GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
RUNX3 regulates CDKN1A transcription
  • MADH3
  • MADH4
  • P53
  • RUNX3
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB1
  • TP53
  • ZFHX3
Sus scrofa (pig)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1)
  • CD26
  • DPP4
  • FFAR4
  • GCG
  • GNB1
  • GNB3
  • GPR119
  • GPR120
  • GRP
  • LEP
  • O3FAR1
  • OB
  • OBS
Sus scrofa (pig)
Signaling by PDGF
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • FURIN
  • OPN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFC
  • PDGFD
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PLAT
  • PLG
  • PTPN12
  • SPP1
  • THBS1
  • THBS2
  • THBS3
  • THBS4
Sus scrofa (pig)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • A2AR
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • LOC100621431
  • LOC110255211
Sus scrofa (pig)
Downregulation of TGF-beta receptor signaling
  • BAMBI
  • MADH3
  • MTMR4
  • PMEPA1
  • RPS27A
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF2
  • STUB1
  • Smad7
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • bambi
Sus scrofa (pig)
Degradation of the extracellular matrix
  • A2M
  • ACAN
  • ADAM10
  • ADAM15
  • ADAM8
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • BCAN
  • BSG
  • CAPN1
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPN15
  • CAPN2
  • CAPN4
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPNS1
  • CAST
  • CD44
  • CDH1
  • DCN
  • HTRA1
  • KLK7
  • LOC100154047
  • MMP1
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP19
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • NID1
  • OPN
  • OPTC
  • SCUBE1
  • SCUBE3
  • SPP1
  • TMPRSS6
Sus scrofa (pig)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • ADAM2
  • ADAM20
  • ADAM21
  • B4GALT1
  • FTNB
  • OVGP1
  • SPAM-1
  • SPAM1
  • ZP2
  • ZP3
  • ZP3A
  • ZP4
  • ZPA
  • ZPB
Sus scrofa (pig)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • EDG7
  • EDG8
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
Sus scrofa (pig)
Transport of fatty acids
  • APOD
  • LCN1
  • LCN12
  • LCN15
  • LCN9
  • OBP2B
  • SLC27A1
  • SLC27A4
  • SLC27A6
Sus scrofa (pig)
Terminal pathway of complement
  • C5
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CLU
Sus scrofa (pig)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • B2M
  • C3
  • CD1.1
  • CD1B
  • CD1D
  • CD200
  • CD200R1
  • CD22
  • CD226
  • CD247
  • CD300A
  • CD300C
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD96
  • CLEC2B
  • CLEC4G
  • CRTAM
  • CXADR
  • DAP10
  • DAP12
  • FCGR2B
  • FCGR3A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • IFITM1
  • IFITM3
  • IGKV5-2
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KIR2DL1
  • KLRB1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LOC100125542
  • LOC100513601
  • LOC100513863
  • LOC100515551
  • LOC100515837
  • LOC100515852
  • LOC100519082
  • LOC100521998
  • LOC100523213
  • LOC100626247
  • LOC102161418
  • LOC110260307
  • LOC110261034
  • MADCAM1
  • NCR2
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • PVR
  • SIGLEC1
  • SIGLEC5
  • SLA-2
  • SLA-3
  • SLA-6
  • SLA-7
  • SLA-8
  • SLAMF7
  • TNFRSF5
  • TREM1
  • TREM2
  • TREML2
  • TYROBP
  • ULBP1
  • VCAM1
  • cd1d
  • pCD1A
Sus scrofa (pig)
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • APAH1
  • CCS
  • CYBA
  • CYC
  • CYCS
  • ERO1A
  • ERO1L
  • GP91-PHOX
  • GPX3
  • GPX5
  • GPX7
  • GPX8
  • GSR
  • LOC100519295
  • LOC100522842
  • LOC100621347
  • LOC100739163
  • LOC100739590
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOX4
  • NOX5
  • NUDT2
  • P4HB
  • PRDX1
  • PRDX2
  • PRDX3
  • PRDX6
  • SOD1
  • SOD2
  • SOD3
  • TXN
  • TXN2
Sus scrofa (pig)
RHOA GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP19
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP28
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • ARHGAP8
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF3
  • ARHGEF5
  • ARHGEF7
  • ATP6AP1
  • BCAP31
  • BCR
  • C1QBP
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CCDC115
  • CIT
  • DAAM1
  • DDRGK1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DOCK2
  • ECT2
  • FAF2
  • FAM13A
  • FARP1
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL3
  • GMIP
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • KTN1
  • LBR
  • LMAN1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9A
  • MYO9B
  • NET1
  • NGEF
  • OPHN1
  • PCDH7
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PLD1
  • PLEKHG3
  • PLEKHG5
  • PLEKHG6
  • PREX1
  • PREX2
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • RHOA
  • RHPN1
  • RHPN2
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SCFD1
  • SLK
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • STARD8
  • STOM
  • TAGAP
  • TEX2
  • TFRC
  • TIAM1
  • TJP2
  • TMEM57
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
RHOQ GTPase cycle
  • ARHGAP1
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • ARL13B
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CFTR
  • CPNE8
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • FNBP1
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GOPC
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • Jup
  • LAMTOR1
  • MPP7
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7A
  • RHOQ
  • SCRIB
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TFRC
  • TRIP10
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WASL
  • WWP2
Sus scrofa (pig)
Interleukin-2 signaling
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK3
  • LCK
  • PTK2B
  • SHC1
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • MANEA
  • MGAT1
Sus scrofa (pig)
PD-1 signaling
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PDCD1
  • PDCD1LG2
  • PTPN11
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
MET activates STAT3
  • HGF
  • MET
  • STAT3
Sus scrofa (pig)
Dimerization of procaspase-8
  • APT1
  • CASP8
  • CASP9
  • FADD
  • FAS
  • LOC100624226
  • LOC100737977
  • RIPK1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
Sus scrofa (pig)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • ENPP1
  • FLAD1
  • RFK
  • SLC52A1
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Sus scrofa (pig)
IRS-mediated signalling
  • IRS1
  • IRS2
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
Sus scrofa (pig)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucose-dependent Insulinotropic Polypeptide (GIP)
  • CD26
  • DPP4
  • GIP
  • GPR119
Sus scrofa (pig)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ANOS1
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
FGFR1b ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF3
  • FGFR1
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
Clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ACTR3
  • ADRB2
  • AGTR1
  • AMPH
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARF6
  • ARFGAP1
  • ARPC1A
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC5
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BIN1
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • DNAJC6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DTR
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FZD4
  • GAK
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • HIP1
  • HIP1R
  • HSPA8
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • OCRL
  • PACSIN1
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • RAB5A
  • RAB5B
  • REPS1
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • SNX18
  • SNX9
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • SYNJ1
  • SYNJ2
  • SYT1
  • SYT2
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TRIP10
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WASL
  • WNT5A
Sus scrofa (pig)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024