GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1 - 25 of 361 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Regulation of RUNX3 expression and activity
  • ADRM1
  • CBFB
  • EP300
  • MDM2
  • PRORP
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB3
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC3
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • RUNX3
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SRC
  • TGFB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB4
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
Retinoid metabolism and transport
  • AGRN
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • APOM
  • ApoER2
  • BCO1
  • BCO2
  • CLPS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • LPL
  • LRAT
  • LRP10
  • LRP12
  • LRP8
  • PLB1
  • PNLIP
  • RBP1
  • RBP2
  • RBP4
  • RDH11
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TTR
Sus scrofa (pig)
Interleukin-7 signaling
  • BRWD1
  • CRLF2
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • HIST1H3E
  • IL2RG
  • IL7
  • IL7R
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK1
  • JAK3
  • LOC110257900
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SMARCA4
  • STAT3
  • STAT5A
  • STAT5B
  • stat5B
Sus scrofa (pig)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • DES
  • DMD
  • MLC-2V
  • MLC2V
  • MYBPC2
  • MYBPC3
  • MYH3
  • MYH8
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL3
  • MYL4
  • NEB
  • PALLD
  • TCAP
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TPM2
  • TPM4
  • VIM
Sus scrofa (pig)
CDC42 GTPase cycle
  • ABR
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BAIAP2
  • BCR
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42EP5
  • CDC42SE2
  • CHN1
  • CPNE8
  • DAAM1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DNMBP
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • ECT2
  • FAM13B
  • FARP1
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FMNL1
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • GOLGA2
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • Jup
  • KCTD3
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MAP3K11
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9B
  • NGEF
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD1
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • PREX2
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • SCRIB
  • SH3PXD2A
  • SHKBP1
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • STARD8
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TAGAP
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASL
  • WDR81
  • WDR91
  • WIPF1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Sus scrofa (pig)
Golgi Associated Vesicle Biogenesis
  • ACBD3
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S3
  • AP3B1
  • AP3S1
  • AP4B1
  • AP4E1
  • ARF1
  • ARRB1
  • BLOC1S3
  • BLOC1S6
  • CLTA
  • CLTC
  • CPD
  • DNM2
  • DTNBP1
  • GAK
  • GOLGB1
  • HIP1R
  • IGF2R
  • NAPA
  • NECAP1
  • OCRL
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PLDN
  • SNAPIN
  • SNX2
  • SNX5
  • SNX9
  • SORT1
  • TBC1D8B
  • TFRC
  • TPD52
  • TPD52L1
  • TXNDC5
  • VAMP2
  • VAMP8
  • YIPF6
Sus scrofa (pig)
Negative regulation of FGFR4 signaling
  • CBL
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR4
  • Fgf4
  • GRB2
  • KLB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
PI3K/AKT Signaling
  • AREG
  • BDNF
  • BTC
  • CD28
  • CD80
  • CD80/B7-1
  • CD86
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HGF
  • IL1RL1
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • NR3A1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NTF3
  • NTF4
  • NTRK3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRR5
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHOG
  • RICTOR
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • VAV1
Sus scrofa (pig)
Signal regulatory protein family interactions
