GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 401 - 425 of 557 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • DERPC
  • HAS1
  • HAS2
Bos taurus (cattle)
Platelet degranulation
  • A1BG
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN4
  • AGP
  • AHSG
  • ALB
  • ALDOA
  • ANXA5
  • APOA1
  • APOH
  • APOL
  • APP
  • ARMET
  • ARP
  • BRPF3
  • CALM
  • CD36
  • CD63
  • CD9
  • CDC37L1
  • CFD
  • CHID1
  • CLEC3B
  • CLU
  • CTSW
  • CYB5R1
  • CYRIB
  • ENDOD1
  • F13A1
  • F5
  • F8
  • FAM121A
  • FAM3C
  • FAM49B
  • FERMT3
  • FETUA
  • FIGF
  • FLNA
  • FN1
  • GAS6
  • GTPBP2
  • HABP4
  • HGF
  • HRG
  • IGF1
  • IGF2
  • ILEI
  • ISLR
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • ITIH3
  • KIND3
  • KNG1
  • LAMP2
  • LEFTY2
  • LGALS3BP
  • LHFPL2
  • LOC112442231
  • LOC515333
  • MAGED2
  • MANF
  • MIC27
  • MMRN1
  • NHLRC2
  • OLA1
  • ORM1
  • PAS4
  • PCDH7
  • PCYOX1L
  • PDGFA
  • PDGFB
  • PECAM1
  • PHACTR2
  • PI
  • PLEK
  • PLG
  • PLI
  • PPBP
  • PROS
  • PROS1
  • PSAP
  • RAB27B
  • RARRES2
  • SCCPDH
  • SCG3
  • SELENOP
  • SELP
  • SERPINA1
  • SERPINE1
  • SERPINF2
  • SERPING1
  • SOD1
  • SPARC
  • SPP2
  • SPP24
  • SRGN
  • STXBP2
  • SYTL4
  • TAGLN2
  • TF
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • THBS1
  • TLN1
  • TMSB4X
  • TMX3
  • TOR4A
  • TUBA1
  • TUBA4A
  • URP2
  • VCL
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VRF
  • VWF
  • WDR1
  • agp
  • ly6g6f
Bos taurus (cattle)
Surfactant metabolism
  • ABCA3
  • ADA2
  • ADGRF5
  • ADORA2A
  • ADORA2B
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • CCDC59
  • CD163L1
  • CKAP4
  • CTSH
  • GATA6
  • LMCD1
  • LOC101907335
  • LOC751811
  • LOC786796
  • NAPSA
  • P2RY2
  • PGA5
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA1
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SLC34A1
  • TAP26
  • TTF1
  • WC-7
  • WC1
  • WC1-12
  • WC1.3
  • ZDHHC2
Bos taurus (cattle)
ATF6B (ATF6-beta) activates chaperones
  • ATF6B
  • MBTPS1
  • MBTPS2
Bos taurus (cattle)
Mitotic Prometaphase
  • AHCTF1
  • APITD1
  • AURKB
  • B9D2
  • BIRC5
  • BUB1
  • BUB1B
  • BUB3
  • CCDC99
  • CDC20
  • CDCA8
  • CENPC
  • CENPE
  • CENPF
  • CENPH
  • CENPI
  • CENPK
  • CENPL
  • CENPM
  • CENPO
  • CENPP
  • CENPQ
  • CENPS
  • CENPT
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CLASP2
  • CLIP1
  • DNCL1
  • DSN1
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • ERCC6L
  • FAAP16
  • INCENP
  • ITGB3BP
  • KIF2B
  • KNL1
  • KNTC1
  • LIS1
  • MAD1L1
  • MAD2L1
  • MAPRE1
  • MCM21R
  • MHF1
  • MIS12
  • NDC80
  • NDE1
  • NDEL1
  • NSL1
  • NUDC
  • NUF2
  • NUP107
  • NUP133
  • NUP160
  • NUP37
  • NUP43
  • NUP85
  • NUP98
  • PAFAH1B1
  • PLK1
  • PMF1
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC2
  • RPS27
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEH1L
  • SGO1
  • SGO2
  • SKA1
  • SKA2
  • SPBC25
  • SPC24
  • SPC25
  • SPDL1
  • TAOK1
  • XPO1
  • ZW10
  • ZWILCH
  • ZWINT
Bos taurus (cattle)
Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex
  • ASH2L
  • BAF190A
  • BCL9
  • BCL9L
  • BRG1
  • CDC73
  • CREBBP
  • CTNNB1
  • EP300
  • H2AC12
  • H2AC18
  • H2AC21
  • H2AC6
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AZ2
  • H2B
  • H2BC26
  • H2BC5
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3F3A
  • H3F3B
  • HDAC1
  • HIST1H2BI
  • KAT5
  • LEF1
  • LEO1
  • LOC100297725
  • LOC528006
  • MEN1
  • PYGO1
  • RBBP5
  • RUVBL1
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TERT
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • TRRAP
Bos taurus (cattle)
PKMTs methylate histone lysines
  • AEBP2
  • ASH1L
  • ASH2L
  • ATF7IP
  • DOT1L
  • EED
  • EHMT1
  • EZH2
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT5A
  • KMT5B
  • KMT5C
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NSD1
  • NSD2
  • NSD3
  • PRDM16
  • PRDM7
  • RBBP4
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RELA
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SETD3
  • SETD6
  • SETD7
  • SETD8
  • SETDB1
  • SETDB2
  • SMYD2
  • SMYD3
  • SUV39H1
  • SUV39H2
  • SUZ12
  • WDR5
Bos taurus (cattle)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • HYAL3
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
Bos taurus (cattle)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP1
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP1
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PAPPA2
