GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 145 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Hyaluronan biosynthesis and export
  • XHas2
  • abcc5
  • has1
  • has1l
  • has2
  • has3
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Triglyceride biosynthesis
  • agmo
  • dgat1
  • dgat2
  • gk
  • gk1
  • gk2
  • gkd
  • gpam
  • gpat
  • gpat1
  • gyk
  • lpin1
  • lpin2
  • mogat1
  • mogat2.2
  • mogat3
  • pap1
  • tmem195
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • LOC100145370
  • LOC100490589
  • LOC101732366
  • LOC101733637
  • bg37
  • chemerinr
  • chemr23
  • cmklr1
  • cnr1
  • cnr2
  • dez
  • gpbar1
  • gpcr19
  • gpr131
  • gpr132
  • gpr18
  • gpr183.2
  • gpr68
  • m-bar
  • pafr
  • ptafr
  • tgr5
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • LOC100036633
  • LOC100145619
  • LOC100490088
  • LOC100492280
  • LOC100497990
  • LOC496414
  • adamts14
  • adamts3
  • col11a2
  • col11a2p1
  • col12a1
  • col17a1
  • col19a1
  • col1a1
  • col1a2
  • col20a1
  • col27a1
  • col28a1
  • col2a1
  • col3a1
  • col4a1
  • col4a2
  • col4a6
  • col5a1
  • col5a2
  • col6a3
  • col7a1
  • col9a1
  • col9a2
  • col9a3
  • colgalt1
  • colgalt2
  • dsi
  • erba2l
  • git
  • oi4
  • otol1
  • p3h2
  • p4ha1
  • p4ha2
  • p4ha3
  • p4hb
  • pdi
  • pdia1
  • plod1
  • plod2
  • plod3
  • po4db
  • po4hb
  • prohb
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • FGF-8
  • HBGF-1
  • HBGF-2
  • HBGF-4
  • INT-2
  • LOC100216108
  • LOC548926
  • MGC89679
  • RPS27A
  • X1FGFR
  • XEFGF
  • XFGFR-1
  • XSNT
  • Xfgf-4
  • Xfgf-8
  • Xfgf4
  • Xfgf8
  • aFGF
  • admlx
  • aigf
  • anos1
  • bfgf
  • bfgfr
  • cd331
  • cek
  • cep52
  • ecgf
  • ecgf-beta
  • ecgfa
  • ecgfb
  • efgf
  • erk
  • erk2
  • ert1
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-2
  • fgf-3
  • fgf-4
  • fgf-6
  • fgf-8b
  • fgf-alpha
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf23.1
  • fgf23.2
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf4-a
  • fgf4-b
  • fgf5
  • fgf6
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgf8b
  • fgf9
  • fgfa
  • fgfb
  • fgfbr
  • fgfe
  • fgfr-1
  • fgfr1
  • fgfr1-a
  • fgfr1-b
  • flg
  • flt-2
  • flt2
  • frs2
  • frs2a
  • frs2alpha
  • glio703
  • grb2
  • hbgf-3
  • hbgf-6
  • hbgf-8
  • hbgf1
  • hbgfr
  • hbgh-2
  • hha
  • hmg20
  • hst
  • hst-1
  • hst2
  • hstf1
  • hubcep52
  • int2
  • k-fgf
  • kal
  • kal1
  • kal2
  • kalig-1
  • kfgf
  • kl
  • kms
  • mapk
  • mapk1
  • mapk1-a
  • mapk1-b
  • mapk2
  • mpk1
  • n-sam
  • ogd
  • p38
  • p40
  • p41
  • p41mapk
  • p42mapk
  • prkm1
  • prkm2
  • ptpn11
  • rpl40
  • rps27a
  • snt
  • snt-1
  • snt1
  • uba52
  • ubc
  • ubi-p63e
  • xfgf2
  • xfgf3
  • xfgfr1
  • xfrs2
  • xp42
  • xsrf2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Phase 4 - resting membrane potential
  • LOC100145504
  • LOC101731658
  • k2p1.1
  • k2p6.1
  • kcnj12
  • kcnj14
  • kcnj2
  • kcnj4
  • kcnk1
  • kcnk10
  • kcnk12
  • kcnk15
  • kcnk16
  • kcnk18
  • kcnk2
  • kcnk3
  • kcnk4
  • kcnk5
  • kcnk6
  • kcnk8