  • CD47
  • DAP12
  • FYB1
  • GRB2
  • LOC100736623
  • LOC100739707
  • LOC102161654
  • PTK2B
  • SIRPA
  • SKAP2
  • TYROBP
Sus scrofa (pig)
G alpha (q) signalling events
  • A4
  • AD1
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AGT
  • AGTR1
  • ANXA1
  • APP
  • ARHGEF25
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • BTK
  • CASR
  • CCK
  • CCKAR
  • CCXCR1
  • CHRM1
  • CHRM3
  • CHRM5
  • CYSLTR1
  • EDG7
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • FFAR1
  • FFAR2
  • FFAR4
  • GCG
  • GCGR
  • GHRL
  • GHSR
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • GPR120
  • GPR132
  • GPR143
  • GPR17
  • GPR39
  • GPR54
  • GPR68
  • GPRC6A
  • GRK2
  • GRM1
  • GRM5
  • GRP
  • GRPR
  • HCRT
  • HCRTR1
  • HCRTR2
  • HRH1
  • HTR2A
  • HTR2B
  • HTR2C
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR4
  • LPAR5
  • LPAR6
  • LTB4R
  • LTB4R2
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • NKNB
  • NMB
  • NMBR
  • NMU
  • NMUR1
  • NPFFR1
  • NPFFR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • O3FAR1
  • OPN4
  • ORX
  • OX
  • OXT
  • OXTR
  • P2RY1
  • P2RY10
  • P2RY11
  • P2RY2
  • P2RY6
  • PCAR1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PMCH
  • PPOX
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR1
  • PROKR2
  • PTAFR
  • PTGER1
  • PTGFR
  • QRFPR
  • RGS1
  • RGS13
  • RGS16
  • RGS17
  • RGS18
  • RGS19
  • RGS2
  • RGS4
  • RGS5
  • RGSL1
  • TAC3
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
  • TBXA2R
  • TRH
  • TRHR
  • TRIO
  • UTS2
  • UTS2R
  • XCL1
  • XCR1
  • alpha-1A
  • fp
Sus scrofa (pig)
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • APOB
  • CD14
  • CD36
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • LBP
  • LY96
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TLR7
Sus scrofa (pig)
RIPK1-mediated regulated necrosis
  • FLOT1
  • FLOT2
  • MLKL
  • PDCD6IP
  • RIPK1
  • RIPK3
  • SDCBP
Sus scrofa (pig)
RHOA GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP19
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP23
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP28
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • ARHGAP8
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF3
  • ARHGEF5
  • ARHGEF7
  • ATP6AP1
  • BCAP31
  • BCR
  • C1QBP
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CCDC115
  • CIT
  • DAAM1
  • DDRGK1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DOCK2
  • ECT2
  • FAF2
  • FAM13A
  • FARP1
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL3
  • GMIP
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • KTN1
  • LBR
  • LMAN1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9A
  • MYO9B
  • NET1
  • NGEF
  • OPHN1
  • PCDH7
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PLD1
  • PLEKHG3
  • PLEKHG5
  • PLEKHG6
  • PREX1
  • PREX2
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • RHOA
  • RHPN1
  • RHPN2
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SCFD1
  • SLK
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • STARD8
  • STOM
  • TAGAP
  • TEX2
  • TFRC
  • TIAM1
  • TJP2
  • TMEM57
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV1
  • VAV2
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
Regulation by c-FLIP
  • APT1
  • CASP8
  • CASP9
  • FADD
  • FAS
  • LOC100624226
  • LOC100737977
  • RIPK1
  • TNFRSF6
  • TRADD
  • TRAF2
Sus scrofa (pig)
Generic Transcription Pathway
  • CCNC
  • CDK8
  • CRSP8
  • CRSP9
  • KRBA1
  • LOC100513362
  • LOC100513741
  • LOC100516085
  • LOC100516355
  • LOC100517149
  • LOC100517161
  • LOC100517751
  • LOC100519853
  • LOC100520720
  • LOC100520903
  • LOC100521069
  • LOC100525433
  • LOC100620238
  • LOC100626048
  • LOC100627241
  • LOC100737756
  • LOC100737823
  • LOC100738050
  • LOC100739480
  • LOC102164547
  • LOC102167305
  • LOC102167351
  • LOC110259370
