GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 301 - 325 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPI
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • C15H11orf34
  • CD52
  • CEACAM1
  • CNTN3
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CPM
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • FOLR2
  • GP2
  • GPIHBP1
  • GPLD1
  • LOC100336941
  • LOC100850276
  • LOC516378
  • LOC528262
  • LOC783508
  • LSAMP
  • LY6D
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6H
  • LYPD1
  • LYPD2
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD8
  • MDGA1
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NT
  • NTM
  • OBCAM
  • OCAM
  • OPCML
  • OTOA
  • PRND
  • PRSS21
  • PSCA
  • RECK
  • RTN4RL2
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTA
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • ULBP13
  • ULBP17
  • ULBP21
  • VNN1
  • VNN2
  • XPNPEP2
Bos taurus (cattle)
Mitochondrial protein import
  • AAC1
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT3
  • ATP5F1B
  • ATP5G1
  • ATP5G3
  • ATP5MC1
  • ATP5MC3
  • COQ2
  • FRDA
  • FXN
  • HSCB
  • HSPD1
  • LDHD
  • NDUFB8
  • OTC
  • PITRM1
  • SLC25A4
  • SLC25A6
  • TAFAZZIN
  • TAZ
  • TIM10
  • TIM22
  • TIM23
  • TIMM10
  • TIMM17A
  • TIMM17B
  • TIMM22
  • TIMM23
  • TIMM9
Bos taurus (cattle)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • CPLX1
  • MAOA
  • OCT1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1
  • ATM
  • COP1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SUG1
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
N-glycan trimming and elongation in the cis-Golgi
  • MANEA
  • MGAT1
Bos taurus (cattle)
Neurotransmitter clearance
  • OCT1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
Bos taurus (cattle)
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • CLCF1
  • CNTF
  • CNTFR
  • CTF1
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • LIF
  • LIFR
  • OSM
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • AZIN1
  • NQO1
  • OAZ1
  • OAZ2
  • ODC
  • ODC1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • SUG1
  • TRAP2
Bos taurus (cattle)
Electric Transmission Across Gap Junctions
  • GJA10
  • GJA7
  • GJA9
  • GJC1
  • GJD2
  • PANX
  • PANX1
  • PANX2
Bos taurus (cattle)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • BET1
  • CD59
  • CNIH
  • CNIH1
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • F8
  • FOLR3
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • HCKID
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PI
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1A
  • RAB1B
  • SAPS3
  • SAR1B
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22A
  • SEC22B
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • SNAPB
  • STX17
  • STX5
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMP21
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC5
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • VDP
  • VIPL
  • YKT6
Bos taurus (cattle)
Costimulation by the CD28 family
  • ICOS
  • ICOSLG
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
Bos taurus (cattle)
Bicarbonate transporters
  • AHCYL2
  • SLC4A1
  • SLC4A10
  • SLC4A2
  • SLC4A3
  • SLC4A4
  • SLC4A5
  • SLC4A7
  • SLC4A8
  • SLC4A9
Bos taurus (cattle)
Citric acid cycle (TCA cycle)
  • ACO2
  • CS
  • CYB560
  • FH
  • HSP75
  • HSPC5
  • IDH2
  • IDH3A
  • IDH3B
  • IDH3G
  • MDH2
  • NNT
  • SDHA
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SUCLA2
  • SUCLG1
  • SUCLG2
  • TRAP1
Bos taurus (cattle)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNA7
  • CHRNA9
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
Bos taurus (cattle)
Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane
  • AAC1
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • ARL2
  • ARL2BP
  • BART1
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SLC28A1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • SLC29A3
  • SLC29A4
Bos taurus (cattle)
Thyroxine biosynthesis
  • CGA
  • DUOX1
  • DUOX2
  • IYD
  • SLC5A5
  • TPO
  • TSHB
Bos taurus (cattle)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
