GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 375 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Retinoid metabolism and transport
  • AGRN
  • AKR1B10
  • AKR1C4
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • BCO1
  • BCO2
  • CLPS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPIHBP1
  • LOC101906939
  • LOC506594
  • LOC538060
  • LOC782061
  • LOC782884
  • LOC785762
  • LPL
  • LRAT
  • LRP1
  • LRP10
  • LRP12
  • LRP2
  • LRP8
  • PNLIP
  • RBP1
  • RBP2
  • RBP4
  • RDH11
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC4
  • TTR
Bos taurus (cattle)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
Bos taurus (cattle)
Phase 2 - plateau phase
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • KCNE1
  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNQ1
Bos taurus (cattle)
Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs
  • ACSF3
  • ACSL1
  • ACSL3
  • ACSL4
  • ACSL5
  • ACSL6
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • ELOVL6
  • ELOVL7
  • GPSN2
  • HACD1
  • HACD2
  • HACD3
  • HACD4
  • HSD17B12
  • HSD17B3
  • LOC789567
  • MGC139109
  • PTPLAD1
  • SRD5A2L2
  • TECR
  • TECRL
Bos taurus (cattle)
Crosslinking of collagen fibrils
  • BMP1
  • LOX
  • LOXL1
  • LOXL2
  • LOXL3
  • LOXL4
  • PCOLCE
  • PXDN
  • TLL1
  • TLL2
Bos taurus (cattle)
TNFs bind their physiological receptors
  • APRIL
  • CD27
  • CD70
  • EDA
  • EDAR
  • EDARADD
  • LOC768081
  • LTA
  • TNFB
  • TNFRSF11B
  • TNFRSF13B
  • TNFRSF17
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF25
  • TNFRSF4
  • TNFRSF6B
  • TNFRSF8
  • TNFRSF9
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF13
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF15
  • TNFSF18
  • TNFSF4
  • TNFSF8
  • TNFSF9
  • TNLG1B
  • TNLG1D
  • TNLG7A
  • TNLG8A
Bos taurus (cattle)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • PAFAH2
Bos taurus (cattle)
KEAP1-NFE2L2 pathway
  • CUL3
  • KEAP1
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3B
  • MUL1
  • NFE2L2
  • NPLOC4
  • PRKCI
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RPS27A
  • SESN1
  • SESN2
  • SQSTM1
  • SUG1
  • TRAP2
  • TRIM21
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBXN7
  • UFD1
  • VCP
Bos taurus (cattle)
HDL remodeling
  • ALB
  • APOA1
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • LCAT
  • LIPG
  • PLTP
Bos taurus (cattle)
Cyclin E associated events during G1/S transition
  • CABLES1
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CCNH
  • CDC25A
  • CDK2
  • CDK7
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • MNAT1
  • RB1
  • WEE1
Bos taurus (cattle)
Attenuation phase
  • CREBBP
  • DNAJB1
  • EP300
  • FKBP4
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA1L
  • HSPA2
  • HSPA8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • PTGES3
Bos taurus (cattle)
Mineralocorticoid biosynthesis
  • CGA
  • CYP11B1
  • CYP21
  • CYP21A1
  • CYP21A2
  • HSD3B
  • LHB
Bos taurus (cattle)
Opsins
  • BCP
  • OPN1LW
  • OPN1SW
  • OPN4
  • OPN5
  • RCP
  • RGR
  • RHO
  • RRH
Bos taurus (cattle)
Aspirin ADME
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ACSM2A
  • ACSM2B
  • ACSM4
  • ACSM5
  • ALB
  • BCHE
  • BSG
  • CES1
  • CES2
  • CYP2C85
  • CYP2C87
  • CYP2C88
  • CYP2C90
  • CYP2D14
  • CYP3A28
  • CYP3A4
  • CYP3A5
  • CYP3A74
  • CYP3A76
  • GLYAT
  • GLYATL2
  • GLYATL3
  • SLC16A1
  • SLC22A7
  • SLCO2B1
Bos taurus (cattle)
Synaptic adhesion-like molecules
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • FLOT1
  • FLOT2
  • GRIA1
  • GRIA3
  • LRFN1
  • LRFN2
  • LRFN3
  • LRFN4
  • PTPRD
  • PTPRF
  • PTPRS
  • SALM4
Bos taurus (cattle)
Transport of organic anions
  • AVP
  • OATP3A1
  • OATPD
  • SLC16A2
  • SLC21A11
  • SLCO1A2
  • SLCO1B3
  • SLCO1C1
  • SLCO2A1
  • SLCO2B1
  • SLCO3A1
  • SLCO4A1
  • SLCO4C1
Bos taurus (cattle)
Classical antibody-mediated complement activation
  • ADIB
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • CRP
Bos taurus (cattle)
COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • ARCN1
  • ARF1
  • ARF3
  • ARF4
  • ARF5
  • ARFGAP1
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • BNIP1
  • CENPE
  • COPA
  • COPB1
  • COPB2
  • COPD
  • COPE
  • COPE1
  • COPG1
  • COPG2
  • COPZ
  • COPZ1
  • COPZ2
  • GBF1
  • KDELR
  • KDELR1
  • KDELR2
  • KDELR3
  • KIF11
  • KIF12
  • KIF13B
  • KIF15
  • KIF16B
  • KIF18B
  • KIF1B
  • KIF1C
  • KIF20A
  • KIF20B
  • KIF21A
  • KIF21B
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF25
  • KIF26B
  • KIF28
  • KIF2B
  • KIF3A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NBAS
  • NSF
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RACGAP1
  • RINT1
  • SEC22B
  • SNAPB
  • STX18
  • SURF4
  • TMED10
  • TMED3
  • TMED7
  • TMED9
  • TMP21
  • USE1
  • ZW10
Bos taurus (cattle)
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • ABCC1
  • ALOX15
  • ALOX5
  • ALOX5AP
  • CYP4A22
  • CYP4B1
  • CYP4F2
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT1
  • GGT5
  • LOC100295883
  • LTA4H
  • LTC4S
  • MAPKAPK2
  • MRP1
Bos taurus (cattle)
Tachykinin receptors bind tachykinins
  • NKA
  • NKNA
  • NKNB
  • TAC1
  • TAC2
  • TAC2R
  • TAC3
  • TACR1
  • TACR2
  • TACR3
Bos taurus (cattle)
Ion homeostasis
  • ABCC9
  • ASPH
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CLIC2
  • FKBP12.6
  • FKBP1B
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNJ11
  • NOS1
  • PLM
  • PLN
  • PRKACA
  • RYR2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SRI
  • STIM1
  • TRPC1
Bos taurus (cattle)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CHPF
  • CHPF2
  • CHST11
  • CHST13
  • CHST15
  • CHST3
  • CHST7
  • CHST9
  • CHSY1
  • CHSY3
  • CSGALNACT1
  • CSGALNACT2
  • CSPG2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • NCAN
  • VCAN
Bos taurus (cattle)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CALM
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • JUP
  • NOS3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PDPK1
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
Bos taurus (cattle)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ADRB2
  • ADRBK1
  • ADRBK2
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTLB
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSN3
  • DAB2
  • DVL2
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC782101
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • REPS1
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYB2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBQLN1
  • UBQLN2
  • VAMP2
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Glutathione conjugation
  • AKR1A1
  • ESD
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTA4
  • GSTA5
  • GSTK1
  • GSTM1
  • GSTM3
  • GSTM4
  • GSTO2
  • GSTP1
  • GSTT1
  • HPGDS
  • LOC100295687
  • MGST1
  • MGST2
  • MGST3
Bos taurus (cattle)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024