GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 145 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • LOC100485454
  • LOC100490939
  • crhbp
  • crhr1.2
  • pth1r
  • pth2r
  • pthlh
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF-8
  • HBGF-1
  • HBGF-2
  • HBGF-4
  • INT-2
  • X1FGFR
  • XEFGF
  • XFGFR-1
  • Xfgf-4
  • Xfgf-8
  • Xfgf4
  • Xfgf8
  • aFGF
  • aigf
  • bfgf
  • bfgfr
  • cd331
  • cek
  • ecgf
  • ecgf-beta
  • ecgfa
  • ecgfb
  • efgf
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-2
  • fgf-3
  • fgf-4
  • fgf-6
  • fgf-8b
  • fgf-alpha
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf23.1
  • fgf23.2
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf4-a
  • fgf4-b
  • fgf5
  • fgf6
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgf8b
  • fgf9
  • fgfa
  • fgfb
  • fgfbr
  • fgfe
  • fgfr-1
  • fgfr1
  • fgfr1-a
  • fgfr1-b
  • flg
  • flrt1
  • flrt2
  • flrt3
  • flt-2
  • flt2
  • glio703
  • hbgf-3
  • hbgf-6
  • hbgf-8
  • hbgf1
  • hbgfr
  • hbgh-2
  • hst
  • hst-1
  • hst2
  • hstf1
  • int2
  • k-fgf
  • kal2
  • kfgf
  • kl
  • n-sam
  • ogd
  • xfgf2
  • xfgf3
  • xfgfr1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Initial triggering of complement
  • LOC100038300
  • LOC100496945
  • LOC105947509
  • LOC116406488
  • MGC107780
  • c2
  • c4a
  • c4a2
  • c4a3
  • c4a4
  • c4a6
  • c4b
  • c4s
  • cfb
  • co4
  • cpamd2
  • masp-1
  • masp-2
  • masp1
  • masp2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • LOC100127718
  • LOC100127868
  • LOC101730710
  • LOC548403
  • MGC147250
  • MGC76137
  • acr1
  • aoeb166
  • aop-1
  • aop1
  • aop2
  • apah1
  • cat
  • cat.2
  • catalase
  • ccs
  • cgd
  • cyba
  • cybb
  • cycs
  • cyct
  • dsi
  • erba2l
  • ero1a
  • ero1l
  • ero1lb
  • git
  • gp91-1
  • gp91-phox
  • gp91phox
  • gpx7
  • gpx8
  • gpx8-a
  • gpx8-b
  • gsr
  • mer5
  • ncf1
  • ncf1a
  • ncf2
  • ncf4
  • ncf4-prov
  • nox2
  • noxa2
  • noxo2
  • nudt2
  • p22-phox
  • p47phox
  • p4hb
  • p67-phox
  • p67phox
  • pdi
  • pdia1
  • pmp20
  • po4db
  • po4hb
  • prdx3
  • prdx5
  • prdx6
  • prdx6-2
  • prohb
  • prx-3
  • prx-5
  • prx-6
  • prx3
  • prx5
  • prx6
  • prxv
  • sbbi10
  • sh3pxd1a
  • sod1
  • sod2
  • sod3
  • sodMt
  • sp-22
  • sp22
  • txn2
  • unq847
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Signaling by BMP
  • BMP-2
  • MLP
  • Noggin1
  • XAR1
  • XAR7
  • XMad
  • XSTK9
  • Xmad1
  • Xsmad1
  • actr-iib
  • actrii
  • actriib
  • acvr2
  • acvr2a
  • acvr2b
  • acvrl1
  • alk-6
  • alk6
  • bmp10
  • bmp2
  • bmp2-a
  • bmp2-b
  • bmp2a
  • bmpr1a
  • bmpr1b
  • bmpr2
  • bsp1
  • cdw293
  • cer1
  • chl
  • chrdl1
  • da141h5
  • da141h5.1
  • frp
  • fsl1
  • fstl1
  • gdf2
  • inha
  • inhba
  • jv4-1
  • jv41
  • madh1
  • madh6
  • madh9
  • madr1
  • nog
  • nog-A
  • nog1
  • noggin-1
  • nrln1
  • smad-1
  • smad1
  • smad1-a
  • smad1-b
  • smad5
  • smad8
  • smad8a
  • smad8b
  • smad9
  • smurf1
  • smurf2
  • tgfbr3
  • vopt
  • xBMP-2
  • xFRP
  • xbmp2
  • xsmad9
  • zfyve16
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Asymmetric localization of PCP proteins
  • Fz-2
  • Fz-3
  • Fz-8
  • Xfz2
  • Xfz3
  • Xfz8
  • frizzled-2
  • frizzled-3
  • frizzled-8
  • frizzled2
  • frizzled3
  • frizzled8
  • frz-3
  • frz3
  • fz2
  • fz3
  • fz8
  • fzd2
  • fzd3