Bos taurus (cattle)
RHOF GTPase cycle
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ADD3
  • AKAP12
  • ARHGAP1
  • ARHGAP12
  • ARHGAP32
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • BAIAP2L1
  • BAIAP2L2
  • BASP1
  • CAV1
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH2
  • DIAPH3
  • ESYT1
  • FAM169A
  • FAM62A
  • FARP1
  • LMNB1
  • MCAM
  • MTMR1
  • MYO9B
  • NAP22
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHOF
  • SENP1
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • STEAP3
  • SYDE1
  • TOR1AIP1
  • VANGL1
Bos taurus (cattle)
Cristae formation
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5D
  • ATP5E
  • ATP5F
  • ATP5F1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1D
  • ATP5F1E
  • ATP5G1
  • ATP5G3
  • ATP5H
  • ATP5I
  • ATP5J
  • ATP5J2
  • ATP5MC1
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PB
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP5S
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • ATPW
  • DMAC2L
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
Bos taurus (cattle)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • HYAL3
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
Bos taurus (cattle)
CLEC7A (Dectin-1) signaling
  • BCL10
  • CARD9
  • CDC34
  • CHUK
  • CLEC7A
  • CUL1
  • FBXW11
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PLCG2
  • PRKCD
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SRC
  • SUG1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • AMOT
  • ANGPTL4
  • CDH11
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
Bos taurus (cattle)
Generic Transcription Pathway
  • BORIS
  • CCNC
  • CDK8
  • CRSP6
  • CRSP8
  • ELOVL1
  • GLI4
  • KRBA1
  • LOC100124429
  • LOC100125304
  • LOC100139104
  • LOC100139345
  • LOC100299712
  • LOC100336208
  • LOC100336448
  • LOC100336984
  • LOC100847180
  • LOC100847773
  • LOC100848895
  • LOC101907883
  • LOC104968476
  • LOC104970105
  • LOC107131241
  • LOC506495
  • LOC508131
  • LOC509810
  • LOC516156
  • LOC523461
  • LOC530973
  • LOC615112
  • LOC616720
  • LOC789258
  • MED1
  • MED10
  • MED12
  • MED13
  • MED14
  • MED15
  • MED16
  • MED17
  • MED20
  • MED23
  • MED24
  • MED25
  • MED26
  • MED27
  • MED30
  • MED31
  • MED4
  • MED6
  • MED7
  • MED8
  • RHIT
  • SOH1
  • THRAP6
  • TRAP25
  • TRIM28
  • ZFP1
  • ZFP2
  • ZFP28
  • ZFP37
  • ZFP69
  • ZFP82
  • ZFP90
  • ZIM3
  • ZKSCAN1
  • ZKSCAN4
  • ZKSCAN5
  • ZKSCAN7
  • ZKSCAN8
  • ZNF10
  • ZNF112
  • ZNF114
  • ZNF135
  • ZNF140
  • ZNF157
  • ZNF169
  • ZNF175
  • ZNF18
  • ZNF180
  • ZNF181
  • ZNF189
  • ZNF19
  • ZNF192
  • ZNF200
  • ZNF202
  • ZNF205
  • ZNF212
  • ZNF214
  • ZNF226
  • ZNF227
  • ZNF23
  • ZNF235
  • ZNF24
  • ZNF248
  • ZNF25
  • ZNF250
  • ZNF26
  • ZNF263
  • ZNF268
  • ZNF274
  • ZNF275
  • ZNF286A
  • ZNF300
  • ZNF304
  • ZNF311
  • ZNF331
  • ZNF33B
  • ZNF345
  • ZNF350
  • ZNF354A
  • ZNF354B
  • ZNF354C
  • ZNF382
  • ZNF383
  • ZNF41
  • ZNF432
  • ZNF436
  • ZNF445
  • ZNF45
  • ZNF454
  • ZNF484
  • ZNF496
  • ZNF500
  • ZNF514
  • ZNF529
  • ZNF548
  • ZNF550
  • ZNF554
  • ZNF555
  • ZNF557
  • ZNF565
  • ZNF566
  • ZNF568
  • ZNF569
  • ZNF570
  • ZNF584
  • ZNF596
  • ZNF599
  • ZNF605
  • ZNF613
  • ZNF614
  • ZNF619
  • ZNF621
  • ZNF624
  • ZNF641
  • ZNF642
  • ZNF667
  • ZNF668
  • ZNF684
  • ZNF688
  • ZNF689
  • ZNF70
  • ZNF703
  • ZNF704
  • ZNF706
  • ZNF710
  • ZNF713
  • ZNF74
  • ZNF746
  • ZNF750
  • ZNF75A
  • ZNF770
  • ZNF772
  • ZNF774
  • ZNF782
  • ZNF786
  • ZNF791
  • ZNF792
  • ZNF793
  • ZNF804B
  • ZNF805
  • ZNF839
  • ZNF892
  • ZSCAN25
  • znf496
Bos taurus (cattle)
RHOBTB2 GTPase cycle
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • BAT1
  • CCT2
  • CCT6A
  • CCT7
  • CDC37
  • CUL3
  • DDX39B
  • HNRPC
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • MYO6
  • PHIP
  • RBMX
  • RHOBTB2
  • SFRS10
  • SRRM1
  • STK38
  • TMOD3
  • TRA2B
  • TWF1
  • TXNL1
  • UAP56
Bos taurus (cattle)
PLC beta mediated events
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • PLCB1
  • PLCB4
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024