GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 326 - 350 of 360 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
G alpha (i) signalling events
  • A2AR
  • ACKR3
  • ADORA1
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • AGT
  • APLN
  • C5
  • C5AR1
  • CASR
  • CCL1
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR2
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR7
  • CCR9
  • CHRM2
  • CHRM4
  • CNR1
  • CNR2
  • CXCL10
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL2
  • CXCL7
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • DRD3
  • DRD4
  • EDG7
  • EDG8
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GALR2
  • GALR3
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GPCR142
  • GPER1
  • GPR17
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR31
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR55
  • GPSM1
  • GPSM2
  • GPSM3
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • HCAR1
  • HCAR2
  • HTR1D
  • HTR1E
  • HTR1F
  • IL8
  • INSL7
  • LOC100154902
  • LOC100525396
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • LOC494564
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • MCHR2
  • MIP1B
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NMU
  • NMUR1
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPW
  • NPY
  • NPY Y4
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NPYR5
  • OPN5
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • P2RY12
  • P2RY13
  • P2RY14
  • P2RY4
  • PCAR1
  • PCP2
  • PDYN
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPBP
  • PPFIA4
  • PPL8
  • PPYR1
  • PSAP
  • PTGER3
  • PYY
  • RGR
  • RGS1
  • RGS11
  • RGS12
  • RGS13
  • RGS14
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS20
  • RGS4
  • RGS5
  • RGS6
  • RGS7
  • RGS8
  • RGS9
  • RHO
  • RHO1
  • RLN3
  • RRH
  • RXFP3
  • RXFP4
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
  • SCY4A
  • SCYB7
  • SRC
  • SST
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • SUCNR1
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R10
  • TAS2R16
  • TAS2R3
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R41
  • TAS2R7
  • TAS2R9
  • TMIGD3
  • gpr81
Sus scrofa (pig)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALB
  • BMDP
  • COX10
  • COX15
  • CPOX
  • FECH
  • FLVCR1
  • HMBS
  • PPOX
  • UROD
  • UROS
Sus scrofa (pig)
Melanin biosynthesis
  • DCT
  • OCA2
  • SLC45A2
  • TYR
  • TYRP1
  • TYRP2
Sus scrofa (pig)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • Jup
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6A
  • KRT7
  • KRT71
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT80
  • KRT82
  • KRT84
  • KRT85
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100515166
  • LOC100516036
  • LOC100517674
  • LOC100518807
  • LOC100523123
  • LOC100523275
  • LOC100523670
  • LOC100621639
  • LOC100621844
  • LOC100622826
  • LOC100623393
  • LOC100625168
  • LOC100625858
  • LOC100737483
  • LOC102160031
  • LOC102164863
  • LOC106504189
  • LOC106507258
  • LOC106508044
  • LOC110255272
  • LOC110255312
  • LOC110256008
  • LOC110256282
  • LOC110260665
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Sus scrofa (pig)
Activation of PKB
  • AKT2
  • PDPK1
  • TRIB3
Sus scrofa (pig)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CALM3
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • JUP
  • Jup
  • NOS3
  • PAK1
  • PAK2
  • PDPK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IL1RL1
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRR5
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • RICTOR
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • ABCC1
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • BMDP
  • CERS1
  • CERS2
  • CERS4
  • CERS5
  • CYB5B
  • DEGS1
  • DEGS2
  • FA2H
  • GDF1
  • KDSR
  • LASS4
  • MFSD2B
  • ORMDL1
  • SAMD8
  • SGMS1
  • SGMS2
  • SPHK1
  • SPHK2
  • SPNS2
  • SPTLC1
  • SPTLC2
  • SPTLC3
  • SPTSSA
  • SPTSSB
Sus scrofa (pig)
Cytosolic sulfonation of small molecules
  • ABHD14B
  • BPNT1
  • BPNT2
  • IMPA3
  • IMPAD1
  • PODXL2
  • SULT1A3
  • SULT1B1
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • SULT2B1
  • SULT4A1
  • SULT6B1
  • TPST2
Sus scrofa (pig)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • 3b-HSD
  • CGA
  • CYP11B
  • CYP11B2
  • CYP21
  • CYP21A1
  • CYP21A3
  • HSD3B
  • LHB
Sus scrofa (pig)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • ENGASE
  • NGLY1
  • PSMC1
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBXN1
Sus scrofa (pig)
Interleukin-1 signaling
  • CHUK
  • CUL1
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1B2
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • LMP2
  • LOC110255300
  • LOC110258125
  • LOC110258578
  • LOC110259156
