GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 360 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Antimicrobial peptides
  • BPI
  • BPIFA1
  • BPIFA2
  • BPIFB1
  • BPIFB2
  • BPIFB4
  • CHGA
  • CLU
  • EPPIN
  • GNLY
  • LEAP2
  • LOC100154047
  • LOC100520832
  • LOC100624628
  • LOC102163838
  • LOC110255221
  • LOC110260309
  • LTF
  • PGLYRP1
  • PGLYRP2
  • PGLYRP3
  • PGLYRP4
  • PMAP-36
  • PRSS2
  • REG3G
  • try
Sus scrofa (pig)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ANOS1
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ANOS1
  • CBL
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • GRB2
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Assembly of active LPL and LIPC lipase complexes
  • ANGPTL3
  • ANGPTL4
  • ANGPTL8
  • FURIN
  • LIPC
  • LMF1
  • LMF2
  • LPL
  • PCSK6
  • PGAR
Sus scrofa (pig)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • FTZF1
  • HNF4A
  • HNF4G
  • MED1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOR-1
  • NR0B1
  • NR0B2
  • NR1A1
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR1I3
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2E1
  • NR2E3
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR4A3
  • NR5A1
  • NR5A2
  • NR6A1
  • PGR
  • PPARA
  • PPARD
  • PPARG
  • RARA
  • RORA
  • RORB
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • THRA
  • THRB
  • VDR
Sus scrofa (pig)
SUMOylation of intracellular receptors
  • AR
  • ESR
  • ESR1
  • FTZF1
  • HDAC4
  • NR1A1
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR1H4
  • NR1I1
  • NR1I2
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR5A1
  • NR5A2
  • PGR
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PPARA
  • RARA
  • RORA
  • RXRA
  • SMT3A
  • SMT3H2
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • THRA
  • THRB
  • UBE2I
  • VDR
Sus scrofa (pig)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH3
  • COL7A1
  • CTSZ
  • F5
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MIA2
  • MIA3
  • PREB
  • SAR1B
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • UABP-2
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
GAB1 signalosome
  • AREG
  • BTC
  • CSK
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • PAG1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTPN11
  • PXN
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
EGFR downregulation
  • AREG
  • ARHGEF7
  • BTC
  • CBL
  • CDC42
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EPN1
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGS
  • PTPN12
  • PTPN3
  • PTPRK
  • RPS27A
  • SH3GL1
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SPRY1
  • STAM
  • STAM2
  • TGFA
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IER3
  • IL1RL1
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH3
  • COL7A1
  • CTSZ
  • F5
  • FOLR1
  • FOLR3
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • SAR1B
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC5
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC9
  • UABP-2
  • USO1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Signaling by EGFR
  • AAMP
  • AREG
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • EREG
  • FAM83A
  • FAM83B
  • FAM83D
  • HBEGF
  • HEGFL
  • LRIG1
  • SRC
  • TGFA
Sus scrofa (pig)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
Sus scrofa (pig)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ATP6AP2
  • CES1
  • CTSD
  • CTSZ
  • ENPEP
  • LOC100154047
  • LOC100736962
  • MME
  • REN
Sus scrofa (pig)
RHOH GTPase cycle
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • CAV1
  • CSK
  • DBT
  • FAM91A1
  • JUP
  • Jup
  • LAMTOR1
  • LCK
  • MTR
  • NIPSNAP2
  • NSFL1C
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • RAB7A
  • RALGAPA1
  • RHOH
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SLC1A5
  • SLC4A7
  • STOM
  • TFRC
  • TMEM59
  • TUBA1B
  • UACA
  • VAMP3
  • VANGL1
  • WDR11
Sus scrofa (pig)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • MAOA
  • OCT2
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13B
  • VAMP2
Sus scrofa (pig)
Chemokine receptors bind chemokines
  • ACKR2
  • ACKR3
  • ACKR4
  • CCL1
  • CCL17
  • CCL2
  • CCL20
  • CCL21
  • CCL22
  • CCL25
  • CCL27
  • CCL3L1
  • CCL4
  • CCL5
  • CCR1
  • CCR10
  • CCR2
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR7
  • CCR9
  • CCRL1
  • CCRL2
  • CCXCR1
  • CXCL10
  • CXCL12
  • CXCL13
  • CXCL16
  • CXCL2
  • CXCL7
  • CXCL8
  • CXCL9
  • CXCR2
  • CXCR3
  • CXCR4
  • CXCR5
  • CXCR6
  • IL8
  • LOC100525396
  • MIP1B
  • PPBP
  • SCY4A
  • SCYA2
  • SCYB7
  • XCL1
  • XCR1
Sus scrofa (pig)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • HDAC6
  • MEC17
Sus scrofa (pig)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANBA
Sus scrofa (pig)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GLUT1
  • LALBA
  • SLC2A1
Sus scrofa (pig)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSD
  • ARSG
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • LOC100621771
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Sus scrofa (pig)
Digestion of dietary carbohydrate
  • AMY2
  • CHIA
  • CHIT1
  • LCT
  • LOC100153446
  • LOC100521789
  • LOC100625897
  • MGAM
  • SI
Sus scrofa (pig)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024