GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Regulation of Complement cascade
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • F2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • SERPING1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IER3
  • IL1RL1
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
Formation of ATP by chemiosmotic coupling
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1E
  • ATP5I
  • ATP5J2
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • DMAC2L
  • LOC100519871
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Sus scrofa (pig)
Signaling by Insulin receptor
  • INS
  • INSR
Sus scrofa (pig)
Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K)
  • EPO
  • EPOR
  • GAB1
  • IRS2
  • JAK2
  • LYN
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3CG
  • PIK3R1
  • PIK3R5
Sus scrofa (pig)
Vitamin C (ascorbate) metabolism
  • CYB5
  • CYB5A
  • CYB5R3
  • GLUT1
  • GLUT3
  • GSTO1
  • SLC23A1
  • SLC2A1
  • SLC2A3
Sus scrofa (pig)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PTPN22
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPNE6
Sus scrofa (pig)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • DTR
  • EGFR
  • GPNMB
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HIF1A
  • LRRK2
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
Regulation of TNFR1 signaling
  • BIRC2
  • CASP8
  • CASP9
  • CHUK
  • CLIP3
  • CYLD
  • FADD
  • GNB2L1
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • MADD
  • MAPKAPK2
  • MIB2
  • OPTN
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • PIAP
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RNF31
  • RPS27A
  • SPATA2
  • SPPL2A
  • SPPL2B
  • STUB1
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF6
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2L3
  • ULK1
  • USP2
  • USP21
  • USP4
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
Sus scrofa (pig)
Ligand-dependent caspase activation
  • CASP8
  • CD14
  • FADD
  • LY96
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TLR4
  • TNFRSF6
Sus scrofa (pig)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD14
  • CD180
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • ITGAM
  • ITGB2
  • LBP
  • LY64
  • LY86
  • LY96
  • PLCG2
  • TICAM2
  • TLR4
Sus scrofa (pig)
Post-translational protein phosphorylation
  • A4
  • AD1
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMEL
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • ATGL
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CSF1
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FGA
  • FGF23
  • FGG
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • HRC
  • HSP90B1
  • IGFBP1
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL-6
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC100156062
  • LOC100738836
  • LOC106510284
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • OPN
  • P4HB
  • PCSK9
  • PDIA6
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TF
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TNN
  • UABP-2
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • CD40
  • CD40LG
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • PIAP
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF5
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TRAF2
  • TRAF3
Sus scrofa (pig)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CRYAB
  • HSBP1
  • HSF1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1B
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB8
  • HSPCA
  • MLST8
  • MTOR
  • RPTOR
Sus scrofa (pig)
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • AMOT
  • ANGPTL4
  • CDH11
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • Jup
  • PGAR
Sus scrofa (pig)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • PAFAH2
Sus scrofa (pig)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • A4
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AD1
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOOL
  • APP
  • BRPF3
  • CALM3
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CFD
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLU
  • CTSW
  • CXCL7
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • DF
  • ECM1
  • EGF
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • FAM3C
  • FERMT3
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY2
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LOC100156325
  • LOC100524517
  • LY6G6F
  • MMRN1
  • NHLRC2
  • OLA1
  • ORM1
  • PAI1
  • PALLD
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PLANH1
  • PLEK
  • PLG
  • PPBP
  • PROS1
  • PSAP
  • QSOX1
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SCYB7
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TF
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN1
  • TMSB4
  • TOR4A
  • TUBA4A
  • UABP-2
  • VCL
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VWF
  • WDR1
  • ly6g6f
Sus scrofa (pig)
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • ABCC1
  • ALOX15
  • ALOX5
  • CYP4A21
  • CYP4A23
  • CYP4A24
  • CYP4A90
  • CYP4B1
  • CYP4F22
  • CYP4F3
  • CYP4F52
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT1
  • LOC110255311
  • LOC110259328
  • LOC110259329
  • LTA4H
  • LTC4S
  • MAPKAPK2
  • RDP
Sus scrofa (pig)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • PARD3
  • PARD6A
  • PRKCZ
  • RHOA
  • RPS27A
  • SMURF1
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • KL
  • PLCG1
Sus scrofa (pig)
Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules
  • PDZD11
  • PDZK11
  • SLC33A1
  • SLC5A6
Sus scrofa (pig)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • ALDH3A2
  • APP
  • CYB5
  • CYB5A
  • EMD
  • HMOX1
  • PRNP
  • PRP
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SERP1
  • SGTA
  • STX1A
  • UBE2J2
  • VAMP2
  • VAPA
Sus scrofa (pig)
Signal regulatory protein family interactions
  • CD47
  • DAP12
  • FYB1
  • GRB2
  • LOC100736623
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • PTK2B
  • SIRPA
  • SKAP2
  • TYROBP
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024