GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • CTSK
  • CTSL
Sus scrofa (pig)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS7
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL2
  • ADAMTSL3
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • B3GLCT
  • CFP
  • POFUT2
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SPON2
  • SSPOP
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD4
  • THSD7A
  • THSD7B
Sus scrofa (pig)
Generic Transcription Pathway
  • CCNC
  • CDK8
  • CRSP8
  • CRSP9
  • KRBA1
  • LOC100513362
  • LOC100513741
  • LOC100516085
  • LOC100516355
  • LOC100517149
  • LOC100517161
  • LOC100517751
  • LOC100519853
  • LOC100520720
  • LOC100520903
  • LOC100521069
  • LOC100525433
  • LOC100620238
  • LOC100626048
  • LOC100627241
  • LOC100737756
  • LOC100737823
  • LOC100738050
  • LOC100739480
  • LOC102164547
  • LOC102167305
  • LOC102167351
  • LOC110259370
  • LOC110261311
  • LOC110261312
  • LOC110261313
  • LOC110261321
  • MED1
  • MED10
  • MED12
  • MED13
  • MED14
  • MED15
  • MED16
  • MED17
  • MED20
  • MED23
  • MED24
  • MED25
  • MED26
  • MED27
  • MED30
  • MED4
  • MED6
  • MED7
  • MED8
  • PRDM7
  • TRIM28
  • ZBTB41
  • ZBTB48
  • ZFP1
  • ZFP14
  • ZFP2
  • ZFP28
  • ZFP37
  • ZFP69B
  • ZKSCAN1
  • ZKSCAN4
  • ZKSCAN5
  • ZKSCAN7
  • ZKSCAN8
  • ZNF10
  • ZNF112
  • ZNF114
  • ZNF133
  • ZNF140
  • ZNF16
  • ZNF175
  • ZNF18
  • ZNF180
  • ZNF181
  • ZNF184
  • ZNF189
  • ZNF200
  • ZNF202
  • ZNF205
  • ZNF213
  • ZNF23
  • ZNF235
  • ZNF248
  • ZNF25
  • ZNF26
  • ZNF263
  • ZNF274
  • ZNF282
  • ZNF286A
  • ZNF3
  • ZNF300
  • ZNF311
  • ZNF317
  • ZNF333
  • ZNF33B
  • ZNF34
  • ZNF354B
  • ZNF354C
  • ZNF383
  • ZNF394
  • ZNF397
  • ZNF445
  • ZNF446
  • ZNF45
  • ZNF471
  • ZNF483
  • ZNF484
  • ZNF496
  • ZNF529
  • ZNF546
  • ZNF550
  • ZNF555
  • ZNF558
  • ZNF565
  • ZNF566
  • ZNF567
  • ZNF568
  • ZNF569
  • ZNF577
  • ZNF582
  • ZNF583
  • ZNF594
  • ZNF596
  • ZNF599
  • ZNF606
  • ZNF614
  • ZNF619
  • ZNF621
  • ZNF624
  • ZNF658
  • ZNF662
  • ZNF664
  • ZNF668
  • ZNF672
  • ZNF684
  • ZNF688
  • ZNF689
  • ZNF697
  • ZNF70
  • ZNF703
  • ZNF704
  • ZNF706
  • ZNF71
  • ZNF713
  • ZNF74
  • ZNF75D
  • ZNF770
  • ZNF772
  • ZNF782
  • ZNF786
  • ZNF79
  • ZNF791
  • ZNF792
  • ZNF793
  • ZNF804B
  • ZNF839
  • ZNF883
  • ZSCAN25
Sus scrofa (pig)
Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade
  • CALM3
  • CAMKMT
  • CNGA1
  • CNGB1
  • GNB5
  • GRK1
  • GRK4
  • GRK7
  • GUCA1B
  • GUCY2D
  • METAP1
  • METAP2
  • NMT1
  • NMT2
  • PDE6A
  • PDE6G
  • PPEF1
  • RCVRN
  • RGS9
  • RGS9BP
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
Muscarinic acetylcholine receptors
  • CHRM1
  • CHRM2
  • CHRM3
  • CHRM4
  • CHRM5
Sus scrofa (pig)
MET Receptor Activation
  • HGF
  • HGFAC
  • HPN
  • MET
  • SPINT1
  • SPINT2
Sus scrofa (pig)
G alpha (12/13) signalling events
  • ABR
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AKAP13
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BTK
  • ECT2
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • GNA12
  • GNA13
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • ITSN1
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MCF2
  • MCF2L
  • NET1
  • NGEF
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PLXNB1
  • PREX1
  • RASGRF2
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SOS1
  • SOS2
  • TBXA2R
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TRIO
  • VAV1
  • VAV2
  • alpha-1A
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Regulates Cell Motility
  • BTC
  • DIAPH1
