GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Synthesis of bile acids and bile salts
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • OSBP
  • OSBPL1A
  • OSBPL2
  • OSBPL3
  • OSBPL6
  • OSBPL7
  • OSBPL9
  • RXRA
Canis familiaris (dog)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
Canis familiaris (dog)
Integrin signaling
  • APBB1IP
  • CSK
  • F8VWF
  • FN1
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • PDPK1
  • PTK2
  • PTPN1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • RASGRP1
  • RASGRP2
  • SHC1
  • SRC
  • SYK
  • TLN1
  • VWF
Canis familiaris (dog)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ALB
  • Abcg2
  • BLVRA
  • FABP1
  • HMOX1
  • HMOX2
  • LOC474938
  • MRP1
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
Canis familiaris (dog)
Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation
  • ACTN2
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GRIA1
  • GRIA2
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • LRRC7
  • NEFL
  • NMDAR1
Canis familiaris (dog)
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • CBLIF
  • CTRB
  • CTRB1
  • GIF
  • LMBRD1
  • LOC119869278
  • PRSS2
  • TCN1
Canis familiaris (dog)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Canis familiaris (dog)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • DHRS3
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RLBP1
Canis familiaris (dog)
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • CLCF1
  • CNTFR
  • CRLF1
  • CTF1
  • IL-31
  • IL11
  • IL11RA
  • IL31
  • IL31RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • LIF
  • LIFR
  • OSM
  • OSMR
  • TYK2
Canis familiaris (dog)
Neutrophil degranulation
  • 607076
  • A1BG
  • ABCA13
  • ACAA1
  • ACLY
  • ACP3
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ACTR2
  • ADAM10
  • ADAM8
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGL
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANPEP
  • ANX2
  • ANXA2
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ATAD3A
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP6V1D
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • BST2
  • C12H6orf120
  • C1orf35
  • C3
  • C3AR1
  • C5AR1
  • C5BR
  • CAB39
  • CALML5
  • CAMP
  • CAND1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CAT
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CD93
  • CDA
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEACAM20
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHRNB4
  • CI-MPR/IGF2R
  • CKAP4
  • CLEC4D
  • CLEC5A
  • CMTM6
  • CNN2
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISPLD2
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSNK2B
  • CSTB
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSG
  • CTSH
  • CTSS
  • CTSZ
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • DDOST
  • DDX3X
  • DEGS1
  • DERA
  • DGAT1
  • DIA1
  • DIAPH1
  • DLA-12
  • DLA-79
  • DLA88
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1H1
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • DYNLT1
  • EEF1A1
  • EEF2
  • ELA2
  • ELANE
  • ENPP4
  • EPX
  • ERP44
  • FAF2
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FCN2
  • FGL2
  • FGR
  • FPR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLNA2
  • GLNA3
  • GM2A
  • GMFG
  • GNS
  • GOLGA7
  • GPI
  • GPR84
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GSTP1
  • GUSB
  • GYG1
  • HEBP2
  • HEXB
  • HGSNAT
  • HK3
  • HMGB1
  • HMOX2
  • HPSE
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1
  • HUWE1
  • HVCN1
  • Hsp70
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAD
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB2
  • JUP
  • KCMF1
  • KCNAB2
  • KPNB1
  • LAIR1
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LCN2
  • LGALS3
  • LOC100685620
  • LOC100686511
  • LOC102152131
  • LOC102155828
  • LOC102155967
  • LOC119865338
  • LOC119868972
  • LOC119876012
  • LOC119876868
  • LOC119881359
  • LOC119881386
  • LOC476396
  • LOC476816
  • LOC478984
  • LOC484306
  • LOC484309
  • LOC484314
  • LOC484343
  • LOC490269
  • LOC607182
  • LOC607874
  • LOC609402
  • LOC609800
  • LOC611446
  • LPCAT1
  • LRG1
  • LRRC7
  • LTA4H
  • LTF
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MGAM
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MNDA
  • MOSPD2
  • MPO
  • MVP
  • NAPRT
  • NBEAL2
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NM23B
  • NME2
  • NRAS
  • Nox2
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORMDL3
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PA2G4
  • PADI2
  • PAFAH1B2
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC1
  • PIGR
  • PKP1
  • PLAC8B
  • PLAU
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PNP
