GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 361 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • AMOT
  • ANGPTL4
  • CDH11
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • Jup
  • PGAR
Sus scrofa (pig)
RAF/MAP kinase cascade
  • ACTN2
  • ANGPT1
  • AREG
  • ARTN
  • BTC
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CDC25C
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS3
  • FYN
  • Fgf4
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • GRIN2D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • HRAS
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL5
  • IL5RA
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • KRAS
  • LAT
  • LRRC7
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • NEFL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRTN
  • ODAD3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PEA15
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PSPN
  • PTPRA
  • RALGDS
  • RANBP9
  • RASGEF1A
  • RASGRF1
  • RASGRF2
  • RASGRP1
  • RASGRP4
  • RET
  • RGL1
  • RGL2
  • RGL3
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SOS1
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN4
  • SPTBN5
  • TEK
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
SHC-mediated cascade:FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • HRAS
  • KLB
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • CAV1
  • CSK
  • DBT
  • FAM91A1
  • JUP
  • Jup
  • LAMTOR1
  • LCK
  • MTR
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • RAB7A
  • RALGAPA1
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • STOM
  • TFRC
  • TMEM59
  • TUBA1B
  • UACA
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WDR11
Sus scrofa (pig)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • HSP90B1
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TYK2
  • socs1
Sus scrofa (pig)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • CES1
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100154047
  • LOC100736962
  • MME
  • REN
Sus scrofa (pig)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • CD40
  • CD40LG
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • PIAP
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF5
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TRAF2
  • TRAF3
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB2
  • BTC
  • CDC37
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FYN
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
TGFBR3 regulates TGF-beta signaling
  • ARRB1
  • ARRB2
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
RAC2 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABR
  • ANKLE2
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGDIA
  • ARMCX3
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BRK1
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42EP4
  • CYBA
  • CYFIP1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DOCK1
  • DOCK10
  • DOCK2
  • DOCK3
  • DOCK4
  • DSG2
  • EMD
  • EPHA2
  • ESYT1
  • GARRE1
  • GIT1
  • GIT2
  • GP91-PHOX
  • ITGB1
  • KIAA0355
  • LAMTOR1
  • LBR
  • LMAN1
  • MCAM
  • MCF2
  • MPP7
  • MTX1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PGRMC2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD2
  • PREX1
  • RAB7A
  • RAC2
  • RACGAP1
  • RBM39
  • SAMM50
  • SLITRK5
  • SWAP70
  • SYDE1
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • WASF2
Sus scrofa (pig)
Peptide hormone biosynthesis
  • POMC
Sus scrofa (pig)
Formation of ATP by chemiosmotic coupling
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1E
  • ATP5I
  • ATP5J2
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5MJ
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • DMAC2L
  • LOC100519871
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Sus scrofa (pig)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • APLN
  • C3
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • CCK
  • CCKAR
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GALR2
  • GALR3
  • GPER1
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KEL
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NLN
  • NMB
  • NMBR
  • NMU
  • NMUR1
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPW
  • NPY
  • NPY Y4
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NPYR5
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPL8
  • PPYR1
  • PRLH
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SST
  • SSTR2
  • SSTR3
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • UTS2
  • UTS2R
  • XK
Sus scrofa (pig)
Adrenoceptors
  • A2AR
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
  • BAR3
  • alpha-1A
Sus scrofa (pig)
SUMOylation of intracellular receptors
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • FTZF1
  • HDAC4
  • NR1A1
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR5A1
  • NR5A2
  • PGR
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PPARA
  • RARA
  • RORA
  • RXRA
  • SMT3A
  • SMT3H2
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • THRA
  • THRB
  • UBE2I
  • VDR
Sus scrofa (pig)
Interferon gamma signaling
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKCD
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
  • socs1
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Regulates Cell Motility
  • BTC
  • DIAPH1
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • MEMO1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • RHOA
Sus scrofa (pig)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • B2M
  • C3
  • CD1.1
  • CD1B
  • CD1D
  • CD200
  • CD200R1
  • CD22
  • CD226
  • CD247
  • CD300A
  • CD300C
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD96
  • CLEC2B
  • CLEC4G
  • CRTAM
  • CXADR
  • DAP10
  • DAP12
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • IFITM1
  • IFITM3
  • IGKV5-2
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KIR2DL4
  • KLRB1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LOC100125542
  • LOC100513601
  • LOC100513863
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100515852
  • LOC100519082
  • LOC100521998
  • LOC100523213
  • LOC100626247
  • LOC102161418
  • LOC110260307
  • LOC110261034
  • MADCAM1
  • NCR2
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • PVR
  • SIGLEC1
  • SIGLEC5
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLAMF7
  • TNFRSF5
  • TREM1
  • TREM2
  • TREML2
  • TYROBP
  • ULBP1
  • VCAM1
  • cd1d
  • pCD1A
Sus scrofa (pig)
RUNX3 regulates p14-ARF
  • CBFB
  • CCND1
  • EP300
  • HDAC4
  • RUNX3
  • TGFB1
Sus scrofa (pig)
Prostanoid ligand receptors
  • PTGDR
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
  • fp
Sus scrofa (pig)
Ciprofloxacin ADME
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALB
  • BMDP
  • SLC22A1
  • SLCO1A2
Sus scrofa (pig)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • DTR
  • EGFR
  • GPNMB
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HIF1A
  • LRRK2
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
Transport of organic anions
  • AVP
  • SLC16A2
  • SLCO1A2
  • SLCO1B2
  • SLCO1C1
  • SLCO2A1
  • SLCO2B1
  • SLCO3A1
  • SLCO4A1
  • SLCO4C1
Sus scrofa (pig)
Asparagine N-linked glycosylation
  • ASGR1
  • ASGR2
  • LOC110255214
  • UMOD
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.1

Last updated: February 17, 2025