GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 26 - 50 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
RAF-independent MAPK1/3 activation
  • DUSP1
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP4
  • DUSP5
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PEA15
  • PRKM1
Bos taurus (cattle)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • BIRC2
  • BIRC3
  • CD40
  • CD40LG
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • NCR3
  • TNFB
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF5
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNLG1D
  • TNLG7A
  • TRAF2
  • TRAF3
Bos taurus (cattle)
Regulation of NF-kappa B signaling
  • CASP8
  • CHUK
  • IKBIP
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKIP
  • IKKA
  • LRRC14
  • N4BP1
  • NEMO
  • NLRC5
  • NLRX1
  • RPS27A
  • TRAF2
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP14
Bos taurus (cattle)
Elevation of cytosolic Ca2+ levels
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • TRP6
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Bos taurus (cattle)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ARHA
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • JAM1
  • PARD3
  • PARD6A
  • PRKCZ
  • RHO12
  • RHOA
  • RPS27A
  • SMURF1
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1)
  • CD26
  • DPP4
  • FFAR4
  • GCG
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNG13
  • GPR119
  • GPR120
  • GRP
  • LEP
  • ob
Bos taurus (cattle)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • AIMP2
  • CREBBP
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EPRS1
  • ERK2
  • GSK3B
  • HINT1
  • IARS
  • IARS1
  • JTV1
  • KARS1
  • KIT
  • KITLG
  • LARS1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARS1
  • MITF
  • PRKM1
  • QARS
  • QARS1
  • RARS
  • RARS1
  • RPS6KA1
  • SCF
  • WNT3A
  • XPO1
Bos taurus (cattle)
PI3K/AKT Signaling
  • AFGF
  • AREG
  • BTC
  • CD19
  • CD28
  • CD80
  • CD86
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • ICOS
  • IL1RL1
  • IL33
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTPN11
  • RAC2
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)
Chromatin modifying enzymes
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • PADI1
  • PADI2
  • PADI3
  • PADI4
  • PADI6
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
Bos taurus (cattle)
Events associated with phagocytolytic activity of PMN cells
  • LPO
  • MPO
Bos taurus (cattle)
Amine ligand-binding receptors
  • GPR143
  • LOC511136
  • LOC516101
  • TAAR1
  • TAAR2
  • TAAR3
  • TAAR5
  • TAAR9
Bos taurus (cattle)
Nuclear signaling by ERBB4
  • APH1A
  • APH1B
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • MGF
  • NCSTN
  • NR3A1
  • PEN2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • SRC
  • STAT5A
  • WWOX
  • YAP1
Bos taurus (cattle)
EPHB-mediated forward signaling
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARHA
  • ARHGEF28
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • CDC42
  • ITSN1
  • PAK1
  • PTK2
  • RASA1
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SDC2
  • WASL
Bos taurus (cattle)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • FIGF
  • FLT1
  • FLT4
  • KDR
  • PGF
  • PLGF
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
Bos taurus (cattle)
Separation of Sister Chromatids
  • AHCTF1
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APITD1
  • AURKB
  • B9D2
  • BIRC5
  • BUB1
  • BUB1B
  • BUB3
  • CCDC99
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDCA5
  • CDCA8
  • CENPC
  • CENPE
  • CENPF
  • CENPH
  • CENPI
  • CENPK
  • CENPL
  • CENPM
  • CENPO
  • CENPP
  • CENPQ
  • CENPS
  • CENPT
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CLASP2
  • CLIP1
  • DNCL1
  • DSN1
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • ERCC6L
  • ESPL1
  • FAAP16
  • HDAC8
  • INCENP
  • ITGB3BP
  • KIF2B
  • KNL1
  • KNTC1
  • LIS1
  • MAD1L1
  • MAD2L1
  • MAPRE1
  • MCM21R
  • MHF1
  • MIS12
  • NDC80
  • NDE1
  • NDEL1
  • NSL1
  • NUDC
  • NUF2
  • NUP107
  • NUP133
  • NUP160
  • NUP37
  • NUP43
  • NUP85
  • NUP98
  • PAFAH1B1
  • PDS5A
  • PDS5B
  • PLK1
  • PMF1
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RAD21
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC2
  • RPS27
  • RPS27A
  • SCC1
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEH1L
  • SGO1
  • SGO2
  • SKA1
  • SKA2
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SPBC25
  • SPC24
  • SPC25
  • SPDL1
  • STAG1
  • STAG2
  • SUG1
  • TAOK1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • WAPL
  • XPO1
  • ZW10
  • ZWILCH
  • ZWINT
Bos taurus (cattle)
Androgen biosynthesis
  • CGA
  • CYP17
  • CYP17A1
  • HSD17B12
  • HSD17B3
  • HSD3B
  • LHB
  • LOC789567
  • POMC
  • SRD5A1
  • SRD5A2
  • SRD5A3
Bos taurus (cattle)
FCERI mediated NF-kB activation
  • BCL10
  • CARD11
  • CDC34
  • CHUK
  • CUL1
  • FBXW11
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • LYN
  • MALT1
  • MAP3K7
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKBIA
  • PRKCQ
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • RELA
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • bIkBa
Bos taurus (cattle)
Detoxification of Reactive Oxygen Species
  • AOP1
  • AOP2
  • CAT
  • CCS
  • CYBA
  • CYBB
  • CYC
  • CYCS
  • ERO1A
  • ERO1L
  • GPX
  • GPX1
  • GPX3
  • GPX5
  • GPX7
  • GPX8
  • GSR
  • GSTP1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOX4
  • NOX5
  • NUDT2
  • P4HB
  • PHGPX
  • PRDX1
  • PRDX2
  • PRDX3
  • PRDX5
  • PRDX6
  • SOD1
  • SOD2
  • SOD3
  • TRXR2
  • TXN
  • TXN2
  • TXNRD1
  • TXNRD2
Bos taurus (cattle)
G alpha (12/13) signalling events
  • ABR
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1D
  • AKAP13
  • ARHA
  • ARHC
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BTK
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • GNA12
  • GNA13
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • ITSN1
  • L2HGDH
  • MCF2L
  • NET1
  • NGEF
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PLXNB1
  • PREX1
  • RASGRF2
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SOS1
  • SOS2
  • TBXA2R
  • TIAM2
  • TRIO
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
Bos taurus (cattle)
Glycerophospholipid catabolism
  • ENPP6
  • GDE1
  • MIR16
  • PNPLA6
Bos taurus (cattle)
IRS-related events triggered by IGF1R
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
  • IRS1
  • IRS2
  • IRS4
Bos taurus (cattle)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • ENPP1
  • FLAD1
  • RFK
  • RFT2
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Bos taurus (cattle)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
Bos taurus (cattle)
Adenylate cyclase inhibitory pathway
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAL
  • GNAT3
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024