  • MAP2K6
  • MAP3K3
  • MAP3K7
  • MYD88
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PELI2
  • PELI3
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SQSTM1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TOLLIP
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Regulation of RUNX3 expression and activity
  • CBFB
  • EP300
  • LMP2
  • MDM2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX3
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SRC
  • TGFB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
TNFR2 non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • CD40
  • CD40LG
  • LMP2
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • PIAP
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF5
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF2
  • TRAF2
  • TRAF3
Sus scrofa (pig)
UCH proteinases
  • ACTB
  • ACTL6A
  • ACTR5
  • ACTR8
  • ADRM1
  • ASXL1
  • ASXL2
  • BAP1
  • BARD1
  • FOXK1
  • FOXK2
  • H2AC10
  • H2AC11
  • H2AC12
  • H2AC14
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • HCFC1
  • INO80
  • INO80B
  • INO80C
  • INO80D
  • INO80E
  • KDM1B
  • LMP2
  • LOC110261482
  • MBD5
  • MBD6
  • MCRS1
  • NEDD8
  • NFRKB
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SENP8
  • TFPT
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UCHL1
  • UCHL3
  • UCHL5
  • YY1
Sus scrofa (pig)
Downstream TCR signaling
  • BCL10
  • CARD11
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CHUK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • INPP5D
  • LCK
  • LMP2
  • LOC100153139
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PDPK1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RELA
  • RIPK2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
  • TAB2
  • TAK1b
  • TRAF6
  • UBE2NL
Sus scrofa (pig)
Mitochondrial protein degradation
  • A4
  • ACAD8
  • ACADSB
  • ACAT1
  • ACO2
  • AD1
  • AFG3L2
  • ALAS1
  • ALDH18A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • APP
  • ARG2
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATPASE6
  • BDH1
  • CLPP
  • CLPX
  • COI
  • COX5A
  • COX5B
  • COXI
  • CS
  • DBT
  • DLD
  • ECH1
  • ECI1
  • FECH
  • FH
  • GLUD
  • GLUD1
  • HAD
  • HADH
  • HADHSC
  • HMGCS2
  • HSD17B10
  • HSPA9
  • HSPD1
  • HTRA2
  • IARS2
  • IDH2
  • IDH3A
  • LDHD
  • LOC100524613
  • LOC106507363
  • LOC110255331
  • LONP1
  • MDH2
  • ME2
  • MRPL32
  • MRPS10
  • MRPS2
  • MT-ATP6
  • MT-CO1
  • MTATP6
  • MTCO1
  • NADK2
  • NDUFS1
  • NDUFS3
  • OGDH
  • OXCT
  • OXCT1
  • OXSM
  • PCCB
  • PDHA1
  • PDHB
  • PDK1
  • PMPCA
  • SCHAD
  • SCOT
  • SHMT2
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SMDT1
  • SPG7
  • SSBP1
  • STAR
  • SUCLG2
  • TFAM
  • TWNK
  • UQCRC2
Sus scrofa (pig)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4GALT
  • B3GALNT1
  • B3GALT3
  • B3GALT4
  • B3GNT5
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • FUT1
  • FUT2
  • GAL3ST1
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT8
Sus scrofa (pig)
Degradation of cysteine and homocysteine
  • ADO
  • CDO1
  • FMO-1
  • FMO1
  • GADL1
  • MPST
  • TST
  • TXN2
Sus scrofa (pig)
Androgen biosynthesis
  • 3b-HSD
  • CGA
  • CYP17
  • CYP17A1
  • HSD17B12
  • HSD17B3
  • HSD3B
  • LHB
  • LOC100525350
  • POMC
  • SRD5A1
  • SRD5A2
  • ST5AR2
Sus scrofa (pig)
Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • IL5
  • IL5RA
  • JAK2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEC
  • VAV1
  • YWHAZ
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
MTOR signalling
  • AKT1S1
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • MLST8
  • MTOR
  • RHEB
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • YWHAB
Sus scrofa (pig)
RHOG GTPase cycle
  • ANKLE2
  • ARFGAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP21
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • ARHGEF16
  • ARHGEF26
  • ARHGEF5
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CYFIP1
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK1
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DOCK5
  • DSG2
  • ELMO2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • GARRE1
  • HSPE1
  • IQGAP2
  • ITGB1
  • ITSN1
  • KIAA0355
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LETM1
  • LMAN1
  • MAP3K11
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MPP7
  • NDUFA5
  • NDUFS3
  • OPHN1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PLD1
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7A
  • RBM39
  • RHOG
  • SHMT2
  • TFRC
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
G alpha (q) signalling events
  • A4
  • AD1
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AGT
  • AGTR1
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Last updated: August 19, 2024