GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 326 - 350 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Hyaluronan uptake and degradation
  • CD44
  • GUSB
  • HEXA
  • HEXB
  • HMMR
  • HYAL1
  • HYAL2
  • LYVE1
  • SLC9A1
  • STAB2
Sus scrofa (pig)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • CD109
  • CD52
  • CEACAM1
  • CEACAM21
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CPM
  • DDAH2
  • FCGR3A
  • FOLR2
  • GP2
  • GPLD1
  • LOC100157453
  • LOC100521229
  • LOC100522404
  • LSAMP
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6G6D
  • LY6K
  • LYPD1
  • LYPD3
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD8
  • MDGA1
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NRN1L
  • NTM
  • OPCML
  • OTOA
  • PLET1
  • PRND
  • PSCA
  • RECK
  • RTN4RL1
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • ULBP1
  • VNN1
  • XPNPEP2
  • ly6g6d
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KLB
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-1 signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1B2
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • LMP2
  • LOC110255300
  • LOC110258125
  • LOC110258578
  • LOC110259156
  • MAP2K6
  • MAP3K3
  • MAP3K7
  • MYD88
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PELI2
  • PELI3
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SQSTM1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TOLLIP
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Abacavir transmembrane transport
  • OCT2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC22A3
Sus scrofa (pig)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • ENGASE
  • NGLY1
  • PSMC1
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBXN1
Sus scrofa (pig)
Antagonism of Activin by Follistatin
  • FST
  • INHBA
  • INHBB
Sus scrofa (pig)
Sulfur amino acid metabolism
  • AHCY
  • BHMT
  • BHMT2
  • MAT1A
  • MTR
  • MTRR
  • bhmt
Sus scrofa (pig)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • ARTN
  • BTC
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CDC25C
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS3
  • FYN
  • Fgf4
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • HRAS
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • LRRC7
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • NEFL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • ODAD3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PSPN
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN4
  • SPTBN5
  • TEK
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors
  • ATAD2
  • CGA
  • ESR
  • ESR1
  • LHB
  • NR3A1
Sus scrofa (pig)
TNFR1-mediated ceramide production
  • GNB2L1
  • NSMAF
  • RACK1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • TNF
  • TNFA
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
Sus scrofa (pig)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALB
  • BLVRA
  • BLVRB
  • BMDP
  • GSTA1
  • HMOX1
  • LOC100526118
  • SLCO1B2
  • SLCO1B3
  • SLCO2B1
  • UGT1A6
Sus scrofa (pig)
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC1
Sus scrofa (pig)
Mitochondrial protein degradation
  • A4
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • AD1
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • APP
  • ARG2
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH1
  • CLPP
  • CLPX
  • COI
  • COX5A
  • COX5B
  • COXI
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • FECH
  • FH
  • GLUD
  • GLUD1
  • HAD
  • HADH
  • HADHSC
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LOC100524613
  • LOC106507363
  • LOC110255331
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MT-CO1
  • MTATP6
  • MTCO1
  • NADK2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • OGDH
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • SCHAD
  • SCOT
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
Sus scrofa (pig)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6B
  • CYP3A22
  • CYP3A227
  • CYP3A29
  • DAO
  • EPHX1
  • LOC100520329
  • LOC100736962
  • LOC110256000
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NQO2
Sus scrofa (pig)
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
Sus scrofa (pig)
Prolactin receptor signaling
  • CUL1
  • GH1
  • JAK2
  • PRL
  • PRLR
  • RBX1
  • SH2B1
  • SKP1
Sus scrofa (pig)
PI-3K cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GAB1
  • GRB2
  • KLB
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
Sus scrofa (pig)
Extracellular matrix organization
  • FN1
Sus scrofa (pig)
Metabolism of steroid hormones
  • STS
Sus scrofa (pig)
Interleukin-7 signaling
  • BRWD1
  • CRLF2
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • HIST1H3E
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • LOC110257900
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SMARCA4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of FGFR4 signaling
  • CBL
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • KLB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Interleukin-23 signaling
  • IL12B
  • IL12RB1
  • IL23A
  • IL23R
  • JAK2
  • LOC100736717
  • P4HB
  • SGRF
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
  • stat4
Sus scrofa (pig)
Lysosome Vesicle Biogenesis
  • A4
  • AD1
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1G2
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP4B1
  • AP4E1
  • AP4M1
  • APP
  • ARF1
  • ARRB1
  • CHMP2A
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLVS1
  • CTSZ
  • DNASE2
  • DNASE2A
  • DNL2
  • DNM2
  • GNS
  • HGS
  • M6PR
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024