  • fzd4
  • fzd5
  • fzd7
  • fzd8
  • fzd8-a
  • fzd8-b
  • hfz3
  • hfz8
  • wnt5a
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Organic anion transporters
  • LOC100488353
  • MGC97830
  • ast
  • ctp
  • gc2
  • issd
  • nis
  • nsd
  • sialin
  • siasd
  • slc17a5
  • slc17a6
  • slc17a7
  • slc20a3
  • slc25a1
  • slc25a11
  • slc25a18
  • slc25a22
  • slc25a22l
  • slc5a5
  • sld
  • vglut1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Ficolins bind to repetitive carbohydrate structures on the target cell surface
  • LOC100038300
  • LOC100496945
  • LOC105947509
  • LOC116406488
  • MGC107780
  • masp-1
  • masp-2
  • masp1
  • masp2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Glycosphingolipid catabolism
  • LOC100145556
  • LOC100170585
  • LOC548706
  • MGC107931
  • MGC89423
  • arsa.1
  • arsd
  • arsg
  • arsi
  • arsj
  • arsk
  • asah2
  • enc-1as
  • enpp7
  • fge
  • glb1
  • glb1l
  • glb1l2
  • gm2a
  • hexb
  • m6pr
  • neu3
  • neu3.1
  • neu4
  • sial3
  • smpd1
  • smpd3
  • sts
  • sumf1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Acyl chain remodelling of PS
  • LOC100145529
  • LOC116407767
  • agpat7
  • aytl3
  • cpla2
  • lpcat4
  • mboat1
  • osbpl10
  • pla2
  • pla2a
  • pla2g12a
  • pla2g1b
  • pla2g1bl
  • pla2g2d
  • pla2g4
  • pla2g4a
  • pla2g4f
  • pla2r1
  • plaat4
  • ppla2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • LOC100127706
  • MGC145520
  • man2b1
  • man2b2
  • man2c1
  • manba
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1)
  • gcg
  • glp1
  • glp2
  • grpp
  • lep
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Asparagine N-linked glycosylation
  • LOC116412330
  • b4galnt2
  • umod.3
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
N-Glycan antennae elongation
  • LOC100145551
  • LOC100489322
  • LOC548965
  • LOC549139
  • b4gal-t1
  • b4galt1
  • b4galt1.2
  • b4galt2
  • b4galt3
  • b4galt4
  • b4galt5
  • b4galt6
  • beta4gal-t1
  • cdg2d
  • ggtb2
  • gnt-v
  • gt1
  • gtb
  • mgat4a
  • mgat4b
  • mgat4c
  • mgat5
  • siat 8F
  • siat4c
  • siat8c
  • st3gal4
  • st6gal1
  • st8sia2
  • st8sia3
  • st8sia6
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Effects of PIP2 hydrolysis
  • dgka
  • dgkb
  • dgkd
  • dgke
  • dgki
  • dgkq
  • dgkz
  • itpr2
  • itpr3
  • prkcd
  • trpc3
  • trpc6
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Pre-NOTCH Processing in Golgi
  • Xp24b1
  • Xp24beta1
  • furin
  • notch1
  • p24a
  • rnp24
  • tmed2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Platelet homeostasis
  • hsd-pla2
  • p2rx1
  • p2rx4
  • p2rx5
  • pafah2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Sialic acid metabolism
  • 3Gal-VI
  • ST6Gal II
  • ast
  • cmas
  • ctsa
  • glb1
  • glb1l
  • gne
  • hdhd4
  • issd
  • nanp
  • nans
  • neu1
  • neu3
  • neu3.1
  • neu4
  • npl
  • nsd
  • ppgb
  • rgd1306009
  • sial3
  • sialin
  • siasd
  • siat 8F
  • siat10
  • siat4c
  • siat6
  • siat7E
  • siat7f
  • siat8c
  • slc17a5
  • slc35a1
  • sld
  • st3Gal-VI
  • st3gal1
  • st3gal2
  • st3gal2.1
  • st3gal3
  • st3gal4
  • st3gal6
  • st3galii
  • st3galiii
  • st3galvi
  • st3n
  • st6gal1
  • st6gal2
  • st6galnac3
  • st6galnac4
  • st6galnac5
  • st6galnac6
  • st6galnacvi
  • st8sia1
  • st8sia2
  • st8sia3
  • st8sia4
  • st8sia5
  • st8sia6
  • st8siaI
