1
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR5A1
  • NR5A2
  • PGR
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PPARA
  • RARA
  • RORA
  • RXRA
  • SMT3A
  • SMT3H2
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • THRA
  • THRB
  • UBE2I
  • VDR
Sus scrofa (pig)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOR-1
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1A1
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RORA
  • RORB
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Sus scrofa (pig)
Assembly of active LPL and LIPC lipase complexes
  • ANGPTL3
  • ANGPTL4
  • ANGPTL8
  • FURIN
  • LIPC
  • LMF1
  • LMF2
  • LPL
  • PCSK6
  • PGAR
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ANOS1
  • CBL
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ANOS1
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
Antimicrobial peptides
  • BPI
  • BPIFA1
  • BPIFA2
  • BPIFB1
  • BPIFB2
  • BPIFB4
  • CHGA
  • CLU
  • EPPIN
  • GNLY
  • LEAP2
  • LOC100154047
  • LOC100520832
  • LOC100624628
  • LOC102163838
  • LOC110255221
  • LOC110260309
  • LTF
  • PGLYRP1
  • PGLYRP2
  • PGLYRP3
  • PGLYRP4
  • PMAP-36
  • PRSS2
  • REG3G
  • try
Sus scrofa (pig)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • B2M
  • C3
  • CD1.1
  • CD1B
  • CD1D
  • CD200
  • CD200R1
  • CD22
  • CD226
  • CD247
  • CD300A
  • CD300C
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD96
  • CLEC2B
  • CLEC4G
  • CRTAM
  • CXADR
  • DAP10
  • DAP12
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • IFITM1
  • IFITM3
  • IGKV5-2
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KIR2DL1
  • KLRB1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LOC100125542
  • LOC100513601
  • LOC100513863
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100515852
  • LOC100519082
  • LOC100521998
  • LOC100523213
  • LOC100626247
  • LOC102161418
  • LOC110260307
  • LOC110261034
  • MADCAM1
  • NCR2
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • PVR
  • SIGLEC1
  • SIGLEC5
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLAMF7
  • TNFRSF5
  • TREM1
  • TREM2
  • TREML2
  • TYROBP
  • ULBP1
  • VCAM1
  • cd1d
  • pCD1A
Sus scrofa (pig)
Scavenging by Class A Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • APOE
  • CALR
  • COLEC11
  • HSP90B1
  • MASP1
Sus scrofa (pig)
Scavenging by Class B Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • CD36
  • SCARB1
Sus scrofa (pig)
HDL clearance
  • APOA1
  • HDLBP
  • SCARB1
Sus scrofa (pig)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • APOB
  • CD177
  • CD2
  • CD244
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CXADR
  • EPCAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GP6
  • GPC1
  • IGHM
  • IGKV5-2
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM2
  • JAM3
  • JAML
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • LOC100624226
  • LOC100736623
  • LOC100737977
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • LOX1
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PROC
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SELE
  • SIRPA
  • SPN
  • TACSTD1
  • TGFB1
  • THBD
  • TREM1
Sus scrofa (pig)
Platelet sensitization by LDL
  • APOB
  • ApoER2
  • LRP8
  • MAPK14
  • PECAM1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
Scavenging by Class H Receptors
  • APOB
  • SPARC
  • STAB1
  • STAB2
Sus scrofa (pig)
Transport of fatty acids
  • APOD
  • LCN1
  • LCN12
  • LCN15
  • LCN9
  • OBP2B
  • SLC27A1
  • SLC27A4
  • SLC27A6
Sus scrofa (pig)
Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin
  • GCG
  • GH1
  • GHRL
  • IGF1
  • INS
  • LEP
  • MBOAT4
  • OB
  • OBS
  • PLA2G7
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
Sus scrofa (pig)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
Sus scrofa (pig)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MYO5B
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Sus scrofa (pig)
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • ABCC1
  • ALOX15
  • ALOX5
  • CYP4A21
  • CYP4A23
  • CYP4A24
  • CYP4A90
  • CYP4B1
  • CYP4F22
  • CYP4F3
  • CYP4F52
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT1
  • LOC110255311
  • LOC110259328
  • LOC110259329
  • LTA4H
  • LTC4S
  • MAPKAPK2
  • RDP
Sus scrofa (pig)
Synthesis of 5-eicosatetraenoic acids
  • ALOX5
  • LTC4S
  • PON1
  • PON2
  • PON3
Sus scrofa (pig)
RNA polymerase II transcribes snRNA genes
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDK7
  • CDK9
  • ELL2
  • ELL3
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2B
  • GTF2E1
  • GTF2E2
  • GTF2F1
  • ICE1
  • ICE2
  • INTS1
  • INTS10
  • INTS11
  • INTS12
  • INTS13
  • INTS2
  • INTS3
  • INTS4
  • INTS5
  • INTS6
  • INTS7
  • INTS8
  • INTS9
  • NABP2
  • NCBP1
  • NCBP2
  • PCF11
  • PHAX
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2L
  • POU2F1
  • POU2F2
  • RPAP2
  • RPRD1A
  • RPRD2
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • SP1
  • SRRT
  • SSU72
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAF11
  • TAF13
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF8
  • TAF9
Sus scrofa (pig)
Basigin interactions
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BSG
  • CAV1
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • MAG
  • MMP1
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024