GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 360 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • CALM3
  • CAV1
  • CDH5
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • JUP
  • Jup
  • NOS3
  • PAK1
  • PAK2
  • PDPK1
  • RAC1
  • VAV1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
Basigin interactions
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BSG
  • CAV1
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • MAG
  • MMP1
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Sus scrofa (pig)
RND2 GTPase cycle
  • ALDH3A2
  • ARHGAP1
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • BLTP3B
  • CAV1
  • CKAP4
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSG1
  • DST
  • EPHA2
  • FAM83B
  • FNBP1
  • FRS3
  • GOLGA3
  • KCTD13
  • KIDINS220
  • KTN1
  • LOC100516390
  • LRRC1
  • MUC13
  • NISCH
  • NUDC
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLXND1
  • PTPN13
  • RBM39
  • RND2
  • SCRIB
  • TFRC
  • TNFAIP1
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)
RND3 GTPase cycle
  • ARHGAP21
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CKAP4
  • CKB
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSG1
  • DSP
  • DST
  • EPHA2
  • FAM83B
  • FLOT2
  • KCTD13
  • KTN1
  • LOC100516390
  • MUC13
  • NISCH
  • PICALM
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBM39
  • RND3
  • ROCK1
  • SCRIB
  • SEMA4F
  • TMOD3
  • TNFAIP1
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)
RND1 GTPase cycle
  • ALDH3A2
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DSP
  • DST
  • EPHA2
  • EPSTI1
  • FAM135A
  • FAM83B
  • FLOT2
  • FRS3
  • GRB7
  • KIDINS220
  • LOC100516390
  • MUC13
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PLXNA1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBM39
  • RRAS2
  • TFRC
  • TMEM59
  • TXNL1
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
Sus scrofa (pig)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • CALM3
  • CAV1
  • CAV2
  • DTR
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • IGF1R
  • LOC100621431
  • LOC110255211
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP9
  • NOS3
  • NR3A1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRMT1
  • S1PR3
  • SHC1
  • SPHK1
  • SRC
  • STRN
Sus scrofa (pig)
RHOB GTPase cycle
  • ABR
  • ACTC1
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARHGAP1
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGDIG
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF2
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF3
  • ARHGEF5
  • BCR
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CIT
  • DAAM1
  • DEPDC1B
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • ECT2
  • FLOT1
  • FLOT2
  • IQGAP3
  • JUP
  • Jup
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9A
  • MYO9B
  • NET1
  • OPHN1
  • PCDH7
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PREX1
  • RACGAP1
  • RHOB
  • RHPN2
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • SLK
  • SNAP23
  • STARD8
  • STOM
  • TFRC
  • TJP2
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
Sus scrofa (pig)
Estrogen-dependent gene expression
  • CARM1
  • CBFB
  • CCNT1
  • CDK9
  • CITED1
  • CREBBP
  • DDX5
  • EP300
  • ERBB4
  • ESR
  • ESR1
  • FKBP4
  • FOS
  • FOXA1
  • GATA3
  • GREB1
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2F1
  • H1-2
  • H2AB1
  • H2AB2
  • H2AB3
  • H2AC10
  • H2AC11
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC19
  • H2BC20
  • H2BC21
  • H2BC5
  • H3-3A
  • H3C12
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C4
  • H3C6
  • H3F3A
  • HDAC1
  • HIST1H2BD
  • HIST1H3E
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPCA
  • JUN
  • KAT2B
  • KAT5
  • KDM1A
  • KDM4B