  • kcnk9
  • toss
  • twik-1
  • twik-2
  • twik1
  • twik2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • ADAM10
  • BMP-4
  • DVR-4
  • FN
  • IBP-5
  • IGF-II
  • IGFBP-5
  • LOC100127642
  • LOC100127808
  • LOC100135142
  • LOC100145530
  • LOC100170611
  • LOC100491968
  • LOC101730424
  • LOC496744
  • MGC107849
  • MGC107972
  • MGC107982
  • MGC147359
  • MGC147562
  • MGC89905
  • N-Cad
  • N-cadherin
  • TIMP1
  • XBMP-4
  • Xcyr61
  • a2hs
  • aaa
  • abeta
  • abpp
  • ad1
  • ad10
  • adai
  • adam10
  • afbp
  • ahs
  • ahsg
  • ai1c
  • aih1
  • aih2
  • alb
  • alb-a
  • alb-b
  • algn
  • ambn
  • amel
  • amelogenin
  • amelx
  • amelx-a
  • amelx-b
  • amg
  • amgl
  • amgx
  • ano8
  • apoa-v
  • apoa5
  • apoav
  • apoe
  • app
  • appi
  • atp6v0b-prov
  • axllg
  • axsf
  • bmp-4
  • bmp15
  • bmp2b
  • bmp2b1
  • bmp4
  • bmp4-a
  • bmp4-b
  • bpifb2
  • c4a
  • c4a2
  • c4a3
  • c4a4
  • c4a6
  • c4b
  • c4s
  • cadherin-2
  • calnuc
  • calu
  • ccn1
  • cd156c
  • cdh2
  • cdh2-a
  • cdh2-b
  • cdhn
  • cdw325
  • cg1
  • chgc
  • chl
  • chrdl1
  • cig
  • ckap4
  • co4
  • cp
  • cpamd2
  • ctfgamma
  • cvap
  • cyr61
  • da141h5
  • da141h5.1
  • dnajc3
  • dsi
  • ecgp
  • enam
  • erba2l
  • erp5
  • fam20a
  • fam20c
  • fetua
  • fga
  • fgf23.1
  • fgf23.2
  • fibronectin
  • finc
  • flrg
  • fn1
  • frp
  • fsl1
  • fsrp
  • fstl1
  • fstl3
  • fuca2
  • gas6
  • gig1
  • git
  • gp96
  • gpc3
  • grp94
  • hcf2
  • hcii
  • higfbp-1
  • hls2
  • hsga
  • hsp90b1
  • hspg
  • hspg1
  • ibp1
  • ibp5
  • igf-2
  • igf-bp25
  • igf1
  • igf2
  • igf2-a
  • igf2-b
  • igfbp1
  • igfbp1-a
  • igfbp1-b
  • igfbp10
  • igfbp2
  • igfbp4
  • igfbp5
  • il6
  • insigf
  • itih2
  • kng1
  • knt
  • ktn1
  • kuz
  • kuzbanian
  • lets
  • lgals1.1
  • ltbp1
  • madm
  • matn3
  • mbtps1
  • mgat4a
  • mia3
  • msf
  • msln
  • mxra8
  • ncad
  • nrln1
  • nuc
  • nucb1
  • ofc11
  • p4hb
  • pappa
  • pappa2
  • pcsk8
  • pcsk9
  • pdi
  • pdia1
  • pdia6
  • pdia6-a
  • pdia6-b
  • pdip5
  • penk
  • pig20
  • pn2
  • pnpla2
  • po4db
  • po4hb
  • pp12
  • pp9974
  • prkcsh
  • proc
  • proc1
  • prohb
  • prss23
  • qsox1
  • rap3
  • rcal
  • rcn
  • rcn1
  • rundc3a
  • s1p
  • scg2
  • scg3
  • sdc2
  • sdc2-a
  • sdc2-b
  • serpina10
  • serpinc1
  • serpind1
  • sgii
  • ski-1
  • sparc
  • stc2
  • sumo3
  • synd2
  • syndecan-2
  • tf
  • timp-1
  • timp1
  • tnc
  • tra1
  • txndc7
  • vcan
  • vopt
  • vwa1
  • wfs1
  • xFRP
  • xIGFBP-5
  • xadam10
  • xbmp4
  • zyme
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Assembly of active LPL and LIPC lipase complexes
  • hdlcq12
  • htgl
  • lipc
  • liph
  • lmf1
  • lmf2
  • lpl
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Extracellular matrix organization
  • FN
  • cig
  • fibronectin
  • finc
  • fn1
  • lets
  • msf
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
TCF dependent signaling in response to WNT
  • B-catenin
  • beta-catenin
  • ctnnb
  • ctnnb1
  • ctnnb1-a
  • ctnnb1-b
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Noncanonical activation of NOTCH3