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • MEMO1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • RHOA
Sus scrofa (pig)
MET activates RAS signaling
  • GRB2
  • HGF
  • HRAS
  • KRAS
  • MET
  • MUC20
  • NRAS
  • RANBP10
  • RANBP9
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
Arachidonic acid metabolism
  • FAAH
  • FAAH1
Sus scrofa (pig)
Costimulation by the CD28 family
  • ICOSLG
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
Sus scrofa (pig)
MyD88-independent TLR4 cascade
  • CD14
  • LY96
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TLR4
Sus scrofa (pig)
MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane
  • ECSIT
  • MAP3K1
  • TIRAP
  • TRAF6
Sus scrofa (pig)
Keratan sulfate biosynthesis
  • ACAN
  • B3GNT2
  • B3GNT4
  • B3GNT7
  • B4GALT1
  • B4GALT2
  • B4GALT3
  • B4GALT4
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • B4GAT1
  • CHST1
  • CHST2
  • FMOD
  • KERA
  • LOC100522551
  • LUM
  • OGN
  • OMD
  • PRELP
  • SLC35D2
  • ST3GAL-III
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
Sus scrofa (pig)
Retinoid metabolism and transport
  • AGRN
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • APOM
  • ApoER2
  • BCO1
  • BCO2
  • CLPS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • LPL
  • LRAT
  • LRP10
  • LRP12
  • LRP8
  • PLB1
  • PNLIP
  • RBP1
  • RBP2
  • RBP4
  • RDH11
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TTR
Sus scrofa (pig)
Apoptotic execution phase
  • BCAP31
  • CASP8
  • DNM1L
  • STK24
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of MET activity
  • CBL
  • EPS15
  • GRB2
  • HGF
  • HGS
  • LRIG1
  • MET
  • PTPN1
  • PTPN2
  • RPS27A
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • STAM
  • STAM2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • USP8
Sus scrofa (pig)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • CNPY3
  • CTSB
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • HSP90B1
  • LGMN
  • TLR7
  • TLR8
  • TLR9
  • TNRC5
  • UNC93B1
Sus scrofa (pig)
Golgi Associated Vesicle Biogenesis
  • ACBD3
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP3B1
  • AP3S1
  • AP4B1
  • AP4E1
  • ARF1
  • ARRB1
  • BLOC1S3
  • BLOC1S6
  • CLTA
  • CLTC
  • CPD
  • DNM2
  • DTNBP1
  • GAK
  • GOLGB1
  • HIP1R
  • IGF2R
  • NAPA
  • NECAP1
  • OCRL
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PLDN
  • SNAPIN
  • SNX2
  • SNX5
  • SNX9
  • SORT1
  • TBC1D8B
  • TFRC
  • TPD52
  • TPD52L1
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
  • YIPF6
Sus scrofa (pig)
Signaling by Activin
  • ACVR1B
  • ACVR1C
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • MADH3
  • MADH4
  • MAPK1
  • MAPK3
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
PI Metabolism
  • TNFAIP8L2
Sus scrofa (pig)
GAB1 signalosome
  • AREG
  • BTC
  • CSK
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
  • PXN
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ACY1
  • BMDP
  • CNDP2
  • CYP2E1
  • GGT1
  • GGT6
  • GGT7
  • GSTT1
  • LOC100153094
  • LOC100511540
  • LOC100515741
  • LOC100516628
  • LOC100623255
  • LOC100623504
  • LOC100739163
  • LOC110262115
  • SULT1A3
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • UGT2B31
Sus scrofa (pig)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCG2A
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALB
  • BMDP
  • COX10
  • COX15
  • CPOX
  • FECH
  • FLVCR1
  • HMBS
  • PPOX
  • UROD
  • UROS
Sus scrofa (pig)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CALM3
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • JUP
  • Jup
  • NOS3
  • PAK1
  • PAK2
  • PDPK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024