GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • EDG1
  • GPR92
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR5
Bos taurus (cattle)
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX)
  • AKR1C4
  • CBR1
  • CYP8
  • HPGDS
  • LOC506594
  • LOC538060
  • LOC782061
  • LOC782884
  • LOC785762
  • PTGDS
  • PTGES
  • PTGES2
  • PTGES3
  • PTGIS
  • PTGS1
  • PTGS2
  • TBXAS1
Bos taurus (cattle)
Adenosine P1 receptors
  • ADORA1
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADORA3
Bos taurus (cattle)
Digestion of dietary lipid
  • CEL
  • CLPS
  • LIPF
  • PNLIP
  • PNLIPRP2
  • PNLIPRP3
Bos taurus (cattle)
EPH-Ephrin signaling
  • EFNA1
  • EFNA2
  • EFNA3
  • EFNA4
  • EFNA5
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • EPHA1
  • EPHA10
  • EPHA2
  • EPHA3
  • EPHA4
  • EPHA5
  • EPHA7
  • EPHB1
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
Bos taurus (cattle)
Estrogen-dependent gene expression
  • CBFB
  • CCNT1
  • CDK9
  • CITED1
  • CREBBP
  • EP300
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • FKBP4
  • FOXA1
  • GATA3
  • GREB1
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • H2AC12
  • H2AC18
  • H2AC21
  • H2AC6
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AZ2
  • H2B
  • H2BC26
  • H2BC5
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3F3A
  • H3F3B
  • HDAC1
  • HIST1H2BI
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KAT2B
  • KAT5
  • KDM1A
  • KDM4B
  • LOC528006
  • MED1
  • MSG1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA3
  • NR3A1
  • NR5A2
  • NRIP1
  • PGR
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2K
  • POLR2L
  • PRMT1
  • PTGES3
  • RUNX1
  • SP1
  • TBP
  • TLE3
  • USF1
  • USF2
  • YY1
  • ZNF217
Bos taurus (cattle)
RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription
  • CBFB
  • ESR
  • ESR1
  • NR3A1
  • RUNX1
Bos taurus (cattle)
ABC-family proteins mediated transport
  • ABCA4
  • ABCB1
  • ABCB4
  • ABCB9
  • ABCC1
  • ABCC10
  • ABCC11
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC5
  • ABCC9
  • ABCF1
  • ABCR
  • CFTR
  • DERL1
  • DERL2
  • DERL3
  • EIF2A
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • ERLEC1
  • ERLIN1
  • ERLIN2
  • KCNJ11
  • LOC515333
  • MRP1
  • OS9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RNF185
  • RNF5
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SPFH2
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
Bos taurus (cattle)
SHC-mediated cascade:FGFR3
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HBGF-1
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
SHC-related events triggered by IGF1R
  • GRB2
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
  • SHC1
  • SOS1
Bos taurus (cattle)
RAC2 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABR
  • ANKLE2
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP42
  • ARHGDIA
  • ARMCX3
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BORG5
  • BRK1
  • C22H3ORF10
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • FAM62A
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • HSPC321
  • IQGAP1
  • ITGB1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MPP7
  • MTX1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1L
  • NHS
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PGRMC2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PLD2
  • PREX1
  • RAC2
  • RACGAP1
  • RBM39
  • SAMM50
  • SLITRK5
  • STBD1
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TAOK3
  • TFRC
  • TRIO
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • VRK2
  • WASF2
Bos taurus (cattle)
CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDC6
  • CDK2
  • CDKN2
  • FZR1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
Glutathione synthesis and recycling
  • CHAC1
  • CHAC2
  • CNDP2
  • GCLC
  • GCLM
  • GGCT
  • GGT1
  • GGT5
  • GGT7
  • GGTL3
  • GSS
Bos taurus (cattle)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucose-dependent Insulinotropic Polypeptide (GIP)
  • CD26
  • DPP4
  • GIP
  • GPR119
Bos taurus (cattle)
WNT mediated activation of DVL
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK1E
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • PIP5K1B
Bos taurus (cattle)
Asparagine N-linked glycosylation
  • ASGR1
  • ASGR2
  • B4GALNT2
  • UMOD
Bos taurus (cattle)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Bos taurus (cattle)
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production
  • CREBBP
  • CTNNB1
  • EP300
  • IRF3
Bos taurus (cattle)
Regulation of IFNA/IFNB signaling
  • IF1AG1
  • IF1AG8
  • IFNAC
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNAR2
  • JAK1
  • LOC100335490
  • LOC523244
  • LOC618947
  • LOC783912
  • PTPN1
  • PTPN11
  • PTPN6
  • STAT1
  • STAT2
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • AKT2
  • APC
  • CBY
  • CBY1
  • CHD8
  • CTBP1
  • CTNNB1
  • CTNNBIP1
  • HDAC1
  • LEF1
  • PGEA1
  • RPS27A
  • SOX13
  • SOX17
  • SOX3
  • SOX4
  • SOX6
  • SOX7
  • SOX9
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XIAP
  • XPO1
  • YWHAZ
Bos taurus (cattle)
Hedgehog ligand biogenesis
  • DERL2
  • DHH
  • ERLEC1
  • HHAT
  • IHH
  • OS9
  • P4HB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SHH
  • SUG1
  • SYVN1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
Bos taurus (cattle)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B4GALNT2
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT6
  • FUT7
  • FUT9
  • SIAT10
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Bos taurus (cattle)
RAC1 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABR
  • ALS2
  • AMIGO2
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP12
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP25
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP42
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF15
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF39
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ASCT2
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BORG5
  • BRK1
  • C22H3ORF10
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CHN1
  • CHN2
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DOCK5
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • EMD
  • EPHA2
  • ERP27
  • ESYT1
  • FAM13A
  • FAM13B
  • FAM62A
  • FARP1
  • FARP2
  • FERMT2
  • FGD5
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • HSPC321
  • IQGAP1
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITGB1
  • JAG1
  • KTN1
  • L2HGDH
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MCAM
  • MCF2L
  • MPP7
  • MYO9B
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1L
  • NGEF
  • NHS
  • NISCH
  • NOX1
  • NOX3
  • NOXO1
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKN
  • PKN1
  • PKN2
  • PLD1
  • PLD2
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PLEKHG6
  • PREX1
  • PREX2
  • PRK1
  • PRKCL1
  • RACGAP1
  • RALBP1
  • RASGRF2
  • RBM39
  • SH3BP1
  • SLC1A5
  • SNAP23
  • SOS1
  • SOS2
  • SPATA13
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • SWAP70
  • SYDE2
  • TAGAP
  • TAOK3
  • TFRC
  • TIAM2
  • TRIO
  • VANGL1
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • VRK2
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • YKT6
Bos taurus (cattle)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • LOC528518
  • MAN2B1
  • MAN2C1
  • MANB
  • MANBA
Bos taurus (cattle)
Activated NTRK3 signals through PLCG1
  • NTF3
  • NTRK3
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024