GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Calcitonin-like ligand receptors
  • ADM
  • ADM2
  • AM
  • CALCB
  • CALCR
  • CRSP3
  • RAMP1
  • RAMP2
  • RAMP3
Sus scrofa (pig)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • GAB1
  • GGA3
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAB4A
  • RAB4B
Sus scrofa (pig)
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade
  • TLR10
Sus scrofa (pig)
RND1 GTPase cycle
  • ALDH3A2
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSP
  • DST
  • EPHA2
  • EPSTI1
  • FAM135A
  • FAM83B
  • FLOT2
  • FRS3
  • GRB7
  • KIDINS220
  • LOC100516390
  • MUC13
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PLXNA1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBM39
  • RRAS2
  • TFRC
  • TMEM59
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)
Elastic fibre formation
  • ELN
  • FBLN5
  • FBN2
  • FBN3
  • FURIN
  • LOX
  • LOXL1
  • LOXL2
  • LOXL3
  • LOXL4
  • MFAP2
  • MFAP5
Sus scrofa (pig)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • F2
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • GPIX
  • GPIbB
  • VWF
Sus scrofa (pig)
LDL clearance
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPA
  • NCEH1
  • NPC1
  • NPC2
  • PCSK9
  • SOAT1
  • SOAT2
Sus scrofa (pig)
Thyroxine biosynthesis
  • CGA
  • DUOX1
  • DUOX2
  • IYD
  • SLC5A5
  • TPO
  • TSHB
Sus scrofa (pig)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4GNT
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT7
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • CHST4
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT4
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNT9
  • GALNTL5
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • GCNT7
  • MUC1
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC4
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
Sus scrofa (pig)
Amine ligand-binding receptors
  • GPR143
Sus scrofa (pig)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • HDAC6
  • MEC17
Sus scrofa (pig)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • CAV1
  • CSK
  • DBT
  • FAM91A1
  • JUP
  • Jup
  • LAMTOR1
  • LCK
  • MTR
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • RAB7A
  • RALGAPA1
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • STOM
  • TFRC
  • TMEM59
  • TUBA1B
  • UACA
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WDR11
Sus scrofa (pig)
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures
  • CD151
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL15A1
  • COL18A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL24A1
  • COL27A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL5A1
  • COL5A2
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL8A2
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • CTSB
  • CTSL
  • CTSL1
  • DST
  • ITGA6
  • ITGB4
  • LAMA3
  • MEGF6
  • MMP13
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • PLEC
Sus scrofa (pig)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • HSP90B1
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TYK2
  • socs1
Sus scrofa (pig)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS3
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ADRB2
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • DTR
  • DVL2
  • DYT1
