GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 251 - 275 of 557 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Mitochondrial protein import
  • AAC1
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT3
  • ATP5F1B
  • ATP5G1
  • ATP5G3
  • ATP5MC1
  • ATP5MC3
  • COQ2
  • FRDA
  • FXN
  • HSCB
  • HSPD1
  • LDHD
  • NDUFB8
  • OTC
  • PITRM1
  • SLC25A4
  • SLC25A6
  • TAFAZZIN
  • TAZ
  • TIM10
  • TIM22
  • TIM23
  • TIMM10
  • TIMM17A
  • TIMM17B
  • TIMM22
  • TIMM23
  • TIMM9
Bos taurus (cattle)
Mitochondrial protein degradation
  • AAC3
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • ACOT2
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • ANT2
  • ANT3
  • APP
  • ARG2
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5H
  • ATP5J
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH
  • BDH1
  • C26H10ORF2
  • CLPP
  • COX1
  • COX5A
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • EMRE
  • FECH
  • FH
  • GLUD1
  • GRIM19
  • HADH2
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL12
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MTATP6
  • NADK2
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • NDUFV1
  • OGDH
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • PRKACA
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
  • UQCRQ
Bos taurus (cattle)
Miscellaneous transport and binding events
  • ADD1
  • ADD2
  • ADD3
  • ANKH
  • AZGP1
  • CTNS
  • DMT
  • DMTN
  • EPB49
  • LLRC8A
  • LOC104972276
  • LRRC8A
  • LRRC8B
  • LRRC8C
  • LRRC8D
  • LRRC8E
  • MAGT1
  • MRS2
  • NIPA1
  • NIPA2
  • NIPAL1
  • NIPAL2
  • NIPAL3
  • NIPAL4
  • PIP
  • SLC66A1
  • TUSC3
Bos taurus (cattle)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • CGA
  • CYP11B1
  • CYP21
  • CYP21A1
  • CYP21A2
  • HSD3B
  • LHB
Bos taurus (cattle)
Metal sequestration by antimicrobial proteins
  • CAAF2
  • LCN2
  • LOC786350
  • LTF
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
Bos taurus (cattle)
Metal ion SLC transporters
  • CP
  • HEPH
  • SLC11A1
  • SLC11A2
  • SLC30A10
  • SLC40A1
  • SLC41A1
  • SLC41A2
Bos taurus (cattle)
Metabolism of steroid hormones
  • STS
Bos taurus (cattle)
Metabolism of polyamines
  • AMD1
  • ODC
  • ODC1
  • SMS
  • SRM
Bos taurus (cattle)
Metabolism of folate and pterines
  • ALDH1L1
  • ALDH1L2
  • DHFR
  • FOLR2
  • FPGS
  • HCP1
  • MTHFD1
  • MTHFD1L
  • MTHFD2
  • MTHFD2L
  • MTHFR
  • MTHFS
  • PCFT
  • SHMT1
  • SHMT2
  • SLC19A1
  • SLC25A32
  • SLC46A1
Bos taurus (cattle)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CES1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100139881
  • LOC509956
  • LOC540321
  • LOC617313
  • MME
  • REN
  • SERPINA8
Bos taurus (cattle)
Maturation of TCA enzymes and regulation of TCA cycle
  • ACAT1
  • ACN9
  • ACO2
  • CS
  • CSKMT
  • CYB560
  • FRDA
  • FXN
  • HBLD1
  • HBLD2
  • IDH2
  • ISCA1
  • ISCA2
  • ISCU
  • ISD11
  • LYRM4
  • LYRM8
  • NFS1
  • PGL2
  • SDH5
  • SDHA
  • SDHAF1
  • SDHAF2
  • SDHAF3
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SIRT3
Bos taurus (cattle)
Malate-aspartate shuttle
  • GC1
  • GOT1
  • GOT2
  • MDH1
  • MDH2
  • SLC20A4
  • SLC25A11
  • SLC25A12
  • SLC25A22
Bos taurus (cattle)
Macroautophagy
  • AMBRA1
  • APG4B
  • ATG10
  • ATG101
  • ATG12
  • ATG13
  • ATG14
  • ATG16L1
  • ATG3
  • ATG4A
  • ATG4B
  • ATG4C
  • ATG4D
  • ATG5
  • ATG7
  • ATG9
  • ATG9A
  • ATG9B
  • AUT2B
  • BECN1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • DNCL1
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GABARAP
  • GABARAPL1
  • GABARAPL2
  • GBL
  • GEF2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LST8
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3A
  • MAP1LC3B
  • MAP1LC3C
  • MGC138057
  • MLST8
  • MTMR14
  • MTOR
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RB1CC1
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • TSC1
  • ULK1
  • UVRAG
  • VPS24
  • WDR45
  • WDR45B
  • WIPI1
  • WIPI2
Bos taurus (cattle)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP10
  • BLA-DQB
  • BOLA-DMA
  • BOLA-DMB
  • BOLA-DOA
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DOB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CANX
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DMB
  • DNCL1
  • DNM1
  • DNM3
  • DYB
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DMB
  • HLA-DRA
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF2B
  • KIF3A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100848815
  • OSBPL1A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
  • canx
Bos taurus (cattle)
MET activates PTK2 signaling
  • HGF
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGB1
  • LAMA4
  • MEGF6
  • MET
  • PTK2
  • SRC
Bos taurus (cattle)
MAPK6/MAPK4 signaling
  • BORG1
  • CCND3
  • CDC14A
  • CDC14B
  • CDC2
  • CDC42
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP5
  • CDK1
  • CDKN1
  • CEP2
  • DNAJB1
  • ETV4
  • FOXO1
  • FOXO3
  • HSP27
  • HSPB1
  • MAPK4
  • MAPK6
  • MAPKAPK5
  • NCOA3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SEPTIN7
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XPO1
Bos taurus (cattle)
MAPK3 (ERK1) activation
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • IL6
  • IL6R
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • MAP2K1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
MAPK1 (ERK2) activation
  • ERK2
  • IL6
  • IL6R
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • PRKM1
  • PTPN11
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • EDG1
  • GPR92
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR5
Bos taurus (cattle)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • AP4S1
  • APP
  • ARF1
  • ARRB1
  • BLOC1S1
  • CHMP2A
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTLB
  • CLVS1
  • CLVS2
  • CTSZ
  • DNASE2
  • GNS
  • HGS
  • M6PR
  • SH3GL2
  • SYB2
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
Bos taurus (cattle)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • LOC528518
  • MAN2B1
  • MAN2C1
  • MANB
  • MANBA
Bos taurus (cattle)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B4GALNT2
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT6
  • FUT7
  • FUT9
  • SIAT10
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Bos taurus (cattle)
Leukotriene receptors
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • GPR17
  • LTB4R
  • LTB4R2
Bos taurus (cattle)
Lectin pathway of complement activation
  • COLEC10
  • COLEC11
  • FCN2
  • MASP1
  • MASP2
  • MBL
Bos taurus (cattle)
Laminin interactions
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGB1
  • ITGB4
  • LAMA4
  • MEGF6
  • NID1
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024