GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Androgen biosynthesis
  • 3b-HSD
  • CGA
  • CYP17
  • CYP17A1
  • HSD17B12
  • HSD17B3
  • HSD3B
  • LHB
  • LOC100525350
  • POMC
  • SRD5A1
  • SRD5A2
  • ST5AR2
Sus scrofa (pig)
PI3K Cascade
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • IRS1
  • IRS2
  • KL
  • KLB
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTPN11
  • TLR9
Sus scrofa (pig)
COPI-mediated anterograde transport
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ANK1
  • ARCN1
  • ARF1
  • ARF3
  • ARF4
  • ARF5
  • ARFGAP1
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ARP11
  • B4GALT7
  • BET1L
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CD55
  • CD59
  • COG1
  • COG2
  • COG3
  • COG4
  • COG5
  • COG6
  • COG7
  • COG8
  • COPA
  • COPB1
  • COPB2
  • COPE
  • COPG1
  • COPG2
  • COPZ1
  • COPZ2
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GBF1
  • GOLGA2
  • GOLGB1
  • GORASP1
  • GOSR2
  • INS
  • KDELR1
  • KDELR2
  • LC8
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • SPTA1
  • SPTAN1
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN4
  • SPTBN5
  • TMED10
  • TMED2
  • TMED3
  • TMED7
  • TMED9
  • TMEM115
  • USO1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • OCT2
  • SLC18A1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
Sus scrofa (pig)
IFNG signaling activates MAPKs
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
Sus scrofa (pig)
Pyroptosis
  • BAX
  • CASP1
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CYC
  • CYCS
  • GSDMD
  • GSDME
  • GZMB
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1B2
  • LOC100519295
  • LOC100522842
  • LOC100522887
  • LOC100621347
  • LOC100739590
  • LOC110255300
  • LOC110258125
  • LOC110258578
  • LOC110259156
Sus scrofa (pig)
IRS-related events triggered by IGF1R
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
  • IRS1
  • IRS2
  • IRS4
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
Generation of second messenger molecules
  • CD101
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DRA
  • FYB1
  • GRAP2
  • HLA-DRA
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC100153139
  • NCK1
  • PAK1
  • PAK2
  • PLCG1
  • PLCG2
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Integrin cell surface interactions
  • BSG
  • CD44
  • CD47
  • CDH1
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • F11R
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN1
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM2
  • JAM3
  • LUM
  • MADCAM1
  • OPN
  • PECAM1
  • SPP1
  • THBS1
  • TNC
  • TNN
  • VCAM1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Erythropoietin activates RAS
  • EPO
  • EPOR
  • GRB2
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
  • RAPGEF1
  • SHC1
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • DES
  • DMD
  • MLC-2V
  • MLC2V
  • MYBPC2
  • MYBPC3
  • MYH3
  • MYH8
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL3
  • MYL4
  • NEB
  • PALLD
  • TCAP
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TPM2
  • TPM4
  • VIM
Sus scrofa (pig)
Adrenoceptors
  • A2AR
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
  • BAR3
  • alpha-1A
Sus scrofa (pig)
PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IL1RL1
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRR5
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • RICTOR
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • ASAP1
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • PKD1
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8A
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB2
  • BTC
  • CDC37
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FYN
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
Insulin receptor recycling
  • ATP6AP1
  • ATP6G2
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E2
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1H
  • CTSD
  • IDE
  • INS
  • INSR
  • PTPN1
  • PTPRF
  • TCIRG1
Sus scrofa (pig)
Activation of the phototransduction cascade
  • CNGA1
  • CNGB1
  • GNB1
  • PDE6A
  • PDE6G
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
Dissolution of Fibrin Clot
  • ANXA2
  • HRG
  • PAI1
  • PLANH1
  • PLAT
  • PLAU
  • PLG
  • S100A10
  • SERPINB2
  • SERPINB6
  • SERPINB8
  • SERPINE1
  • SERPINE2
  • SERPINF2
Sus scrofa (pig)
EGFR Transactivation by Gastrin
  • DTR
  • EGFR
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • MMP3
  • NRAS
  • PRKCA
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
DDX58/IFIH1-mediated induction of interferon-alpha/beta
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • IRF3
  • MAVS
  • TBK1
  • TOMM70
Sus scrofa (pig)
Activated NTRK2 signals through FRS2 and FRS3
  • BDNF
  • GRB2
  • NTF4
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
PECAM1 interactions
  • FYN
  • INPP5D
  • ITGAV
  • ITGB3
  • LCK
  • LYN
  • PECAM1
  • PLCG1
  • PTPN11
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • CES1
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100154047
  • LOC100736962
  • MME
  • REN
Sus scrofa (pig)
FGFR4 ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024