GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
EGFR downregulation
  • AREG
  • ARHGEF7
  • BTC
  • CBL
  • CDC42
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • PTPN12
  • PTPN3
  • PTPRK
  • RPS27A
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SPRY1
  • STAM
  • STAM2
  • TGFA
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IER3
  • IL1RL1
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IL1RL1
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRR5
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • RICTOR
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
GAB1 signalosome
  • AREG
  • BTC
  • CSK
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
  • PXN
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
EGFR interacts with phospholipase C-gamma
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PLCG1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH3
  • COL7A1
  • CTSZ
  • F5
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MIA2
  • MIA3
  • PREB
  • SAR1B
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • UABP-2
Sus scrofa (pig)
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • ARF1
  • GBF1
  • SNAP23
  • STX4
  • VAMP2
  • VAMP8
Sus scrofa (pig)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • ASAP1
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • PKD1
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8A
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • GAB1
  • GGA3
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAB4A
  • RAB4B
Sus scrofa (pig)
RHOQ GTPase cycle
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • ARL13B
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CFTR
  • CPNE8
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • FNBP1
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GOPC
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • Jup
  • LAMTOR1
  • MPP7
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7A
  • RHOQ
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TFRC
  • TRIP10
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WASL
  • WWP2
Sus scrofa (pig)
RND3 GTPase cycle
  • ARHGAP21
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CKAP4
  • CKB
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSG1
  • DSP
  • DST
  • EPHA2
  • FAM83B
  • FLOT2
  • KCTD13
  • KTN1
  • LOC100516390
  • MUC13
  • NISCH
  • PICALM
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBM39
  • RND3
  • ROCK1
  • SCRIB
  • SEMA4F
  • TMOD3
  • TNFAIP1
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)
Sema4D mediated inhibition of cell attachment and migration
  • ARHGAP35
  • MET
  • PLXNB1
  • RAC1
  • RHOA
  • RRAS
  • SEMA4D
Sus scrofa (pig)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • CAV1
  • CSK
  • DBT
  • FAM91A1
  • JUP
  • Jup
  • LAMTOR1
  • LCK
  • MTR
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • RAB7A
  • RALGAPA1
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • STOM
  • TFRC
  • TMEM59
  • TUBA1B
  • UACA
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WDR11
Sus scrofa (pig)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • PARD3
  • PARD6A
  • PRKCZ
  • RHOA
  • RPS27A
  • SMURF1
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSD
  • ARSG
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • LOC100621771
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Sus scrofa (pig)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
Sus scrofa (pig)
RET signaling
  • ARTN
  • CDC25C
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK6
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB2
  • GRB7
  • Grb10
  • IRS2
  • MAPK7
  • NRTN
  • PDLIM7
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PRKCA
  • PSPN
  • PTPN11
  • RAP1GAP
  • RET
  • SHC1
  • SHC3
  • SOS1
  • SRC
Sus scrofa (pig)
Asparagine N-linked glycosylation
  • ASGR1
  • ASGR2
  • LOC110255214
  • UMOD
Sus scrofa (pig)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of growth factors and their receptors
  • ATAD2
  • CGA
  • ESR
  • ESR1
  • LHB
  • NR3A1
Sus scrofa (pig)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • HDAC6
  • MEC17
Sus scrofa (pig)
Ion transport by P-type ATPases
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP7A
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • CALM3
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • FXYD1
  • FXYD6
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PLM
  • PLN
  • SRI
Sus scrofa (pig)
Basigin interactions
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BSG
  • CAV1
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • MAG
  • MMP1
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Sus scrofa (pig)
Formation of ATP by chemiosmotic coupling
  • ATP5A1
  • ATP5A2
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1E
  • ATP5I
  • ATP5J2
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5O
  • ATP5PO
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • DMAC2L
  • LOC100519871
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024