GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Sphingolipid de novo biosynthesis
  • ABCC1
  • ABCG2
  • Abcg2
  • CERS1
  • CERS2
  • CERS3
  • CERS4
  • CERS5
  • CERS6
  • CYB5B
  • DEGS1
  • DEGS2
  • FA2H
  • KDSR
  • MFSD2B
  • MRP1
  • ORMDL1
  • ORMDL2
  • ORMDL3
  • SAMD8
  • SGMS1
  • SGMS2
  • SPHK1
  • SPHK2
  • SPNS2
  • SPTLC1
  • SPTLC2
  • SPTLC3
  • SPTSSA
Canis familiaris (dog)
Chondroitin sulfate biosynthesis
  • BCAN
  • BGN
  • CHPF
  • CHPF2
  • CHST11
  • CHST12
  • CHST13
  • CHST3
  • CHST7
  • CHST9
  • CHSY1
  • CHSY3
  • CSGALNACT1
  • CSGALNACT2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • DCN1C
  • NCAN
  • VCAN
Canis familiaris (dog)
Passive transport by Aquaporins
  • AQP0
  • AQP1
  • AQP10
  • AQP11
  • AQP12
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AQP6
  • AQP7
  • AQP8
  • AQP9
  • MIP
Canis familiaris (dog)
Lewis blood group biosynthesis
  • B3GALT2
  • B3GALT4
  • B3GALT5
  • B4GALNT2
  • FUT10
  • FUT11
  • FUT2
  • FUT4
  • FUT5
  • FUT7
  • FUT9
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • ST6GALNAC6
Canis familiaris (dog)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A4GALT
  • B3GALNT1
  • B3GALT4
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • FUT2
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT8
Canis familiaris (dog)
Collagen degradation
  • COL12A1
  • COL13A1
  • COL15A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • CTSB
  • CTSD
  • FURIN
  • MMP1
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • PHYKPL
  • PRSS2
  • TMPRSS6
Canis familiaris (dog)
Degradation of the extracellular matrix
  • A2M
  • ACAN
  • ADAM10
  • ADAM15
  • ADAM8
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • BCAN
  • BSG
  • CAPN1
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPN15
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPNS1
  • CAST
  • CD44
  • CDH1
  • CTSG
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSS
  • DCN
  • DCN1C
  • ELA2
  • ELANE
  • HTRA1
  • KLK7
  • KLND
  • MMP1
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP19
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • NID1
  • OPTC
  • SCUBE1
  • SCUBE3
  • SPP1
  • TMPRSS6
Canis familiaris (dog)
MET activates PTK2 signaling
  • HGF
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGB1
  • LAMA4
  • MEGF6
  • MET
  • PTK2
  • SRC
Canis familiaris (dog)
ECM proteoglycans
  • ACAN
  • AGRN
  • BCAN
  • BGN
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • DCN
  • DCN1C
  • DMP1
  • DSPP
  • HAPLN1
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • MATN1
  • MATN3
  • MATN4
  • NCAN
  • SEBOX
  • SERPINE1
  • SPARC
  • TNC
  • TNR
  • VCAN
Canis familiaris (dog)
Integrin cell surface interactions
  • BSG
  • CD44
  • CD47
  • CDH1
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • F11R
  • FBN1
  • FN1
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM3
  • LOC119867047
  • LUM
  • MADCAM1
  • PECAM1
  • SEBOX
  • SPP1
  • THBS1
  • TNC
  • VCAM1
Canis familiaris (dog)
Negative regulation of MET activity
  • CBL
  • EPS15
  • GRB2
  • HGF
  • HGS
  • LRIG1
  • MET
  • PTPN1
  • PTPN2
  • PTPRJ
  • RPS27A
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • STAM
  • STAM2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • USP8
Canis familiaris (dog)
Regulation of KIT signaling
  • CBL
  • FYN
  • GRB2
  • KIT
  • KITLG
  • LCK
  • LYN
  • MGF
  • PRKCA
  • PTPN6
  • SH2B2
  • SH2B3
  • SOS1
  • SRC
  • YES1
Canis familiaris (dog)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
Canis familiaris (dog)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • CANX
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTRN1
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSE
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DLA-DMA
  • DLA-DMB
  • DLA-DOA
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DQB2
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF18A
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100856399
  • LOC119868747
  • LOC119876190
  • LOC612266
  • OSBPL1A
  • PHLPP2
  • QTRT1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
Canis familiaris (dog)
EPH-Ephrin signaling
  • EFNA1
  • EFNA2
  • EFNA3
  • EFNA4
  • EFNA5
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • EPHA1
  • EPHA10
  • EPHA2
  • EPHA3
  • EPHA4
  • EPHA5
  • EPHA7
  • EPHA8
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • efnB2
