GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1401 - 1425 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Translesion synthesis by POLI
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLI
  • POLZ
  • RAD30B
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by POLK
  • DINB1
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLK
  • POLZ
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by REV1
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLZ
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Displacement of DNA glycosylase by APEX1
  • AAG
  • ANPG
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • MBD4
  • MED1
  • MID1
  • MMH
  • MPG
  • MUTM
  • NTH1
  • NTHL1
  • OCTS3
  • OGG1
  • OGH1
  • REF1
  • SMUG1
  • TDG
Homo sapiens (human)
Resolution of Abasic Sites (AP sites)
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • REF1
Homo sapiens (human)
Sensing of DNA Double Strand Breaks
  • ATM
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KPNA2
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • RAD50
  • RCH1
  • SRP1
  • TIP60
Homo sapiens (human)
Switching of origins to a post-replicative state
  • BM28
  • CCNL1
  • CDC21
  • CDC46
  • CDC47
  • CDCL1
  • CDT1
  • GMNN
  • KIAA0030
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in beta cells
  • AN2
  • BHLHA3
  • FKHR
  • FOXA2
  • FOXA3
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • GCK
  • GLUT2
  • HNF1A
  • HNF3B
  • HNF3G
  • HNF4G
  • IAPP
  • INS
  • IPF1
  • MAFA
  • NEUROD
  • NEUROD1
  • NKX2-2
  • NKX2.2
  • NKX2B
  • NKX6-1
  • NKX6A
  • NR2A2
  • PAX6
  • PDX1
  • RFX6
  • RFXDC1
  • SLC2A2
  • STF1
  • TCF1
  • TCF3B
  • TCF3G
Homo sapiens (human)
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA
  • AIM2
  • BN51
  • BN51T
  • CRCP
  • G22P1
  • G22P2
  • HNGS1
  • HYRC
  • HYRC1
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • MRE11
  • MRE11A
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • PRKDC
  • RPC11
  • RPC8
  • XRCC5
  • XRCC6
Homo sapiens (human)
IRF3-mediated induction of type I IFN
  • ABS
  • DDX41
  • DTX4
  • ERIS
  • G22P1
  • G22P2
  • HNGS1
  • HYRC
  • HYRC1
  • IFI16
  • IFNGIP1
  • IRF3
  • KIAA0937
  • MITA
  • MRE11
  • MRE11A
  • NAK
  • NALP4
  • NLRC3
  • NLRP4
  • NOD3
  • PAN2
  • PRKDC
  • PYPAF4
  • RNF155
  • RNH2
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
  • TREX1
  • XRCC5
  • XRCC6
Homo sapiens (human)
MicroRNA (miRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • ARA24
  • BCDIN3D
  • C22orf12
  • DGCR8
  • DGCRK6
  • DICER
  • DICER1
  • DROSHA
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1291
  • KIAA1567
  • PACT
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PRKRA
  • RAN
  • RANBP21
  • RAX
  • RN3
  • RNASE3L
  • RNASEN
  • RPB7
  • TARBP2
  • TRBP
  • XPO5
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 IIIa TM
  • BEK
  • CBP20
  • CBP80
  • FGF1
  • FGF2
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KGFR
  • KSAM
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RPB7
Homo sapiens (human)
Abortive elongation of HIV-1 transcript in the absence of Tat
  • CBP20
  • CBP80
  • COBRA1
  • CTDP1
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • KIAA1182
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • BRF2
  • BRFU
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1439
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • NFI
  • NFIA
  • NFIB
  • NFIC
  • NFIX
  • OCT1
  • OTF1
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • POU2F1
  • RPC11
  • RPC8
  • SBF
  • SNAP19
  • SNAP190
  • SNAP43
  • SNAP45
  • SNAP50
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • SSB
  • STAF
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
  • ZNF143
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Termination
  • BN51
  • BN51T
  • CRCP
  • KIAA1439
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • NFI
  • NFIA
  • NFIB
  • NFIC
  • NFIX
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • SSB
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF2
  • BRFU
  • CRCP
  • GTF2D1
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • OCT1
  • OTF1
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • POU2F1
  • RPC11
  • RPC8
  • SBF
  • SNAP19
  • SNAP190
  • SNAP43
  • SNAP45
  • SNAP50
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • STAF
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
  • ZNF143
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Chain Elongation
  • BN51
  • BN51T
  • CRCP
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
Homo sapiens (human)
Mitochondrial transcription initiation
  • NS5ATP5
  • POLRMT
  • TCF6
  • TCF6L2
  • TFAM
  • TFB2M
Homo sapiens (human)
Defective Inhibition of DNA Recombination at Telomere Due to DAXX Mutations
  • ATRX
  • BING2
  • DAP6
  • DAXX
  • RAD54L
  • XH2
Homo sapiens (human)
Defective Inhibition of DNA Recombination at Telomere Due to ATRX Mutations
  • ATRX
  • BING2
  • DAP6
  • DAXX
  • RAD54L
  • XH2
Homo sapiens (human)
Nef and signal transduction
  • DOCK2
  • ELMO1
  • FYN
  • HCK
  • KIAA0209
  • KIAA0281
  • LCK
  • PAK2
  • RAC1
  • TC25
  • nef
Homo sapiens (human)
Alpha-defensins
  • ART1
  • CD4
  • DEF1
  • DEF3
  • DEF4
  • DEF5
  • DEF6
  • DEFA1
  • DEFA1B
  • DEFA2
  • DEFA3
  • DEFA4
  • DEFA5
  • DEFA6
  • MRS
  • PRSS2
  • PRSS3
  • PRSS4
  • TRY2
  • TRY3
  • TRY4
  • TRYP2
  • env
Homo sapiens (human)
Synthesis of Dolichyl-phosphate
  • C6orf68
  • DHDDS
  • DOLK
  • DOLPP1
  • HDS
  • KIAA1094
  • LSFR2
  • MPD
  • MVD
  • NGBR
  • NUS1
  • SRD5A2L
  • SRD5A3
  • TMEM15
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: December 9, 2024