GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Asparagine N-linked glycosylation
  • ASGR1
  • ASGR2
  • B4GALNT2
  • UMOD
Canis familiaris (dog)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
  • arsb
  • ids
Canis familiaris (dog)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • arsb
Canis familiaris (dog)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • arsb
Canis familiaris (dog)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • CRKL
  • GAB1
  • GGA3
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAB4A
  • RAB4B
Canis familiaris (dog)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • ASAP1
  • CNGA2
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • MEL
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8
  • RAB8A
  • RHO
Canis familiaris (dog)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • MIA2
  • PREB
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • STX5
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
Canis familiaris (dog)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • AREG
  • BTC
  • CAV
  • CAV-2
  • CAV1
  • CAV2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • ESR1
  • ESR2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • HBEGF
  • IGF1R
  • LOC100856339
  • LOC119863873
  • MMP2
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRMT1
  • PTK2
  • S1PR3
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • ZDHHC21
  • ZDHHC7
Canis familiaris (dog)
Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide
  • AQP1
  • CA1
  • CA2
  • CA4
  • GLNA2
  • GLNA3
  • HBQ1
  • LOC609402
  • RHAG
  • SLC4A1
Canis familiaris (dog)
Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen
  • AQP1
  • CA1
  • CA2
  • CA4
  • CYB5R1
  • CYB5R2
  • CYB5R4
  • CYB5RL
  • GLNA2
  • GLNA3
  • HBQ1
  • LOC609402
  • RHAG
  • SLC4A1
Canis familiaris (dog)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • LOC119863873
  • MYO5B
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Canis familiaris (dog)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP0
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
  • MIP
Canis familiaris (dog)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • APOB
  • B9D2
  • CD177
  • CD2
  • CD244
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CEACAM20
  • CXADR
  • EPCAM
  • ESAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GP6
  • GPC1
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGAD
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM3
  • JAML
  • JCHAIN
  • LOC119867047
  • LOC119868972
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PROC
  • PROCR
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC3
  • SDC4
  • SELE
  • SELL
  • SELP
  • SELPLG
  • SIRPA
  • SPN
  • THBD
  • TREM1
Canis familiaris (dog)
Scavenging by Class A Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • APOE
  • CALR
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • MARCO
  • MSR1
  • SCGB3A2
  • TRA1
Canis familiaris (dog)
GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins
  • APBB1IP
  • F8VWF
  • FN1
  • GRB2
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • PTK2
  • RAP1A
  • RAP1B
  • SOS1
  • SRC
  • TLN1
  • VWF
Canis familiaris (dog)
Integrin signaling
  • APBB1IP
  • CSK
  • F8VWF
  • FN1
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • PDPK1
  • PTK2
  • PTPN1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • RASGRP1
  • RASGRP2
  • SHC1
  • SRC
  • SYK
  • TLN1
  • VWF
Canis familiaris (dog)
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins
  • APBB1IP
  • BCAR1
  • CRK
  • F8VWF
  • FN1
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • PTK2
  • RAP1A
  • RAP1B
  • SRC
  • TLN1
  • VWF
Canis familiaris (dog)
MAP2K and MAPK activation
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • F8VWF
  • FN1
  • HRAS
  • IL17RD
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • KRAS
  • KSR1
  • KSR2
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK2
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP1
  • RAF1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • SRC
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • WDR83
Canis familiaris (dog)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ANOS1
  • FGF1
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • GIPC1
  • TGFBR3
Canis familiaris (dog)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ANOS1
  • CBL
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS2
  • GRB2
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
Canis familiaris (dog)
Stimuli-sensing channels
  • ANO1
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO7
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC3
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • BSND
  • CALM2
  • CLCA1
  • CLCA2
  • CLCA4
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN4
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNK
  • CLCNKA
  • CLIC2
  • LOC119880472
  • NALCN
  • NEDD4L
  • OSTM1
  • RAF1
  • RPS27A
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SGK1
  • SGK3
  • SLC17A2
  • SLC9B1
  • SLC9B2
  • SLC9C2
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TRDN
  • TTYH1
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UNC79
  • UNC80
  • WWP1
Canis familiaris (dog)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • BET1
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22A
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • STX17
  • STX5
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • YKT6
Canis familiaris (dog)
Tie2 Signaling
  • ANGPT1
  • ANGPT2
  • ANGPT4
  • DOK2
  • GRB14
  • GRB2
  • GRB7
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • SHC1
  • SOS1
  • TEK
Canis familiaris (dog)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • DERL1
  • ENGASE
  • NGLY1
  • PSMC1
  • RAD23B
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UBXN1
  • VCP
Canis familiaris (dog)
Macroautophagy
  • AMBRA1
  • ATG10
  • ATG101
  • ATG12
  • ATG13
  • ATG14
  • ATG16L1
  • ATG3
  • ATG4A
  • ATG4B
  • ATG4C
  • ATG4D
  • ATG5
  • ATG7
  • ATG9A
  • ATG9B
  • BECN1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP7
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GABARAP
  • GABARAPL2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MAP1LC3C
  • MLST8
  • MTMR14
  • MTMR3
  • MTOR
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • RB1CC1
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • TSC1
  • TSC2
  • ULK1
  • UVRAG
  • WDR45
  • WDR45B
  • WIPI1
  • WIPI2
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024