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FZD4
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • PICALM
  • REPS1
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • SYT1
  • SYT2
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBQLN1
  • UBQLN2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WNT5A
Sus scrofa (pig)
Prostanoid ligand receptors
  • PTGDR
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
  • fp
Sus scrofa (pig)
Signaling by EGFR
  • AAMP
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • FAM83A
  • FAM83B
  • FAM83D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • LRIG1
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Scavenging of heme from plasma
  • ALB
  • AMBP
  • APOA1
  • CD163
  • HBB
  • HP
  • HPX
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100156062
  • LOC100523213
  • LOC106510284
  • LOC110259958
Sus scrofa (pig)
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • CILP
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
Sus scrofa (pig)
Digestion
  • GUC2C
  • GUCA2
  • GUCA2A
  • GUCA2B
  • GUCY2C
  • LOC100522404
  • PIR
Sus scrofa (pig)
Transferrin endocytosis and recycling
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • HFE
  • MCOLN1
  • STEAP3
  • STEAP4
  • TCIRG1
  • TF
  • TFR2
  • TFRC
Sus scrofa (pig)
Neutrophil degranulation
  • A1BG
  • ABCA13
  • ABP
  • ACP3
  • ACTR10
  • ACTR1B
  • ADA2
  • ADAM10
  • ADAM8
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • ADGRG3
  • AGA
  • AGPAT2
  • AHSG
  • ALAD
  • ALDH3B1
  • ALDOA
  • ALDOC
  • ALOX5
  • AMPD3
  • ANO6
  • ANPEP
  • ANXA2
  • AOC1
  • AP1M1
  • AP2A2
  • APAF1
  • APAF1_tv3
  • APEH
  • APRT
  • ARG1
  • ARHGAP45
  • ARHGAP9
  • ARL8A
  • ARMC8
  • ARP11
  • ARPC5
  • ARSA
  • ARSB
  • ASAH1
  • ASC
  • ATAD3A
  • ATG7
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP6AP2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0C
  • ATP8A1
  • ATP8B4
  • AZU1
  • B2M
  • B4GALT1
  • BIN2
  • BPI
  • BRI3
  • BST1
  • BST2
  • C1H6orf120
  • C1orf35
  • C2H1orf35
  • C3
  • C5AR1
  • C6orf120
  • CAB39
  • CALML5
  • CAND1
  • CANT1
  • CAP1
  • CAPN1
  • CCT2
  • CCT8
  • CD14
  • CD177
  • CD300C
  • CD36
  • CD44
  • CD47
  • CD53
  • CD55
  • CD58
  • CD59
  • CD63
  • CD68
  • CDA
  • CDK13
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CEP290
  • CFD
  • CFP
  • CHI3L1
  • CHIT1
  • CK2N
  • CKAP4
  • CLEC12A
  • CLEC5A
  • CLECSF5
  • CNN2
  • COMMD9
  • COPB1
  • COTL1
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPPED1
  • CRACR2A
  • CREG1
  • CRISP3
  • CRISPLD2
  • CSNK2B
  • CST3
  • CST6
  • CSTB
  • CTL2
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSH
  • CTSZ
  • CXCL7
  • CXCR2
  • CYB5R3
  • CYBA
  • CYFIP1
  • CYSTM1
  • DAO
  • DAP12
  • DDOST
  • DDX3X
  • DEGS1
  • DERA
  • DF
  • DGAT1
  • DIAPH1
  • DNAJC13
  • DNAJC3
  • DNAJC5
  • DNASE1L1
  • DOCK2
  • DOK3
  • DPP7
  • DSC1
  • DSG1
  • DSN1
  • DSP
  • DYNC1LI1
  • DYNLL1
  • DYNLT1
  • EEF1A1
  • ENPP4
  • EPX
  • FABP5
  • FAF2
  • FCER1G
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • FCN1
  • FCN2
  • FGL2
  • FOLR2
  • FRK
  • FRMPD3
  • FTH1
  • FTL
  • FUCA1
  • FUCA2
  • GAA
  • GALNS
  • GCA
  • GDI2
  • GGH
  • GHDC
  • GLA
  • GLB1
  • GLIPR1
  • GLUT3
  • GM2A
  • GNS
  • GOLGA7
  • GP91-PHOX
  • GPI
  • GPR84
