GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
PCP/CE pathway
  • ARHA
  • DAAM1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FZD1
  • FZD3
  • FZD6
  • FZD7
  • PFN1
  • RAC2
  • RAC3
  • RHO12
  • RHOA
  • WNT1
  • WNT11
  • WNT4
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Signaling by PDGF
  • COL4A1
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • FURIN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFC
  • PDGFD
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PLAT
  • PLG
  • PTPN12
  • SPP1
  • THBS1
  • THBS2
  • THBS3
  • THBS4
Bos taurus (cattle)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AGP
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APOA1
  • APOH
  • APOL
  • APP
  • ARMET
  • ARP
  • BRPF3
  • CALM
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8
  • FAM121A
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FERMT3
  • FETUA
  • FIGF
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • ILEI
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • KIND3
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY2
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LOC112442231
  • LOC515333
  • MAGED2
  • MANF
  • MIC27
  • MMRN1
  • NHLRC2
  • OLA1
  • ORM1
  • PAS4
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PI
  • PLEK
  • PLG
  • PLI
  • PPBP
  • PROS
  • PROS1
  • PSAP
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SPP24
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TF
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TLN1
  • TMSB4X
  • TMX3
  • TOR4A
  • TUBA1
  • TUBA4A
  • URP2
  • VCL
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
  • VWF
  • WDR1
  • agp
  • ly6g6f
Bos taurus (cattle)
Regulation of Complement cascade
  • ADIB
  • BF
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C9
  • CD19
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHR5
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • ELANE
  • F2
  • GPR77
  • LOC100336868
  • LOC107131209
  • LOC519737
  • LOC616002
  • SERPING1
  • VTN
Bos taurus (cattle)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPNE6
  • CPNE7
Bos taurus (cattle)
Synthesis of PA
  • ACP6
  • AGPAT1
  • AGPAT2
  • AGPAT3
  • AGPAT4
  • AGPAT5
  • AGPAT6
  • CPLA2
  • DDHD1
  • DDHD2
  • FAM73B
  • GNPAT
  • GPAM
  • GPAT2
  • GPAT3
  • GPAT4
  • GPD1
  • GPD1L
  • GPD2
  • LIPH
  • LOC516378
  • LOC613966
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • MIGA1
  • MIGA2
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2R1
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD6
Bos taurus (cattle)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
RHOD GTPase cycle
  • ACTN1
  • ADD3
  • AKAP12
  • ANKFY1
  • ARHGAP1
  • ARHGAP12
  • ARHGAP17
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CPNE8
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH2
  • DIAPH3
  • EFHD2
  • EMD
  • ESYT1
  • FAM62A
  • FILIP1
  • GOLGA2
  • HINT2
  • LBR
  • LMAN1
  • LMNB1
  • MCAM
  • MOSPD2
  • PAK5
  • PAK6
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLXNA1
  • PLXNB1
  • RACGAP1
  • RBM39
  • RHOD
  • SLC4A7
  • STBD1
  • STEAP3
  • SWS1
  • TOR1AIP1
  • VANGL1
  • VAPB
  • VRK2
Bos taurus (cattle)
Complex I biogenesis
  • ACAD9
  • CI-B14-5A
  • COA1
  • ECSIT
  • GRIM19
  • HRPAP20
  • LOC101906178
  • MGC152111
  • MT-ND3
  • MT-ND4
  • MT-ND6
  • MTND3
  • MTND4
  • MTND6
  • NADH3
  • NADH4
  • NADH6
  • ND1
  • ND2
  • ND3
  • ND4
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA1
  • NDUFA10
  • NDUFA11
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFA3
  • NDUFA5
  • NDUFA6
  • NDUFA7
  • NDUFA8
  • NDUFA9
  • NDUFAB1
  • NDUFAF1
  • NDUFAF2
  • NDUFAF3
  • NDUFAF4
  • NDUFAF5
  • NDUFAF6
  • NDUFAF7
  • NDUFB1
  • NDUFB10
  • NDUFB11
  • NDUFB2
  • NDUFB3
  • NDUFB5
  • NDUFB6
  • NDUFB7
  • NDUFB8
  • NDUFB9
  • NDUFC1
  • NDUFC2
  • NDUFS1
  • NDUFS2
  • NDUFS3
  • NDUFS4
  • NDUFS5
  • NDUFS6
  • NDUFS7
  • NDUFS8
  • NDUFV1
  • NDUFV2
  • NUBPL
  • TIMMDC1
  • TMEM126B
  • TMEM186
  • UQOR22
Bos taurus (cattle)
FCGR activation
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • FGR
  • FYN
  • LYN
  • SRC
  • SYK
  • YES1
Bos taurus (cattle)
PI-3K cascade:FGFR3
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • FRS2
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • HBGF-1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Bos taurus (cattle)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • FGF12
  • FGF13
  • FGF14
  • RANGRF
  • SCN11A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN8A
  • SCN9A
Bos taurus (cattle)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • CALM
  • INPP5B
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKB
  • ITPKC
  • OCRL
  • PLCB1
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCZ
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PTEN
Bos taurus (cattle)
MyD88-independent TLR4 cascade
  • CD14
  • LY96
  • MD-2
  • SARM1
  • TICAM2
  • TLR4
  • TRAM
Bos taurus (cattle)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • CASP3
  • CDH1
  • CTNNB1
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSP
  • OCLN
  • PKP1
  • TJP1
  • TJP2
Bos taurus (cattle)
Signaling by ERBB4
  • BTC
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
Bos taurus (cattle)
Acyl chain remodelling of PI
  • CPLA2
  • LENG4
  • LOC613966
  • MBOAT7
  • OACT7
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2R1
  • PLBD1
Bos taurus (cattle)
Scavenging of heme from plasma
  • ALB
  • CD163
  • HBA
  • HBB
  • HPX
  • LRP1
  • M130
Bos taurus (cattle)
Dopamine receptors
  • D1AR
  • DRD1
  • DRD2
  • DRD3
  • DRD5
Bos taurus (cattle)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • LGR5
  • LRP5
  • LRP6
  • RNF43
  • RPS27A
  • RSPO1
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RSPO4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP8
  • WNT3A
Bos taurus (cattle)
HS-GAG biosynthesis
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • HS2ST1
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B1
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST4
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC4
  • SLC35D2
Bos taurus (cattle)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • CNPY3
  • CTSB
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSS
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • LGMN
  • TLR3
  • TLR7
  • TLR9
  • TRA1
  • UNC93B1
Bos taurus (cattle)
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • SNX3
  • TMED5
  • VPS26A
  • VPS29
  • VPS35
  • WLS
  • WNT1
  • WNT10A
  • WNT10B
  • WNT11
  • WNT16
  • WNT2
  • WNT2B
  • WNT3
  • WNT3A
  • WNT4
  • WNT5A
  • WNT6
  • WNT7A
  • WNT7B
  • WNT8A
  • WNT8B
  • WNT9B
Bos taurus (cattle)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CES1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100139881
  • LOC509956
  • LOC540321
  • LOC617313
  • MME
  • REN
  • SERPINA8
Bos taurus (cattle)
Interleukin-7 signaling
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • MGF
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024