GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 557 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Prednisone ADME
  • ABCB1
  • AKR1C4
  • ALB
  • CBG
  • CYP3A28
  • CYP3A4
  • CYP3A5
  • CYP3A74
  • CYP3A76
  • HSD11B2
  • LOC100138004
  • LOC100138908
  • LOC100296421
  • LOC506594
  • LOC538060
  • LOC782061
  • LOC782884
  • LOC785762
  • SERPINA6
  • UGT1A6
  • UGT2B10
Bos taurus (cattle)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP1
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • ALPI
  • ALPL
  • ART3
  • ART4
  • BST1
  • C15H11orf34
  • CD52
  • CEACAM1
  • CNTN3
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CPM
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • FOLR2
  • GP2
  • GPIHBP1
  • GPLD1
  • LOC100336941
  • LOC100850276
  • LOC516378
  • LOC528262
  • LOC783508
  • LSAMP
  • LY6D
  • LY6E
  • LY6G6C
  • LY6H
  • LYPD1
  • LYPD2
  • LYPD4
  • LYPD5
  • LYPD8
  • MDGA1
  • MELTF
  • NEGR1
  • NRN1
  • NT
  • NTM
  • OBCAM
  • OCAM
  • OPCML
  • OTOA
  • PRND
  • PRSS21
  • PSCA
  • RECK
  • RTN4RL2
  • SPACA4
  • SPRN
  • TECTA
  • TECTB
  • TEX101
  • THY1
  • ULBP13
  • ULBP17
  • ULBP21
  • VNN1
  • VNN2
  • XPNPEP2
Bos taurus (cattle)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • PAFAH2
Bos taurus (cattle)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AGP
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APOA1
  • APOH
  • APOL
  • APP
  • ARMET
  • ARP
  • BRPF3
  • CALM
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8
  • FAM121A
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FERMT3
  • FETUA
  • FIGF
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • ILEI
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • KIND3
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY2
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LOC112442231
  • LOC515333
  • MAGED2
  • MANF
  • MIC27
  • MMRN1
  • NHLRC2
  • OLA1
  • ORM1
  • PAS4
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PI
  • PLEK
  • PLG
  • PLI
  • PPBP
  • PROS
  • PROS1
  • PSAP
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SPP24
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TF
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TLN1
  • TMSB4X
  • TMX3
  • TOR4A
  • TUBA1
  • TUBA4A
  • URP2
  • VCL
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
  • VWF
  • WDR1
  • agp
  • ly6g6f
Bos taurus (cattle)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • F2
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • VWF
Bos taurus (cattle)
Physiological factors
  • CES1
  • CORIN
  • MME
  • NPPA
  • NPPC
  • NPR1
  • NPR2
Bos taurus (cattle)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • BLA-DQB
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CD247
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CSK
  • DYB
  • HLA-DRA
  • LCK
  • LOC100848815
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • TRAV29-1
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6A
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR3
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR2
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR2
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • AFGF
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF5
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • Fgf4
  • HBGF-1
  • KL
  • PLCG1
Bos taurus (cattle)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • ABP1
  • AHR
  • ALDH3A1
  • AOC1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • CBR3
  • CES1
  • CES2
  • CES3
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A28
  • CYP3A4
  • CYP3A5
  • CYP3A74
  • CYP3A76
  • DIA1
  • EPHX1
  • LOC100138645
  • MARC2
  • MOSC2
  • MTARC1
  • MTARC2
  • NQO2
Bos taurus (cattle)
Phase 4 - resting membrane potential
  • IRK1
  • KCNJ12
  • KCNJ14
  • KCNJ2
  • KCNJ4
  • KCNK1
  • KCNK10
  • KCNK12
  • KCNK13
  • KCNK15
  • KCNK16
  • KCNK17
  • KCNK18
  • KCNK2
  • KCNK3
  • KCNK4
  • KCNK5
  • KCNK7
  • KCNK9
Bos taurus (cattle)
Phase 2 - plateau phase
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • KCNE1
  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNQ1
Bos taurus (cattle)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
Bos taurus (cattle)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CALM
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • FGF12
  • FGF13
  • FGF14
  • RANGRF
  • SCN11A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN8A
  • SCN9A
Bos taurus (cattle)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BDKRB2
  • BRS3
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • CCK
  • CCKBR
  • CORT
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPR10
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MSHR
  • NLN
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPY
  • PPYR1
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SERPINA8
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • mln
Bos taurus (cattle)
Peptide hormone biosynthesis
  • PCSK1
  • POMC
Bos taurus (cattle)
Pentose phosphate pathway
  • DERA
  • G6PD
  • PGD
  • PGLS
  • PGM2
  • RBKS
  • RPE
  • RPIA
  • SHPK
  • TALDO1
  • TKT
Bos taurus (cattle)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP5
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
  • MIP
Bos taurus (cattle)
PLC beta mediated events
  • GNA11
  • GNA14
  • GNA15
  • GNAQ
  • PLCB1
  • PLCB4
Bos taurus (cattle)
PKMTs methylate histone lysines
  • AEBP2
  • ASH1L
  • ASH2L
  • ATF7IP
  • DOT1L
  • EED
  • EHMT1
  • EZH2
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT5A
  • KMT5B
  • KMT5C
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NSD1
  • NSD2
  • NSD3
  • PRDM16
  • PRDM7
  • RBBP4
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RELA
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SETD3
  • SETD6
  • SETD7
  • SETD8
  • SETDB1
  • SETDB2
  • SMYD2
  • SMYD3
  • SUV39H1
  • SUV39H2
  • SUZ12
  • WDR5
Bos taurus (cattle)
PKA activation
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • ADCY9
  • CALM
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
Bos taurus (cattle)
PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling
  • AFGF
  • AREG
  • BTC
  • CD19
  • CD28
  • CD80
  • CD86
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • ICOS
  • IER3
  • IL1RL1
  • IL33
  • INS
  • INSR
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP4K2C
  • PIP5K1A
  • PIP5K1B
  • PIP5K1C
  • PIP5K2C
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PRKM1
  • PTPN11
  • RAC2
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)
PI3K/AKT Signaling
  • AFGF
  • AREG
  • BTC
  • CD19
  • CD28
  • CD80
  • CD86
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF4A
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF5B
  • FGF5C
  • FGF6
  • FGF6A
  • FGF7
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8A
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • Fgf4
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • HBEGF
  • HBGF-1
  • HGF
  • ICOS
  • IL1RL1
  • IL33
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • KIT
  • KITLG
  • KL
  • KLB
  • LCK
  • MET
  • MYD88
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTPN11
  • RAC2
  • RHOG
  • SCF
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • TRAF6
  • TRAT1
  • VAV1
Bos taurus (cattle)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024