  • X-PS-alpha
  • X-PS-beta
  • X-ps-a
  • X-ps-b
  • ad3
  • ad3l
  • ad4
  • aph-1a
  • aph1a
  • bp-8
  • cgi-78
  • csda2
  • csdb
  • dbpb
  • fad
  • frgy1
  • mdr-nf1
  • mds033
  • mstp064
  • ncstn
  • notch1
  • nsep-1
  • nsep1
  • pen-2
  • pen2
  • ps-a
  • ps-alpha
  • ps-b
  • ps-beta
  • ps1
  • ps2
  • psen1
  • psen2
  • psenen
  • rgd1312037
  • s182
  • stm2
  • yb-1
  • yb1
  • ybx1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Synthesis of PC
  • LOC100145047
  • LOC100145186
  • LOC100158578
  • PEMT
  • abhd3
  • bchel
  • cept1
  • chka
  • chkb
  • chpt1
  • ctl5
  • labh3
  • lpcat1
  • lpin1
  • lpin2
  • mfsd2
  • mfsd2a
  • mgc108095
  • nls1
  • pap1
  • pcyt1a
  • pemt
  • phospho1
  • slc44a1
  • slc44a2
  • slc44a4
  • slc44a5
  • stard10
  • stard7
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds
  • LOC100489305
  • LOC100489463
  • ctl5
  • mate1
  • slc10a6
  • slc14a2
  • slc44a1
  • slc44a2
  • slc44a4
  • slc44a5
  • slc47a1
  • slc5a7
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Ca2+ pathway
  • Fz-2
  • Fz-3
  • Go
  • LOC100038286
  • LOC100124978
  • LOC733883
  • MAPKKK
  • MGC145965
  • XGB1
  • XGalpha01
  • XGbeta1
  • Xfz2
  • Xfz3
  • Xnlk
  • camk2
  • camk2a
  • camkII
  • camka
  • frizzled-2
  • frizzled-3
  • frizzled2
  • frizzled3
  • frz-3
  • frz3
  • fz2
  • fz3
  • fzd2
  • fzd3
  • fzd4
  • fzd5
  • g-alpha-o
  • g0a
  • g0alpha
  • ga0
  • gao
  • gnao
  • gnao1
  • gnb1
  • gnb2
  • gnb3
  • gnb4
  • gnb5
  • gng10
  • gng12
  • gng2
  • gng3
  • gng4
  • gng7
  • gng7-a
  • gng7-b
  • gngt1
  • gngt2.1
  • hfz3
  • map3k7
  • nlk
  • nlk1
  • pde6a
  • pde6b
  • pi-plc
  • plc-154
  • plc-i
  • plc154
  • plcb1
  • plcb2
  • plcb3
  • tak1
  • wnt11
  • wnt11r
  • wnt5a
  • xTAK1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • mdk
  • notch1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Insulin receptor signalling cascade
  • grb2
  • insr
  • sos1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Antimicrobial peptides
  • LOC100127565
  • LOC100127857
  • LOC100135369
  • LOC100145529
  • LOC100485189
  • LOC101730988
  • LOC101732100
  • LOC105945797
  • LOC116407060
  • LOC116412104
  • MGC108117
  • PGRP-L
  • bpi
  • bpifb2
  • cgl.1
  • cgl.2
  • chga
  • clec19a
  • ctsg
  • ela2
  • elas2
  • pglyrp
  • pglyrp1
  • pglyrp1-like.1
  • pglyrp1l
  • pglyrp2
  • pgrp
  • pgrp-s
  • pgrps
  • pla2
  • pla2a
  • pla2g1b
  • pla2g1bl
  • ppla2
  • prss2
  • prtn3
  • tag7
  • tnfsf3l
  • tpsb2
  • try10
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Lectin pathway of complement activation
  • LOC100038300
  • LOC100496945
  • LOC105947509
  • LOC116406488
  • MGC107780
  • masp-1
  • masp-2
  • masp1
  • masp2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
PI-3K cascade:FGFR1
  • FGF-8
  • HBGF-1
  • HBGF-2
  • HBGF-4
  • INT-2
  • LOC100144924
  • PI3-kinase
  • PI3K-alpha
  • X1FGFR
  • XEFGF
  • XFGFR-1
  • XSNT
  • Xfgf-4
  • Xfgf-8
  • Xfgf4
  • Xfgf8
  • aFGF
  • aigf
  • bfgf
  • bfgfr
  • cd331
  • cek
