GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 557 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Bos taurus (cattle)
Striated Muscle Contraction
  • ACTN2
  • ACTN3
  • DES
  • DMD
  • MYBPC1
  • MYBPC3
  • MYH3
  • MYH6
  • MYH8
  • MYL1
  • MYL2
  • MYL4
  • NEB
  • TCAP
  • TMOD1
  • TMOD2
  • TMOD3
  • TMOD4
  • TNNC
  • TNNC1
  • TNNC2
  • TNNI1
  • TNNI2
  • TNNT1
  • TNNT2
  • TNNT3
  • TPM1
  • TPM2
  • TPM3
  • VIM
Bos taurus (cattle)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CMLKR1
  • CNR1
  • CNR2
  • GPBAR1
  • GPR132
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR35
  • GPR39
  • GPR4
  • GPR65
  • GPR68
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • OXGR1
  • PAFR
  • PTAFR
  • SUCNR1
  • TGR5
Bos taurus (cattle)
The NLRP3 inflammasome
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCB
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX
  • PANX1
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • SUGT1
  • TXN
  • TXNIP
Bos taurus (cattle)
RHOBTB1 GTPase cycle
  • BRE1A
  • CCT2
  • CCT7
  • COPS2
  • COPS4
  • CPSF7
  • CUL3
  • GPS1
  • HNRPC
  • LOC782101
  • MYO6
  • PDE5
  • PDE5A
  • RBBP6
  • RBMX
  • RHOBTB1
  • RNF20
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SFRS10
  • SRRM1
  • STK38
  • TRA2B
  • TXNL1
  • VIM
Bos taurus (cattle)
Eicosanoid ligand-binding receptors
  • OXER1
Bos taurus (cattle)
MAPK3 (ERK1) activation
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • IL6
  • IL6R
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK2
  • MAP2K1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Cholesterol biosynthesis
  • ACAT2
  • ARV1
  • CYP51A1
  • DHCR24
  • FDFT1
  • GGPS1
  • HMGCR
  • HMGCS1
  • HSD17B7
  • IDI1
  • LBR
  • LSS
  • MSMO1
  • MVD
  • MVK
  • NSDHL
  • PLPP6
  • PMVK
  • SC4MOL
  • SQLE
  • SREBF1
  • SREBF2
  • TM7SF2
  • fdft1
Bos taurus (cattle)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IL13
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • SOCS1
  • SOCS5
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • TRA1
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Voltage gated Potassium channels
  • EAG
  • KCNA10
  • KCNA2
  • KCNA3
  • KCNA4
  • KCNA5
  • KCNA6
  • KCNA7
  • KCNAB1
  • KCNAB2
  • KCNAB3
  • KCNB1
  • KCNB2
  • KCNC1
  • KCNC3
  • KCNC4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNF1
  • KCNG1
  • KCNG2
  • KCNG3
  • KCNG4
  • KCNH1
  • KCNH2
  • KCNH3
  • KCNH4
  • KCNH5
  • KCNH6
  • KCNH7
  • KCNH8
  • KCNQ1
  • KCNQ2
  • KCNQ3
  • KCNQ4
  • KCNQ5
  • KCNS1
  • KCNS2
  • KCNV2
  • KVB2
Bos taurus (cattle)
ESR-mediated signaling
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • FKBP4
  • FKBP5
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • NR3A1
  • NR3A2
  • PPP5C
  • PTGES3
Bos taurus (cattle)
Ciprofloxacin ADME
  • ABCG2
  • ALB
  • OCT1
  • SLC22A1
  • SLCO1A2
Bos taurus (cattle)
Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle
  • CHAT
  • CPLX1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RIMS1
  • SLC18A3
  • SLC5A7
  • SNAP25
  • STX1A
  • STXBP1
  • SYB2
  • SYT1
  • UNC13B
  • UNC18A
  • VAMP2
Bos taurus (cattle)
Synthesis of PC
  • ABHD3
  • CEPT1
  • CHAT
  • CHKA
  • CHKB
  • CHPT1
  • CK2A1
  • CK2N
  • CPT1
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • CTL2
  • CTL3
  • CTL4
  • LPCAT1
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MFSD2
  • MFSD2A
  • PCTP
  • PCYT1A
  • PCYT1B
  • PEMT
  • PEMT2
  • PHOSPHO1
  • SLC44A1
  • SLC44A2
  • SLC44A3
  • SLC44A4
  • SLC44A5
  • STARD10
  • STARD2
  • STARD7
  • TPPT1
Bos taurus (cattle)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • AREG
  • BTC
  • CALM
  • CAV1
  • CAV2
  • EGFR
  • EPGN
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT12
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • HBEGF
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • IGF1R
  • MMP2
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • NOS3
  • NR3A1
  • NR3A2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PRMT1
  • PTK2
  • S1PR3
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • STRN
  • TGFA
  • ZDHHC21
  • ZDHHC7
Bos taurus (cattle)
PCP/CE pathway
  • ARHA