  • LOC110261482
  • MED1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA3
  • NR3A1
  • NR5A2
  • NRIP1
  • PGR
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2L
  • POU2F1
  • PRMT1
  • PTGES3
  • RUNX1
  • SP1
  • TLE3
  • USF1
  • USF2
  • YY1
  • ZNF217
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB4
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
Sus scrofa (pig)
PI3K events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • GAB1
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Sus scrofa (pig)
Signaling by ERBB2
  • BTC
  • CDC37
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • FYN
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SRC
  • YES1
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Regulates Cell Motility
  • BTC
  • DIAPH1
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • MEMO1
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • RHOA
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PTPN12
  • SHC1
Sus scrofa (pig)
Downregulation of ERBB2 signaling
  • BTC
  • CDC37
  • CUL5
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPCA
  • MATK
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTPN12
  • PTPN18
  • RPS27A
  • STUB1
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
Sus scrofa (pig)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • BTC
  • DTR
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
GRB2 events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB2
  • ERBB4
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
SHC1 events in ERBB4 signaling
  • BTC
  • DTR
  • ERBB4
  • EREG
  • GRB2
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HRAS
  • KRAS
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • SHC1
  • SOS1
Sus scrofa (pig)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRB2
  • HGF
  • MET
  • RAC1
  • RAP1B
  • RAPGEF1
Sus scrofa (pig)
CDC42 GTPase cycle
  • ABR
  • ARAP1
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP20
  • ARHGAP21
  • ARHGAP22
  • ARHGAP24
  • ARHGAP26
  • ARHGAP27
  • ARHGAP29
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP33
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP4
  • ARHGAP44
  • ARHGAP45
  • ARHGAP5
  • ARHGAP9
  • ARHGDIA
  • ARHGDIG
  • ARHGEF10
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF19
  • ARHGEF25
  • ARHGEF26
  • ARHGEF5
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • BAIAP2
  • BCR
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42EP5
  • CDC42SE2
  • CHN1
  • CPNE8
  • DAAM1
  • DEF6
  • DEPDC1B
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DNMBP
  • DOCK10
  • DOCK11
  • DOCK6
  • DOCK7
  • DOCK8
  • DOCK9
  • ECT2
  • FAM13B
  • FARP1
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FMNL1
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FNBP1
  • FNBP1L
  • GIT1
  • GIT2
  • GMIP
  • GNA13
  • GOLGA2
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • ITSN1
  • JUP
  • Jup
  • KCTD3
  • KTN1
  • LAMTOR1
  • LBR
  • MAP3K11
  • MCF2
  • MCF2L
  • MYO9B
  • NGEF
  • OPHN1
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK5
  • PAK6
  • PARD6A
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLD1
  • PLEKHG1
  • PLEKHG2
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • PREX2
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RASGRF2
  • SCRIB
  • SH3PXD2A
  • SHKBP1
  • SNAP23
  • SRGAP1
  • SRGAP2
  • SRGAP3
  • STARD8
  • STEAP3
  • STOM
  • SYDE1
  • TAGAP
  • TFRC
  • TIAM1
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • WASL
  • WDR81
  • WDR91
  • WIPF1
  • YKT6
Sus scrofa (pig)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • DTR
  • EGFR
  • GPNMB
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HIF1A
  • LRRK2
  • PTK6
Sus scrofa (pig)
