GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 301 - 325 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
TNFR1-mediated ceramide production
  • GNB2L1
  • NSMAF
  • RACK1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • TNF
  • TNFA
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
Sus scrofa (pig)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALB
  • BLVRA
  • BLVRB
  • BMDP
  • GSTA1
  • HMOX1
  • LOC100526118
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
  • UGT1A6
Sus scrofa (pig)
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC1
Sus scrofa (pig)
Mitochondrial protein degradation
  • A4
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • AD1
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • APP
  • ARG2
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH1
  • CLPP
  • CLPX
  • COI
  • COX5A
  • COX5B
  • COXI
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • FECH
  • FH
  • GLUD
  • GLUD1
  • HAD
  • HADH
  • HADHSC
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LOC100524613
  • LOC106507363
  • LOC110255331
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MT-CO1
  • MTATP6
  • MTCO1
  • NADK2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • OGDH
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • SCHAD
  • SCOT
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
Sus scrofa (pig)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6B
  • CYP3A22
  • CYP3A227
  • CYP3A29
  • DAO
  • EPHX1
  • LOC100520329
  • LOC100736962
  • LOC110256000
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NQO2
Sus scrofa (pig)
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
Sus scrofa (pig)
Prolactin receptor signaling
  • CUL1
  • GH1
  • JAK2
  • PRL
  • PRLR
  • RBX1
  • SH2B1
  • SKP1
Sus scrofa (pig)
PI-3K cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • KLB
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
Extracellular matrix organization
  • FN1
Sus scrofa (pig)
Metabolism of steroid hormones
  • STS
Sus scrofa (pig)
Interleukin-7 signaling
  • BRWD1
  • CRLF2
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • HIST1H3E
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • LOC110257900
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SMARCA4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of FGFR4 signaling
  • CBL
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • KLB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Interleukin-23 signaling
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL23A
  • IL23R
  • JAK2
  • LOC100736717
  • P4HB
  • SGRF
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
  • stat4
Sus scrofa (pig)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • APP
  • ARF1
  • ARRB1
  • CHMP2A
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLVS1
  • CTSZ
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • GNS
  • HGS
  • M6PR
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
Hormone ligand-binding receptors
  • CGA
  • FSHB
  • FSHR
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • LHB
  • LHCGR
  • TSHB
  • TSHR
Sus scrofa (pig)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAPGEF1
Sus scrofa (pig)
ER-Phagosome pathway
  • B2M
  • CALR
  • LOC100513601
  • PDIA3
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SNAP23
  • STX4
  • TAP1
  • TAP2
  • VAMP3
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
Adrenaline signalling through Alpha-2 adrenergic receptor
  • A2AR
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
Sus scrofa (pig)
G alpha (q) signalling events
  • A4
  • AD1
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AGT
  • AGTR1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • BTK
  • CASR
  • CCK
  • CCKAR
  • CCXCR1
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CYSLTR1
  • EDG7
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFAR1
  • FFAR2
  • FFAR4
  • GCG
  • GCGR
  • GHRL
  • GHSR
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • GPR120
  • GPR132
  • GPR143
  • GPR17
  • GPR39
  • GPR54
  • GPR68
  • GPRC6A
  • GRK2
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • GRPR
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • HRH1
  • HTR2A
  • HTR2B
  • HTR2C
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR4
  • LPAR5
  • LPAR6
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NKNB
  • NMB
  • NMBR
  • NMU
  • NMUR1
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • O3FAR1
  • OPN4
  • ORX
  • OX
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY2
  • P2RY6
  • PCAR1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PMCH
  • PPOX
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PTAFR
  • PTGER1
  • PTGFR
  • QRFPR
  • RGS1
  • RGS13
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS2
  • RGS4
  • RGS5
  • RGSL1
  • TAC3
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • TRIO
  • UTS2
  • UTS2R
  • XCL1
  • XCR1
  • alpha-1A
  • fp
Sus scrofa (pig)
Basigin interactions
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BSG
  • CAV1
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • MAG
  • MMP1
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Sus scrofa (pig)
Other interleukin signaling
  • CD4
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL16
  • IL29
  • IL34
  • JAK1
  • PTPRZ1
  • SDC1
  • STX1A
  • STX3
  • STX4
  • STXBP2
  • TXLNA
  • TYK2
  • VAMP2
Sus scrofa (pig)
TAK1-dependent IKK and NF-kappa-B activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • ALPK1
  • APP
  • CHUK
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IRAK1
  • IRAK2
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB2_tv2
  • NFKBIA
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RELA
  • RPS27A
  • S100A12
  • S100B
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2NL
  • USP18
Sus scrofa (pig)
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • ARF1
  • GBF1
  • SNAP23
  • STX4
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
Class B/2 (Secretin family receptors)
  • ADGRE1
  • ADGRE3
  • ADGRE5
  • CD55
  • CRH
  • CRHBP
  • CRHR1
  • CRHR2
  • LOC100518417
  • LOC110259331
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • PTHR
  • PTHR1
  • UCN
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024