GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • CD40
  • CD40LG
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • PIAP
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF5
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TRAF2
  • TRAF3
Sus scrofa (pig)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
  • BIRC2
  • CHUK
  • CYLD
  • GNB2L1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • MAP3K7
  • OPTN
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • PIAP
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RNF31
  • SPATA2
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1b
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • USP2
  • USP21
  • USP4
Sus scrofa (pig)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • BIRC2
  • CYLD
  • FADD
  • IKBKE
  • MIB2
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • PIAP
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RNF31
  • SPATA2
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF6
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • USP2
  • USP21
  • USP4
Sus scrofa (pig)
Molecules associated with elastic fibres
  • BMP10
  • BMP2
  • BMP4
  • BMP7
  • EFEMP2
  • FBLN5
  • GDF5
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MFAP2
  • MFAP4
  • MFAP5
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • VTN
  • bmp4
Sus scrofa (pig)
Antimicrobial peptides
  • BPI
  • BPIFA1
  • BPIFA2
  • BPIFB1
  • BPIFB2
  • BPIFB4
  • CHGA
  • CLU
  • EPPIN
  • GNLY
  • LEAP2
  • LOC100154047
  • LOC100520832
  • LOC100624628
  • LOC102163838
  • LOC110255221
  • LOC110260309
  • LTF
  • PGLYRP1
  • PGLYRP2
  • PGLYRP3
  • PGLYRP4
  • PMAP-36
  • PRSS2
  • REG3G
  • try
Sus scrofa (pig)
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade
  • BPI
  • CD14
  • CD180
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • ITGAM
  • ITGB2
  • LBP
  • LY64
  • LY86
  • LY96
  • PLCG2
  • TICAM2
  • TLR4
Sus scrofa (pig)
Interleukin-7 signaling
  • BRWD1
  • CRLF2
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • HIST1H3E
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • LOC110257900
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SMARCA4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Integrin cell surface interactions
  • BSG
  • CD44
  • CD47
  • CDH1
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • F11R
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN1
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM2
  • JAM3
  • LUM
  • MADCAM1
  • OPN
  • PECAM1
  • SPP1
  • THBS1
  • TNC
  • TNN
  • VCAM1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • BTC
  • CDC37
  • CUL5
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • MATK
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTPN12
  • PTPN18
  • RPS27A
  • STUB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB2
  • BTC
  • CDC37
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FYN
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Regulates Cell Motility
  • BTC
  • DIAPH1
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • MEMO1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • RHOA
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC1
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB4
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB2
  • ERBB4
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB4
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
Regulation of Complement cascade
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • F2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • SERPING1
  • VTN
Sus scrofa (pig)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C4A
  • COLEC10
  • COLEC11
  • FCN1
  • FCN2
  • IGKV5-2
  • LOC100125542
  • LOC100523213
  • MASP1
  • MASP2
  • MBL2
Sus scrofa (pig)
Terminal pathway of complement
  • C5
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CLU
Sus scrofa (pig)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • CALM3
  • CAMKMT
  • CNGA1
  • CNGB1
  • GNB5
  • GRK1
  • GRK4
  • GRK7
  • GUCA1B
  • GUCY2D
  • METAP1
  • METAP2
  • NMT1
  • NMT2
  • PDE6A
  • PDE6G
  • PPEF1
  • RCVRN
  • RGS9
  • RGS9BP
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • CALM3
  • CAV1
  • CAV2
  • DTR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • IGF1R
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • NOS3
  • NR3A1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRMT1
  • S1PR3
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • STRN
Sus scrofa (pig)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CALM3
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • JUP
  • Jup
  • NOS3
  • PAK1
  • PAK2
  • PDPK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • CALM3
  • GAA
  • GYG1
  • GYG2
  • PHKA1
  • PHKA2
  • PHKB
  • PHKG2
  • PYGL
  • PYGM
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024