Keratinization
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • JUP
  • Jup
  • KRT1
  • KRT10
  • KRT12
  • KRT15
  • KRT17
  • KRT18
  • KRT19
  • KRT2
  • KRT20
  • KRT23
  • KRT24
  • KRT25
  • KRT26
  • KRT27
  • KRT28
  • KRT3
  • KRT31
  • KRT32
  • KRT33A
  • KRT34
  • KRT35
  • KRT36
  • KRT39
  • KRT4
  • KRT40
  • KRT5
  • KRT6A
  • KRT7
  • KRT71
  • KRT72
  • KRT73
  • KRT74
  • KRT75
  • KRT77
  • KRT78
  • KRT79
  • KRT80
  • KRT82
  • KRT84
  • KRT85
  • KRTAP11-1
  • KRTAP24-1
  • KRTAP8-1
  • LOC100515166
  • LOC100516036
  • LOC100517674
  • LOC100518807
  • LOC100523123
  • LOC100523275
  • LOC100523670
  • LOC100621639
  • LOC100621844
  • LOC100622826
  • LOC100623393
  • LOC100625168
  • LOC100625858
  • LOC100737483
  • LOC102160031
  • LOC102164863
  • LOC106504189
  • LOC106507258
  • LOC106508044
  • LOC110255272
  • LOC110255312
  • LOC110256008
  • LOC110256282
  • LOC110260665
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
Sus scrofa (pig)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • ADD1
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • GAS2
  • GSN
  • MAPT
  • PLEC
  • SORBS2
  • SPTAN1
  • VIM
Sus scrofa (pig)
SUMOylation of DNA replication proteins
  • AURKB
  • BIRC5
  • CDCA8
  • CEP192
  • INCENP
  • LOC100627016
  • LOC110258677
  • MRNP41
  • NDC1
  • NUP107
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP58
  • NUP62
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUP98
  • PCNA
  • PIAS3
  • PIAS4
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • SEH1L
  • SMT3A
  • SMT3H2
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TOP1
  • TOP2A
  • TOP2B
  • TPR
  • UBE2I
Sus scrofa (pig)
Generic Transcription Pathway
  • CCNC
  • CDK8
  • CRSP8
  • CRSP9
  • KRBA1
  • LOC100513362
  • LOC100513741
  • LOC100516085
  • LOC100516355
  • LOC100517149
  • LOC100517161
  • LOC100517751
  • LOC100519853
  • LOC100520720
  • LOC100520903
  • LOC100521069
  • LOC100525433
  • LOC100620238
  • LOC100626048
  • LOC100627241
  • LOC100737756
  • LOC100737823
  • LOC100738050
  • LOC100739480
  • LOC102164547
  • LOC102167305
  • LOC102167351
  • LOC110259370
  • LOC110261311
  • LOC110261312
  • LOC110261313
  • LOC110261321
  • MED1
  • MED10
  • MED12
  • MED13
  • MED14
  • MED15
  • MED16
  • MED17
  • MED20
  • MED23
  • MED24
  • MED25
  • MED26
  • MED27
  • MED30
  • MED4
  • MED6
  • MED7
  • MED8
  • PRDM7
  • TRIM28
  • ZBTB41
  • ZBTB48
  • ZFP1
  • ZFP14
  • ZFP2
  • ZFP28
  • ZFP37
  • ZFP69B
  • ZKSCAN1
  • ZKSCAN4
  • ZKSCAN5
  • ZKSCAN7
  • ZKSCAN8
  • ZNF10
  • ZNF112
  • ZNF114
  • ZNF133
  • ZNF140
  • ZNF16
  • ZNF175
  • ZNF18
  • ZNF180
  • ZNF181
  • ZNF184
  • ZNF189
  • ZNF200
  • ZNF202
  • ZNF205
  • ZNF213
  • ZNF23
  • ZNF235
  • ZNF248
  • ZNF25
  • ZNF26
  • ZNF263
  • ZNF274
  • ZNF282
  • ZNF286A
  • ZNF3
  • ZNF300
  • ZNF311
  • ZNF317
  • ZNF333
  • ZNF33B
  • ZNF34
  • ZNF354B
  • ZNF354C
  • ZNF383
  • ZNF394
  • ZNF397
  • ZNF445
  • ZNF446
  • ZNF45
  • ZNF471
  • ZNF483
  • ZNF484
  • ZNF496
  • ZNF529
  • ZNF546
  • ZNF550
  • ZNF555
  • ZNF558
  • ZNF565
  • ZNF566
  • ZNF567
  • ZNF568
  • ZNF569
  • ZNF577
  • ZNF582
  • ZNF583
  • ZNF594
  • ZNF596
  • ZNF599
  • ZNF606
  • ZNF614
  • ZNF619
  • ZNF621
  • ZNF624
  • ZNF658
  • ZNF662
  • ZNF664
  • ZNF668
  • ZNF672
  • ZNF684
  • ZNF688
  • ZNF689
  • ZNF697
  • ZNF70
  • ZNF703
  • ZNF704
  • ZNF706
  • ZNF71
  • ZNF713
  • ZNF74
  • ZNF75D
  • ZNF770
  • ZNF772
  • ZNF782
  • ZNF786
  • ZNF79
  • ZNF791
  • ZNF792
  • ZNF793
  • ZNF804B
  • ZNF839
  • ZNF883
  • ZSCAN25
Sus scrofa (pig)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

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Last updated: August 19, 2024