  • PPBP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRG3
  • PRKCD
  • PRSS2
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPN6
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QPCT
  • QSOX1
  • RAB10
  • RAB18
  • RAB24
  • RAB27A
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB3D
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAB9B
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAP2B
  • RAP2C
  • RETN
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASET2
  • ROCK1
  • S100A12
  • S100A9
  • S100P
  • SCAMP1
  • SDCBP
  • SELL
  • SERPINA1
  • SERPINA3
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SERPINB6
  • SIGLEC11
  • SIRPA
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SLPI
  • SNAP23
  • SNAP25
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • SRP14
  • STBD1
  • STK10
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TBC1D10C
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMC6
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TMEM63A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRAPPC1
  • TRPM2
  • TSPAN14
  • TTR
  • TUBB
  • TUBB4B
  • TXNDC5
  • TYROBP
  • UBR4
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VCP
  • VNN1
  • VPS35L
  • XRCC5
  • XRCC6
  • YPEL
  • YPEL5
  • arsb
  • ckpi
Canis familiaris (dog)
Hydrolysis of LPC
  • LYPLA3
  • PLA2G15
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLBD1
Canis familiaris (dog)
GDP-fucose biosynthesis
  • FCSK
  • FPGT
  • FUOM
  • GFUS
  • GMDS
  • SLC35C1
Canis familiaris (dog)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ANOS1
  • FGF1
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • GIPC1
  • TGFBR3
Canis familiaris (dog)
Relaxin receptors
  • INSL3
  • LGR8
  • RLF
  • RLN2
  • RLN3
  • RXFP1
  • RXFP2
  • RXFP3
Canis familiaris (dog)
Tachykinin receptors bind tachykinins
  • LOC116183080
  • TAC1
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
Canis familiaris (dog)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • CACNA1A
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA1E
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • KCNJ11
  • PRKACA
  • PRKACB
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
Canis familiaris (dog)
PI-3K cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB2
  • KL
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Canis familiaris (dog)
Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen
  • AQP1
  • CA1
  • CA2
  • CA4
  • CYB5R1
  • CYB5R2
  • CYB5R4
  • CYB5RL
  • GLNA2
  • GLNA3
  • HBQ1
  • LOC609402
  • RHAG
  • SLC4A1
Canis familiaris (dog)
Amine ligand-binding receptors
  • GPR143
Canis familiaris (dog)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP0
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
  • MIP
Canis familiaris (dog)
Generation of second messenger molecules
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DQB2
  • ITK
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLCG1
  • PLCG2
  • TRAV29DV5
  • ZAP70
Canis familiaris (dog)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • SLC16A10
  • SLC1A4
  • SLC1A5
  • SLC25A29
  • SLC36A1
  • SLC36A3
  • SLC36A4
  • SLC38A1
  • SLC38A2
  • SLC38A3
  • SLC38A4
  • SLC38A5
  • SLC3A1
  • SLC3A2
  • SLC43A1
  • SLC43A2
  • SLC6A12
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A20
  • SLC6A6
  • SLC7A1
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A2
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SNX12
Canis familiaris (dog)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CHPF
  • CHPF2
  • CHST11
  • CHST12
  • CHST13
  • CHST3
  • CHST7
  • CHST9
  • CHSY1
  • CHSY3
  • CSGALNACT1
  • CSGALNACT2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • NCAN
  • VCAN
Canis familiaris (dog)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • BTC
  • CALM2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FRS3
  • FYN
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • HBEGF
  • HGF
  • HRAS
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL3
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KGF
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • LRRC7
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MGF
  • NCAM1
  • NEFL
  • NMDAR1
  • NRAPGEP
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDZGEF1
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PSPN
  • PTK2
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RAPGEF2
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP3
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN5
  • TEK
  • TGFA
Canis familiaris (dog)
Hormone ligand-binding receptors
  • CGA
  • FSHB
  • FSHR
  • GNRH1
  • GNRHR
  • GPA1
  • GPB5
  • GPHA2
  • GPHB5
  • TSHB
  • TSHR
Canis familiaris (dog)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024