  • LOC110261311
  • LOC110261312
  • LOC110261313
  • LOC110261321
  • MED1
  • MED10
  • MED12
  • MED13
  • MED14
  • MED15
  • MED16
  • MED17
  • MED20
  • MED23
  • MED24
  • MED25
  • MED26
  • MED27
  • MED30
  • MED4
  • MED6
  • MED7
  • MED8
  • PRDM7
  • TRIM28
  • ZBTB41
  • ZBTB48
  • ZFP1
  • ZFP14
  • ZFP2
  • ZFP28
  • ZFP37
  • ZFP69B
  • ZKSCAN1
  • ZKSCAN4
  • ZKSCAN5
  • ZKSCAN7
  • ZKSCAN8
  • ZNF10
  • ZNF112
  • ZNF114
  • ZNF133
  • ZNF140
  • ZNF16
  • ZNF175
  • ZNF18
  • ZNF180
  • ZNF181
  • ZNF184
  • ZNF189
  • ZNF200
  • ZNF202
  • ZNF205
  • ZNF213
  • ZNF23
  • ZNF235
  • ZNF248
  • ZNF25
  • ZNF26
  • ZNF263
  • ZNF274
  • ZNF282
  • ZNF286A
  • ZNF3
  • ZNF300
  • ZNF311
  • ZNF317
  • ZNF333
  • ZNF33B
  • ZNF34
  • ZNF354B
  • ZNF354C
  • ZNF383
  • ZNF394
  • ZNF397
  • ZNF445
  • ZNF446
  • ZNF45
  • ZNF471
  • ZNF483
  • ZNF484
  • ZNF496
  • ZNF529
  • ZNF546
  • ZNF550
  • ZNF555
  • ZNF558
  • ZNF565
  • ZNF566
  • ZNF567
  • ZNF568
  • ZNF569
  • ZNF577
  • ZNF582
  • ZNF583
  • ZNF594
  • ZNF596
  • ZNF599
  • ZNF606
  • ZNF614
  • ZNF619
  • ZNF621
  • ZNF624
  • ZNF658
  • ZNF662
  • ZNF664
  • ZNF668
  • ZNF672
  • ZNF684
  • ZNF688
  • ZNF689
  • ZNF697
  • ZNF70
  • ZNF703
  • ZNF704
  • ZNF706
  • ZNF71
  • ZNF713
  • ZNF74
  • ZNF75D
  • ZNF770
  • ZNF772
  • ZNF782
  • ZNF786
  • ZNF79
  • ZNF791
  • ZNF792
  • ZNF793
  • ZNF804B
  • ZNF839
  • ZNF883
  • ZSCAN25
Sus scrofa (pig)
FGFR1c ligand binding and activation
  • ANOS1
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFR1
  • Fgf4
  • TGFBR3
Sus scrofa (pig)
Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • DRA
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100153139
  • PTPN22
  • SLA-DQA
  • SLA-DQA1
  • SLA-DQB1
  • SLA-DR
  • SLA-DRA
  • SLA-DRA1
  • SLA-DRB1
Sus scrofa (pig)
TNFR1-induced proapoptotic signaling
  • BIRC2
  • CYLD
  • FADD
  • IKBKE
  • MIB2
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • PIAP
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RNF31
  • SPATA2
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF6
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • USP2
  • USP21
  • USP4
Sus scrofa (pig)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • ASAP1
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • PKD1
  • PKD2
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8A
  • RHO
  • RHO1
Sus scrofa (pig)
Vasopressin-like receptors
  • AVP
  • AVPR1A
  • AVPR1B
  • AVPR2
  • OXT
  • OXTR
Sus scrofa (pig)
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade
  • EEA1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • RBSN
  • TLR9
Sus scrofa (pig)
G alpha (s) signalling events
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • ADM
  • ADM2
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRB1
  • ADRB2
  • ADRB3
  • AM
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BAR3
  • CALCB
  • CALCR
  • CGA
  • CRH
  • CRHR1
  • CRHR2
  • CRSP3
  • DRD5
  • FSHB
  • FSHR
  • GCG
  • GCGR
  • GHRH
  • GHRHR
  • GIP
  • GIPR
  • GLP1R
  • GLP2R
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GPBAR1
  • GPR15
  • GPR150
  • GPR20
  • GPR27
  • GPR32
  • GPR39
  • GPR45
  • GPR83
  • GPR84
  • GRK2
  • GRK3
  • GRK5
  • GRK6
  • HRH2
  • HTR4
  • HTR6
  • HTR7
  • INSL3
  • INSL7
  • LHB
  • LHCGR
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • NPS
  • NPSR1
  • P2RY11
  • PDE10A
  • PDE11A
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE2A
  • PDE3A
  • PDE3B
  • PDE4A
  • PDE4C
  • PDE4D
  • PDE7A
  • PDE7B
  • PDE8A
  • PDE8B
  • POMC
  • PTGDR
  • PTGER2
  • PTGER4
  • PTGIR
  • PTH
  • PTH1R
  • PTH2
  • PTH2R
  • PTHLH
  • PTHR
  • PTHR1
  • RAMP1
  • RAMP2
  • RAMP3
  • RLF
  • RLN3
  • RXFP1
  • RXFP2
  • SCT
  • SCTR
  • TSHB
  • TSHR
  • VIP
  • VIPR1
  • VIPR2
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.1

Last updated: February 17, 2025