GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DYB
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100848815
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • TRAV29-1
Bos taurus (cattle)
RND1 GTPase cycle
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSP
  • DST
  • EPHA2
  • EPSTI1
  • FAM135A
  • FAM83B
  • FLOT2
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB7
  • KIDINS220
  • KIF14
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PLXNA1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBM39
  • RBMX
  • RHO6
  • RND1
  • STIP1
  • STMN2
  • TFRC
  • TMEM59
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Bos taurus (cattle)
PKMTs methylate histone lysines
  • AEBP2
  • ASH1L
  • ASH2L
  • ATF7IP
  • DOT1L
  • EED
  • EHMT1
  • EZH2
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT5A
  • KMT5B
  • KMT5C
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NSD1
  • NSD2
  • NSD3
  • PRDM16
  • PRDM7
  • RBBP4
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RELA
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SETD3
  • SETD6
  • SETD7
  • SETD8
  • SETDB1
  • SETDB2
  • SMYD2
  • SMYD3
  • SUV39H1
  • SUV39H2
  • SUZ12
  • WDR5
Bos taurus (cattle)
Opioid Signalling
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Bos taurus (cattle)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0AT2
  • NTT73
  • OCT1
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A13
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
Bos taurus (cattle)
G-protein activation
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Bos taurus (cattle)
Hormone ligand-binding receptors
  • CGA
  • FSHB
  • FSHR
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GPA2
  • GPB5
  • GPHA2
  • GPHB5
  • LHB
  • LHCGR
  • TSHB
  • TSHR
Bos taurus (cattle)
TP53 Regulates Metabolic Genes
  • COII
  • COX1
  • COX11
  • COX14
  • COX16
  • COX18
  • COX19
  • COX2
  • COX20
  • COX3
  • COX4
  • COX4I1
  • COX5A
  • COX6A1
  • COX6C
  • COX7A2L
  • COX7B
  • COX7C
  • COX7CP1
  • COXII
  • CYC
  • CYCS
  • DDIT4
  • G6PD
  • GBL
  • GLS
  • GLS2
  • GPI
  • GSR
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LOC100296227
  • LOC783202
  • LRPPRC
  • LST8
  • MLST8
  • MT-CO2
  • MTCO2
  • MTOR
  • NDUFA4
  • PRDX1
  • PRDX2
  • PRDX5
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SCO1
  • SCO2
  • SCOD1
  • SESN1
  • SESN2
  • SESN3
  • SFN
  • SLC38A9
  • SURF1
  • TACO1
  • TIGAR
  • TSC1
  • TXN
  • TXNRD1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Bos taurus (cattle)
RET signaling
  • ARTN
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK6
  • FRS2
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB10
  • GRB2
  • GRB7
  • IRS2
  • MAPK7
  • NRTN
  • PDLIM7
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PLCG1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PTPN11
  • RAP1GAP
  • RET
  • SHANK3
  • SHC1
  • SHC3
  • SOS1
  • SRC
Bos taurus (cattle)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP10
  • BLA-DQB
  • BOLA-DMA
  • BOLA-DMB
  • BOLA-DOA
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DOB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CANX
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DMB
  • DNCL1
  • DNM1
  • DNM3
  • DYB
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DMB
  • HLA-DRA
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF2B
  • KIF3A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100848815
  • OSBPL1A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
  • canx
Bos taurus (cattle)
Acyl chain remodelling of PG
  • CPLA2
  • CRLS1
  • LOC613966
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • LPGAT1
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2G4F
  • PLA2R1
Bos taurus (cattle)
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • FRAT2
  • GSK3B
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
Bos taurus (cattle)
FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis
  • AIK
  • AIRK1
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AYK1
  • BTAK
  • CUL1
  • FBXL18
  • FBXL7
  • IAK1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • STK15
  • STK6
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission
  • GLRA1
  • GLRA2
  • GLRA3
  • GLRB
  • HTR3A
  • HTR3B
  • LOC616094
Bos taurus (cattle)
LGI-ADAM interactions
  • ADAM22
  • ADAM23
  • CACNG2
  • CACNG3
  • CACNG4
  • CACNG8
  • DLG4
  • LGI1
  • LGI2
  • LGI3
  • LGI4
  • STX1A
  • STX1B
  • STX1B2
Bos taurus (cattle)
G alpha (z) signalling events
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS20
Bos taurus (cattle)
LDL clearance
  • AADACL1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • NCEH1
  • NPC2
  • SOAT1
  • SOAT2
Bos taurus (cattle)
Organic cation transport
  • OCT1
  • RUNX1
  • SLC22A1
  • SLC22A15
  • SLC22A16
  • SLC22A18
  • SLC22A2
  • SLC22A3
  • SLC22A4
  • SLC22A5
Bos taurus (cattle)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ACY1
  • CNDP2
  • GGT1
  • GGT5
  • GGT7
  • GGTL3
  • GSTM4
  • GSTP1
  • GSTT1
  • LOC100138004
  • LOC100138908
  • LOC100296421
  • LOC100300896
  • LOC515333
  • MRP1
  • NAT1
  • STP
  • SULT1A1
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT2B10
Bos taurus (cattle)
Hedgehog 'on' state
  • CDC73
  • CUL3
  • DZIP1
  • EVC
  • EVC2
  • GLI1
  • GLI2
  • GLI3
  • GPR161
  • ITCH
  • KIF7
  • NUMB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTCH1
  • RPS27A
  • SMO
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SPOP
  • SPOPL
  • SUFU
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ULK3
Bos taurus (cattle)
HSF1 activation
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EF1A
  • HDAC6
  • HSF1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • PTGES3
  • VCP
  • YWHAE
Bos taurus (cattle)
Degradation of DVL
  • CUL3
  • DACT1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • HECW1
  • KLHL12
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Transferrin endocytosis and recycling
  • ATP6A1
  • ATP6AP1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6IP1
  • ATP6N1B
  • ATP6S1
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • HFE
  • LOC101904667
  • MCOLN1
  • STEAP3
  • STEAP4
  • TCIRG1
  • TF
  • TFR2
  • TFRC
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
Bos taurus (cattle)
Amino acids regulate mTORC1
  • ATP6A1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6H
  • ATP6S14
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • BMT2
  • CASTOR1
  • CASTOR2
  • DEPDC5
  • FLCN
  • FNIP1
  • FNIP2
  • GATSL3
  • GBL
  • KICS2
  • KPTN
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LOC101904667
  • LST8
  • MIOS
  • MLST8
  • MTOR
  • NPRL3
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SAMTOR
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEH1L
  • SESN1
  • SESN2
  • SH3BP4
  • SLC38A9
  • SZT2
  • TCIRG1
  • VATC
  • VATF
  • VPATPD
  • WDR24
  • WDR59
Bos taurus (cattle)
FGFR2b ligand binding and activation
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF3
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF7
  • FGFA
  • FGFBP
  • FGFBP1
  • FGFR2
  • HBGF-1
Bos taurus (cattle)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024