  • GRN
  • GSDMD
  • GSN
  • GST12
  • GUSB
  • GYG1
  • HBB
  • HEBP2
  • HEXB
  • HK3
  • HP
  • HPSE
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1B
  • HSPA6
  • HSPA8
  • HSPCA
  • HUWE1
  • HVCN1
  • IDH1
  • IGF2R
  • ILF2
  • IMPDH
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • IQGAP2
  • IST1
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB2
  • JUP
  • Jup
  • KCMF1
  • KPNB1
  • KRT1
  • LAMP1
  • LAMP2
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LC8
  • LCN2
  • LOC100153783
  • LOC100154047
  • LOC100154844
  • LOC100156325
  • LOC100511639
  • LOC100512873
  • LOC100513601
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100517285
  • LOC100521529
  • LOC100522225
  • LOC100525227
  • LOC100525396
  • LOC100624191
  • LOC100624590
  • LOC100736623
  • LOC100739163
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • LOC102163838
  • LOC110255185
  • LOC110255221
  • LOC110258710
  • LOC110260465
  • LOC110261034
  • LOC110261633
  • LOC110261636
  • LOC110261637
  • LOX1
  • LPCAT1
  • LRRC7
  • LTA4H
  • LTF
  • MAGT1
  • MAN2B1
  • MANBA
  • MAPK1
  • MAPK14
  • MCEMP1
  • MDL1
  • MGAM
  • MGST1
  • MIF
  • MLEC
  • MME
  • MMP25
  • MMP8
  • MMP9
  • MNDA
  • MOSPD2
  • MPO
  • MVP
  • NAPRT
  • NAPRT1
  • NBEAL2
  • NCKAP1L
  • NCSTN
  • NDUFC2
  • NEU1
  • NFAM1
  • NFASC
  • NFKB1
  • NHLRC3
  • NIT2
  • NME2
  • NPC2
  • NRAS
  • OLFM4
  • OLR1
  • ORM1
  • OSCAR
  • OSTF1
  • P2RX1
  • PADI2
  • PDAP1
  • PDXK
  • PECAM1
  • PFKL
  • PGAM1
  • PGLYRP1
  • PGM2
  • PGRMC
  • PGRMC1
  • PIGE-108A11.3
  • PIGR
  • PKM
  • PKP1
  • PLAC8
  • PLAU
  • PLD1
  • PLEKHO2
  • PMAP-36
  • PNP
  • PPBP
  • PPIA
  • PRCP
  • PRDX4
  • PRDX6
  • PRKCD
  • PRSS2
  • PSAP
  • PSEN1
  • PSMA2
  • PSMA5
  • PSMB1
  • PSMB7
  • PSMC3
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PTAFR
  • PTGES2
  • PTPRB
  • PTPRC
  • PTPRN2
  • PTX3
  • PYCARD
  • PYGB
  • PYGL
  • QRICH1
  • QSOX1
  • RAB10
  • RAB18
  • RAB24
  • RAB27A
  • RAB31
  • RAB37
  • RAB3A
  • RAB3D
  • RAB44
  • RAB4B
  • RAB5B
  • RAB7A
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAP2A
  • RAP2C
  • RETN
  • RHOA
  • RHOF
  • RHOG
  • RNASET2
  • ROCK1
  • S100A11
  • S100A12
  • S100A7
  • S100A8
  • S100A9
  • S100C
  • SCAMP1
  • SCYB7
  • SDCBP
  • SERPINA1
  • SERPINB1
  • SERPINB10
  • SERPINB12
  • SERPINB6
  • SIGLEC14
  • SIGLEC5
  • SIRPA
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLC11A1
  • SLC15A4
  • SLC27A2
  • SLC2A3
  • SLC2A5
  • SLC44A2
  • SLCO4C1
  • SNAP23
  • SNAP29
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • STFB
  • STING1
  • STK11IP
  • STOM
  • SURF4
  • SVIP
  • SYNGR1
  • TBC1D10C
  • TCIRG1
  • TCN1
  • TICAM2
  • TIMP2
  • TLR2
  • TMBIM1
  • TMC6
  • TMEM179B
  • TMEM30A
  • TNFAIP6
  • TNFRSF1B
  • TOLLIP
  • TOM1
  • TRPM2
  • TSPAN14
  • TTR
  • TUBB
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TXNDC5
  • TYROBP
  • UABP-2
  • UBR4
  • UNC13D
  • VAMP8
  • VAPA
  • VAT1
  • VCL
  • VNN1
  • VPS35L
  • XRCC5
  • XRCC6
  • try
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ANOS1
  • CBL
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNJ4
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK6
  • KCNK7
  • KCNK9
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024