GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 101 - 125 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • MAN2B1
  • MAN2C1
  • MANBA
Canis familiaris (dog)
Ion channel transport
  • ATP6AP1
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E1
  • ATP6V1A
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • TCIRG1
Canis familiaris (dog)
DAP12 signaling
  • B2M
  • BTK
  • CD94
  • FYN
  • GRAP2
  • GRB2
  • HRAS
  • KLRD1
  • KLRK1
  • KRAS
  • LAT
  • LCK
  • LCP2
  • LOC119863908
  • LOC119866326
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLCG1
  • PLCG2
  • RAC1
  • SHC1
  • SOS1
  • SYK
  • TYROBP
  • VAV2
  • VAV3
Canis familiaris (dog)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • A2M
  • ABCC4
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APLP2
  • APOA1
  • APOH
  • APOOL
  • APP
  • Abcc4
  • B9D2
  • BRPF3
  • CALM2
  • CANT1
  • CD109
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ECM1
  • EGF
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8VWF
  • FAM3C
  • FERMT3
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFIA
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • ITIH4
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY1
  • LGALS7B
  • LHFPL2
  • LOC100685620
  • LOC102152706
  • LOC119866770
  • LOC490387
  • LY6G6F
  • MAGED2
  • MANF
  • NHLRC2
  • OLA1
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PLEK
  • PLG
  • PPBP
  • PROS1
  • PSAP
  • QSOX1
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINA3
  • SERPINA4
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TEX264
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TIMP1
  • TIMP3
  • TLN1
  • TMX3
  • TUBA4A
  • VCL
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VWF
  • WDR1
Canis familiaris (dog)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPNE3
  • CPNE7
Canis familiaris (dog)
Regulation of Complement cascade
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD19
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHR5
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • ELA2
  • ELANE
  • F2
  • LOC102156626
  • LOC481722
  • LOC490269
  • SEBOX
  • SERPING1
Canis familiaris (dog)
Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers
  • BLNK
  • BTK
  • CD19
  • CD79A
  • CD79B
  • DAPP1
  • GRB2
  • IGHM
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • MAG
  • NCK1
  • PIK3AP1
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PLCG2
  • PTPN6
  • SH3KBP1
  • SOS1
  • STIM1
  • SYK
  • TRPC1
  • VAV1
Canis familiaris (dog)
Phase I - Functionalization of compounds
  • AADAC
  • AHR
  • AHRR
  • ALDH3
  • ALDH3A1
  • AOC2
  • AOC3
  • ARNT
  • ARNT2
  • BPHL
  • C5BR
  • CBR3
  • CES2
  • CES5A
  • CMBL
  • CYB5B
  • CYB5R3
  • CYP2B6
  • CYP3A12
  • DIA1
  • EPHX1
  • LOC119868939
  • LOC119875773
  • LOC119876349
  • MTARC1
  • NQO2
Canis familiaris (dog)
Fructose biosynthesis
  • AKR1B1
  • SORD
Canis familiaris (dog)
Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRIN3A
  • NMDAR1
Canis familiaris (dog)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR2
  • GRB2
  • HRAS
  • KGF
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • CRKL
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF1
Canis familiaris (dog)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • B2M
  • CALR
  • CANX
  • DLA-12
  • DLA-79
  • DLA-DOB
  • DLA88
  • ERAP1
  • HSPA5
  • LOC119876190
  • LOC119876868
  • PDIA3
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • TAPBP
Canis familiaris (dog)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • BET1
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22A
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • STX17
  • STX5
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • YKT6
Canis familiaris (dog)
Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol
  • CALM2
  • INPP5B
  • INPP5D
  • INPP5J
  • INPPL1
  • ITPK1
  • ITPKA
  • ITPKB
  • ITPKC
  • MMAC1
  • OCRL
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PLCB4
  • PLCD1
  • PLCD3
  • PLCD4
  • PLCE1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PLCH1
  • PLCH2
  • PLCZ1
  • PLD4
  • PTEN
  • SHIP2
  • SYNJ1
Canis familiaris (dog)
Insulin receptor signalling cascade
  • GRB10
  • GRB2
  • INS
  • INSR
  • SHC1
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
Signaling by ROBO receptors
  • GPC1
  • SLIT2
  • SLIT3
Canis familiaris (dog)
Tie2 Signaling
  • ANGPT1
  • ANGPT2
  • ANGPT4
  • DOK2
  • GRB14
  • GRB2
  • GRB7
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • SHC1
  • SOS1
  • TEK
Canis familiaris (dog)
APAP ADME
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCC3
  • ABCC4
  • ABCC5
  • ABCG2
  • ABHD14A
  • Abcc4
  • Abcg2
  • CNDP2
  • CYP2E1
  • GGT1
  • GGT6
  • GGT7
  • GSTP1
  • LOC119874463
  • LOC119876946
  • MRP1
  • SULT1A1
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • UGT1A6
Canis familiaris (dog)
N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle
  • AMFR
  • DERL1
  • ENGASE
  • NGLY1
  • PSMC1
  • RAD23B
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UBXN1
  • VCP
Canis familiaris (dog)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • KER10
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT18
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33B
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT37
  • KRT38
  • KRT39
  • KRT40
  • KRT41
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT76
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT80
  • KRT81
  • KRT82
  • KRT83
  • KRT84
  • KRT85
  • KRT9
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP3-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100685322
  • LOC100685403
  • LOC100686265
  • LOC100686358
  • LOC102151268
  • LOC102151404
  • LOC102151604
  • LOC102151831
  • LOC102157302
  • LOC119873184
  • LOC610887
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Canis familiaris (dog)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS7
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL2
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • B3GLCT
  • CFP
  • POFUT2
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SH3GL3
  • SPON1
  • SPON2
  • SSPO
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD7A
  • THSD7B
Canis familiaris (dog)
PI3K Cascade
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • GAB1
  • GAB2
  • GRB2
  • IRS1
  • IRS2
  • KGF
  • KL
  • KLB
  • PIK3C3
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R4
  • PTPN11
  • TLR9
Canis familiaris (dog)
CD22 mediated BCR regulation
  • CD79A
  • CD79B
  • IGHM
  • LYN
  • MAG
  • PTPN6
Canis familiaris (dog)
Phospholipase C-mediated cascade: FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • KL
  • PLCG1
Canis familiaris (dog)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024