Canis familiaris (dog)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • APOB
  • B9D2
  • CD177
  • CD2
  • CD244
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CEACAM20
  • CXADR
  • EPCAM
  • ESAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GP6
  • GPC1
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGAD
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM3
  • JAML
  • JCHAIN
  • LOC119867047
  • LOC119868972
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PROC
  • PROCR
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC3
  • SDC4
  • SELE
  • SELL
  • SELP
  • SELPLG
  • SIRPA
  • SPN
  • THBD
  • TREM1
Canis familiaris (dog)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ADRB2
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CI-MPR/IGF2R
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • DAB2
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FZD4
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC102156511
  • LOC119867035
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • PICALM
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • TACR1
  • TGFA
  • TGOLN2
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • WNT5A
Canis familiaris (dog)
Clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ABCC7
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ADRB2
  • AGFG1
  • AGTR1
  • AMPH
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARF6
  • ARFGAP1
  • ARPC1A
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BIN1
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CI-MPR/IGF2R
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL1
  • DAB2
  • DNAJC6
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DVL2
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • FZD4
  • GAK
  • GAPVD1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HGS
  • HIP1
  • HIP1R
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC102156511
  • LOC119867035
  • LOC607182
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • OCRL
  • PACSIN1
  • PACSIN2
  • PACSIN3
  • PICALM
  • PIK3C2A
  • PIP5K1C
  • QTRT1
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • REPS2
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • SNX18
  • SNX9
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYNJ1
  • SYNJ2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT2
  • SYT8
  • TACR1
  • TGFA
  • TGOLN2
  • TRIP10
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • VAMP2
  • VAMP3
  • VAMP4
  • VAMP7
  • VAMP8
  • WASL
  • WNT5A
Canis familiaris (dog)
ESR-mediated signaling
  • ESR1
  • ESR2
Canis familiaris (dog)
Cargo concentration in the ER
  • AREG
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • MIA2
  • PREB
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • STX5
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
Canis familiaris (dog)
COPII-mediated vesicle transport
  • ANKRD28
  • AREG
  • BET1
  • CD59
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • F5
  • GOLGA2
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LOC119876190
  • LOC609612
  • MCFD2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • SCFD1
  • SEC13
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC22A
  • SEC22C
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SERPINA1
  • STX17
  • STX5
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • YKT6
Canis familiaris (dog)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • CASP3
  • CDH1
  • CTNNB1
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSP
  • OCLN
  • PKP1
  • TJP1
  • TJP2
Canis familiaris (dog)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • COLEC10
  • FCN2
  • LOC481722
  • MASP1
  • MASP2
Canis familiaris (dog)
Regulation of Complement cascade
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD19
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHR5
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • ELA2
  • ELANE
  • F2
  • LOC102156626
  • LOC481722
  • LOC490269
  • SEBOX
  • SERPING1
Canis familiaris (dog)
Synthesis of bile acids and bile salts via 7alpha-hydroxycholesterol
  • ACOT8
  • ACOX2
  • Abcb11e
  • BAAT
  • BSEP
  • CYP27A1
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8B1
  • HSD17B4
  • HSD3B7
  • LOC119874618
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • PTGIS
  • RXRA
  • SCP2
  • SLC27A2
  • SLC27A5
Canis familiaris (dog)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024