  • DAAM1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FZD1
  • FZD3
  • FZD6
  • FZD7
  • PFN1
  • RAC2
  • RAC3
  • RHO12
  • RHOA
  • WNT1
  • WNT11
  • WNT4
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Signaling by PDGF
  • COL4A1
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • FURIN
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PDGFC
  • PDGFD
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PLAT
  • PLG
  • PTPN12
  • SPP1
  • THBS1
  • THBS2
  • THBS3
  • THBS4
Bos taurus (cattle)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AGP
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APOA1
  • APOH
  • APOL
  • APP
  • ARMET
  • ARP
  • BRPF3
  • CALM
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8
  • FAM121A
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FERMT3
  • FETUA
  • FIGF
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • ILEI
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • KIND3
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY2
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LOC112442231
  • LOC515333
  • MAGED2
  • MANF
  • MIC27
  • MMRN1
  • NHLRC2
  • OLA1
  • ORM1
  • PAS4
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PI
  • PLEK
  • PLG
  • PLI
  • PPBP
  • PROS
  • PROS1
  • PSAP
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SPP24
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TF
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TLN1
  • TMSB4X
  • TMX3
  • TOR4A
  • TUBA1
  • TUBA4A
  • URP2
  • VCL
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
  • VWF
  • WDR1
  • agp
  • ly6g6f
Bos taurus (cattle)
Regulation of Complement cascade
  • ADIB
  • BF
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C9
  • CD19
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHR5
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • ELANE
  • F2
  • GPR77
  • LOC100336868
  • LOC107131209
  • LOC519737
  • LOC616002
  • SERPING1
  • VTN
Bos taurus (cattle)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPNE6
  • CPNE7
Bos taurus (cattle)
Synthesis of PA
  • ACP6
  • AGPAT1
  • AGPAT2
  • AGPAT3
  • AGPAT4
  • AGPAT5
  • AGPAT6
  • CPLA2
  • DDHD1
  • DDHD2
  • FAM73B
  • GNPAT
  • GPAM
  • GPAT2
  • GPAT3
  • GPAT4
  • GPD1
  • GPD1L
  • GPD2
  • LIPH
  • LOC516378
  • LOC613966
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • MIGA1
  • MIGA2
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D1
  • PLA2G2E
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4D
  • PLA2R1
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD6
Bos taurus (cattle)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
RHOD GTPase cycle
  • ACTN1
  • ADD3
  • AKAP12
  • ANKFY1
  • ARHGAP1
  • ARHGAP12
  • ARHGAP17
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CPNE8
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH2
  • DIAPH3
  • EFHD2
  • EMD
  • ESYT1
  • FAM62A
  • FILIP1
  • GOLGA2
  • HINT2
  • LBR
  • LMAN1
  • LMNB1
  • MCAM
  • MOSPD2
  • PAK5
  • PAK6
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLXNA1
  • PLXNB1
  • RACGAP1
  • RBM39
  • RHOD
  • SLC4A7
  • STBD1
  • STEAP3
  • SWS1
  • TOR1AIP1
  • VANGL1
  • VAPB
  • VRK2
Bos taurus (cattle)
Complex I biogenesis
  • ACAD9
  • CI-B14-5A
  • COA1
  • ECSIT
  • GRIM19
  • HRPAP20
  • LOC101906178
  • MGC152111
  • MT-ND3
  • MT-ND4
  • MT-ND6
  • MTND3
  • MTND4
  • MTND6
  • NADH3
  • NADH4
  • NADH6
  • ND1
  • ND2
  • ND3
  • ND4
  • ND5
  • ND6
  • NDUFA1
  • NDUFA10
  • NDUFA11
  • NDUFA13
  • NDUFA2
  • NDUFA3
  • NDUFA5
  • NDUFA6
  • NDUFA7
  • NDUFA8
  • NDUFA9
  • NDUFAB1
  • NDUFAF1
  • NDUFAF2
  • NDUFAF3
  • NDUFAF4
  • NDUFAF5
  • NDUFAF6
  • NDUFAF7
  • NDUFB1
  • NDUFB10
  • NDUFB11
  • NDUFB2
  • NDUFB3
  • NDUFB5
  • NDUFB6
  • NDUFB7
  • NDUFB8
  • NDUFB9
  • NDUFC1
  • NDUFC2
  • NDUFS1
  • NDUFS2
  • NDUFS3
  • NDUFS4
  • NDUFS5
  • NDUFS6
  • NDUFS7
  • NDUFS8
  • NDUFV1
  • NDUFV2
  • NUBPL
  • TIMMDC1
  • TMEM126B
  • TMEM186
  • UQOR22
Bos taurus (cattle)
FCGR activation
  • CD247
  • CD3G
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • FGR
  • FYN
  • LYN
  • SRC
  • SYK
  • YES1
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024