GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Insulin receptor recycling
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6N1B
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • LOC101904667
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
Transferrin endocytosis and recycling
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6N1B
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • HFE
  • LOC101904667
  • MCOLN1
  • STEAP3
  • STEAP4
  • TCIRG1
  • TF
  • TFR2
  • TFRC
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
Ion channel transport
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6N1B
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • LOC101904667
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
ROS and RNS production in phagocytes
  • ATP6A1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6N1B
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • CYBA
  • CYBB
  • HVCN1
  • LOC101904667
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOS1
  • NOS2
  • NOS3
  • RAC2
  • SLC11A1
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
Amino acids regulate mTORC1
  • ATP6A1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6S14
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • BMT2
  • CASTOR1
  • CASTOR2
  • DEPDC5
  • FLCN
  • FNIP1
  • FNIP2
  • GATSL3
  • GBL
  • KICS2
  • KPTN
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LOC101904667
  • LST8
  • MIOS
  • MLST8
  • MTOR
  • NPRL3
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SAMTOR
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEH1L
  • SESN1
  • SESN2
  • SH3BP4
  • SLC38A9
  • SZT2
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
  • WDR24
  • WDR59
Bos taurus (cattle)
Vasopressin-like receptors
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • AVPR2
  • OXT
  • OXTR
Bos taurus (cattle)
Transport of organic anions
  • AVP
  • OATP3A1
  • OATPD
  • SLC16A2
  • SLC21A11
  • SLCO1A2
  • SLCO1B3
  • SLCO1C1
  • SLCO2A1
  • SLCO2B1
  • SLCO3A1
  • SLCO4A1
  • SLCO4C1
Bos taurus (cattle)
Arachidonic acid metabolism
  • AWAT1
  • CPLA2
  • FAAH
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
Bos taurus (cattle)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • AXIN1
  • AXIN2
  • CTNNB1
  • RNF146B
  • RPS27A
  • TNKS
  • TNKS2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP34
  • WNT1
  • WNT3
  • WNT3A
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Degradation of AXIN
  • AXIN1
  • AXIN2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RNF146B
  • RPS27A
  • SMURF2
  • SUG1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • AZIN1
  • NQO1
  • OAZ1
  • OAZ2
  • ODC
  • ODC1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • SUG1
  • TRAP2
Bos taurus (cattle)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0AT2
  • NTT73
  • OCT1
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A13
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
Bos taurus (cattle)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • B2M
  • BOLA
  • BOLA-NC1
  • CALR
  • CANX
  • ERAP1
  • ERAP2
  • GRP78
  • HSPA5
  • PDIA3
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPBP
  • canx
Bos taurus (cattle)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B4GALNT2
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT6
  • FUT7
  • FUT9
  • SIAT10
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Bos taurus (cattle)
O-linked glycosylation of mucins
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT13
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT3
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNTL1
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • LOC789503
  • MUC1
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
Bos taurus (cattle)
N-Glycan antennae elongation
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • GALT
  • GGTB2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • ST3GAL4
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
Bos taurus (cattle)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GALT
  • GGTB2
  • GLUT1
  • SLC2A1
Bos taurus (cattle)
Interleukin-7 signaling
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)
Chromatin modifying enzymes
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • PADI1
  • PADI2
  • PADI3
  • PADI4
  • PADI6
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
Bos taurus (cattle)
Pyroptosis
  • BAK1
  • BAX
  • CASP1
  • CASP13
  • CASP3
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CYC
  • CYCS
  • ELANE
  • GSDMD
  • GSDME
  • GZMB
  • HMG1
  • HMGB1
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • VPS24
Bos taurus (cattle)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • BAMBI
  • MTMR4
  • RPS27A
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF2
  • STRAP
  • STUB1
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CHPF
  • CHPF2
  • CHST11
  • CHST13
  • CHST15
  • CHST3
  • CHST7
  • CHST9
  • CHSY1
  • CHSY3
  • CSGALNACT1
  • CSGALNACT2
  • CSPG2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • NCAN
  • VCAN
Bos taurus (cattle)
Dermatan sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CHST14
  • CSPG2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DSE
  • DSEL
  • NCAN
  • UST
  • VCAN
Bos taurus (cattle)
Apoptotic execution phase
  • BCAP31
  • CASP8
  • DNM1L
  • STK24
Bos taurus (cattle)
Downstream signal transduction
  • BCAR1
  • CRK
  • CRKL
  • GRB2
  • GRB7
  • KRAS
  • MGF
  • NCK1
  • NCK2
  • NRAS
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PTPN11
  • RAPGEF1
  • RASA1
  • SOS1
  • SRC
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STAT6
Bos taurus (cattle)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024