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Cellular hexose transport
  • glut1
  • glut10
  • glut2
  • glut5
  • mfsd4b
  • ped
  • slc2a1
  • slc2a10
  • slc2a11
  • slc2a12
  • slc2a14
  • slc2a15a
  • slc2a2
  • slc2a3
  • slc2a4
  • slc2a5
  • slc2a6
  • slc2a8
  • slc2a9
  • slc30a7
  • slc45a3
  • slc50a1
  • slc5a1
  • slc5a1.1
  • slc5a10
  • slc5a2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Glycolysis
  • Hexokinase
  • LOC100144939
  • LOC100145699
  • LOC549353
  • MGC146985
  • MGC69434
  • MGC76327
  • adpgkl
  • aldb
  • aldo2
  • aldoa
  • aldob
  • aldoc
  • amf
  • bpgm
  • cthbp
  • eno1
  • eno1-a
  • eno1-b
  • eno1l1
  • eno3
  • eno4
  • g3pd
  • gapd
  • gapdh
  • gck
  • glk
  • glucokinase
  • gnpda1
  • gnpda2
  • gnpi
  • gpi
  • gsd13
  • hhf3
  • hk1
  • hk2
  • hk4
  • hkdc1
  • hkiv
  • hxkp
  • mbp-1
  • mgc108129
  • mody2
  • mpb1
  • mse
  • nlk
  • nne
  • oip3
  • pgam1
  • pgam2
  • pgi
  • pgm2l1
  • phi
  • pk3
  • pklr
  • pkm
  • pkm2
  • pph
  • sa-36
  • tcb
  • thbp1
  • tpi
  • tpi1
  • xaldb
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
O-linked glycosylation of mucins
  • GalNAcT10
  • LOC100490508
  • LOC100490678
  • LOC100492379
  • LOC100493218
  • LOC100493232
  • LOC100494225
  • LOC100494334
  • LOC100495967
  • LOC100496630
  • LOC100497191
  • LOC100497665
  • LOC101733668
  • LOC116412004
  • LOC548965
  • LOC549139
  • LOC549416
  • LOC733908
  • MGC147591
  • MGC88924
  • a4gnt
  • b3gnt4
  • b3gnt5
  • b3gnt7
  • b3gnt9
  • b4galt5
  • b4galt6
  • c1galt1
  • c1galt1c1
  • chst4
  • chst5
  • chst6
  • galnt10
  • galnt11
  • galnt12
  • galnt13
  • galnt14
  • galnt15
  • galnt16
  • galnt17
  • galnt18
  • galnt3
  • galnt4
  • galnt5
  • galnt6.1
  • galnt6.3
  • galnt7
  • galnt9
  • galntl1
  • galntl6
  • gcnt1
  • gcnt3
  • gcnt7
  • muc1
  • xGalntl-1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus
  • LOC100216108
  • LOC548926
  • MGC89679
  • RPS27A
  • aif4
  • aip4
  • cep52
  • dtx1
  • dtx2
  • dtx4
  • hmg20
  • hubcep52
  • itch
  • itchy
  • napp1
  • notch1
  • rpl40
  • rps27a
  • uba52
  • ubc
  • ubi-p63e
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
ABC-family proteins mediated transport
  • Erlectin
  • LOC100135090
  • LOC100216108
  • LOC116410223
  • LOC548851
  • LOC548926
  • MGC69308
  • MGC89679
  • RPS27A
  • abc10
  • abc29
  • abc31
  • abca4
  • abcc
  • abcc1
  • abcc10
  • abcc2
  • abcc3
  • abcc5
  • abcr
  • armd2
  • cep52
  • cftr
  • cmoat2
  • cord3
  • derl1
  • derl2
  • derl3
  • erlec1
  • erlin1
  • erlin2
  • ffm
  • gs-x
  • hmg20
  • hubcep52
  • kcnj21
  • mlp2
  • moat-d
  • mrp
  • mrp1
  • mrp3
  • mrp7
  • os9
  • ring5
  • rma1
  • rmp
  • rnf125
  • rnf185
  • rnf5
  • rp19
  • rpl40
  • rps27a
  • simrp7
  • spfh1
  • spfh2
  • stgd
  • stgd1
  • uba52
  • ubc
  • ubi-p63e
  • vcp
  • xrnf185
  • xtp3-b
  • xtp3tpb
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
IRS-related events triggered by IGF1R
  • IGF-II
  • LOC100498409
  • igf-2
  • igf1
  • igf1r
  • igf2
  • igf2-a
  • igf2-b
  • insigf
  • irs1
  • pp9974
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Zinc influx into cells by the SLC39 gene family
  • slc39a1
  • slc39a14
  • slc39a2
  • slc39a3
  • slc39a7
  • slc39a8
  • zip1
  • zip3
  • zirtl
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024