  • ecgf
  • ecgf-beta
  • ecgfa
  • ecgfb
  • efgf
  • fgf-1
  • fgf-10
  • fgf-2
  • fgf-3
  • fgf-4
  • fgf-6
  • fgf-8b
  • fgf-alpha
  • fgf1
  • fgf10
  • fgf2
  • fgf22
  • fgf23.1
  • fgf23.2
  • fgf3
  • fgf4
  • fgf4-a
  • fgf4-b
  • fgf5
  • fgf6
  • fgf8
  • fgf8a
  • fgf8b
  • fgf9
  • fgfa
  • fgfb
  • fgfbr
  • fgfe
  • fgfr-1
  • fgfr1
  • fgfr1-a
  • fgfr1-b
  • flg
  • flt-2
  • flt2
  • frs2
  • frs2a
  • frs2alpha
  • gab1
  • glio703
  • grb2
  • hbgf-3
  • hbgf-6
  • hbgf-8
  • hbgf1
  • hbgfr
  • hbgh-2
  • hst
  • hst-1
  • hst2
  • hstf1
  • int2
  • k-fgf
  • kal2
  • kfgf
  • kl
  • n-sam
  • ogd
  • pi3-k
  • pi3k
  • pik3ca
  • pik3r1
  • ptpn11
  • snt
  • snt-1
  • snt1
  • xfgf2
  • xfgf3
  • xfgfr1
  • xfrs2
  • xsrf2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Signal transduction by L1
  • Rac1
  • X1FGFR
  • XFGFR-1
  • Xrac
  • bfgfr
  • cd29
  • cd304
  • cd331
  • cd51
  • cek
  • egfr
  • fgfbr
  • fgfr-1
  • fgfr1
  • fgfr1-a
  • fgfr1-b
  • flg
  • flt-2
  • flt2
  • fnrb
  • gpiia
  • hbgfr
  • itga2b.1
  • itga2b.2
  • itga5
  • itga9
  • itgav
  • itgav-a
  • itgav-b
  • itgb1
  • itgb1-a
  • itgb1-b
  • itgb3
  • kal2
  • mdf2
  • mig5
  • msk12
  • msk8
  • n-sam
  • ncam2
  • ncam21
  • neuropilin
  • np-1
  • npn-1
  • nrp
  • nrp-1
  • nrp1
  • ogd
  • p21-rac1
  • pNPG152
  • pak1
  • rac
  • rac1
  • tc-25
  • vegf165r
  • vla-beta
  • vlab
  • vnra
  • xfgfr1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • man1a1
  • man1a2
  • man1c1
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG6
  • LOC100127746
  • LOC496948
  • LOC549862
  • alg13
  • alg13l
  • alg14
  • alg2
  • alg3
  • alg6
  • alg8
  • alg9
  • cdgii
  • dpagt1
  • halpg2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Tandem of pore domain in a weak inwardly rectifying K+ channels (TWIK)
  • LOC100145504
  • k2p1.1
  • k2p6.1
  • kcnk1
  • kcnk6
  • kcnk8
  • toss
  • twik-1
  • twik-2
  • twik1
  • twik2
Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Ion channel transport
  • LOC100170603
  • MGC89120
  • Vma7
  • a3
  • ac45
  • arcl
  • atp60va2
  • atp6a1
  • atp6a2
  • atp6ap1
  • atp6ap1.2
  • atp6b1
  • atp6c
  • atp6e
  • atp6f
  • atp6h
  • atp6i
  • atp6ip1
  • atp6l
  • atp6n1b
  • atp6n1d
  • atp6n2
  • atp6s1
  • atp6s14
  • atp6v0a1
  • atp6v0a2
  • atp6v0a4
  • atp6v0b
  • atp6v0c
  • atp6v0d1
  • atp6v0d2
  • atp6v0e
  • atp6v0e1
  • atp6v1a
  • atp6v1a1
  • atp6v1b1
  • atp6v1b2
  • atp6v1c1
  • atp6v1c2
  • atp6v1e
  • atp6v1e1
  • atp6v1f
  • atp6v1f-a
  • atp6v1f-b
  • atp6v1g1
  • atp6v1g3
  • atp6v1h
  • atpl
  • atpv1a
  • ductin
  • hatpl
  • ho68
  • j6b7
  • m9.2
  • oc116
  • optb1
  • rdrta2
  • rta1b
  • rta1c
  • rtadr
  • sh3bgrl
  • stv1
  • tbc1d24.1
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Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)
Cell surface interactions at the vascular wall
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Xenopus tropicalis (tropical clawed frog)

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Last updated: August 19, 2024