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BDKRB2
  • BRS3
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • CCK
  • CCKBR
  • CORT
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPR10
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MSHR
  • NLN
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPY
  • PPYR1
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SERPINA8
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • mln
Bos taurus (cattle)
Ovarian tumor domain proteases
  • APC
  • ARHA
  • CARD15
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • ESR
  • ESR1
  • IKBKG
  • NEMO
  • NOD2
  • NR3A1
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD3
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • PTEN
  • RHO12
  • RHOA
  • RIPK1
  • RIPK2
  • RNF128
  • RPS27A
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRAF3
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2D1
  • VCP
  • VCPIP1
  • YOD1
  • ZRANB1
Bos taurus (cattle)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • APC
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • FNTA
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PTK2
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
Bos taurus (cattle)
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • FRAT2
  • GSK3B
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
Bos taurus (cattle)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CAV1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FRAT2
  • FZD1
  • FZD2
  • FZD5
  • GSK3B
  • LRP5
  • LRP6
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WNT1
  • WNT3A
  • WNT8A
  • WNT8B
Bos taurus (cattle)
LDL clearance
  • AADACL1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • NCEH1
  • NPC2
  • SOAT1
  • SOAT2
Bos taurus (cattle)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ADRB2
  • ADRBK1
  • ADRBK2
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTLB
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSN3
  • DAB2
  • DVL2
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC782101
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • REPS1
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYB2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBQLN1
  • UBQLN2
  • VAMP2
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
Miscellaneous transport and binding events
  • ADD1
  • ADD2
  • ADD3
  • ANKH
  • AZGP1
  • CTNS
  • DMT
  • DMTN
  • EPB49
  • LLRC8A
  • LOC104972276
  • LRRC8A
  • LRRC8B
  • LRRC8C
  • LRRC8D
  • LRRC8E
  • MAGT1
  • MRS2
  • NIPA1
  • NIPA2
  • NIPAL1
  • NIPAL2
  • NIPAL3
  • NIPAL4
  • PIP
  • SLC66A1
  • TUSC3
Bos taurus (cattle)
Adherens junctions interactions
  • AFDN
  • ANG2
  • CADM1
  • CADM2
  • CADM3
  • CDH1
  • CDH10
  • CDH11
  • CDH12
  • CDH13
  • CDH15
  • CDH17
  • CDH18
  • CDH2
  • CDH24
  • CDH3
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH7
  • CDH8
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PVRL4
  • RAA2
Bos taurus (cattle)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • AMICA1
  • B2M
  • BOLA
  • BOLA-NC1
  • C3
  • C5H12ORF53
  • CAR
  • CD18
  • CD19
  • CD1B5
  • CD200
  • CD200R
  • CD200R1
  • CD22
  • CD247
  • CD300A
  • CD300LB
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD99
  • CLEC4G
  • CLM9
  • CLP1
  • COLEC12
  • CRTAM
  • CXADR
  • DAP10
  • FCGR1A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM3
  • ICAM5
  • IFITM3
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KIR2DL1
  • KIR2DL5A
  • KIR2DS1
  • KIR3DL2
  • KIR3DS1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LOC100138951
  • LOC100850276
  • LOC100852061
  • LOC112443864
  • LOC112444847
  • LOC512286
  • LOC515418
  • LOC526163
  • LOC534578
  • LOC613699
  • LOC616254
  • LOC618268
  • LOC618463
  • LOC777594
  • LOC783508
  • MIC2
  • NCR3
  • NCR3LG1
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • SIGLEC1
  • SIGLEC10
  • SLAMF6
  • SLAMF7
  • TNFRSF5
  • TRAV29-1
  • TREM1
  • TREML1
  • TREML2
  • ULBP13
  • ULBP17
  • ULBP21
  • VCAM1
Bos taurus (cattle)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • AMICA1
  • APOB
  • CAR
  • CD177
  • CD18
  • CD2
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CXADR
  • EPCAM
  • EPCR
  • ESAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GPC1
  • IGJ
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM1
  • JAM2
  • JAML
  • JCHAIN
  • LOC100336941
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PPBP
  • PROC
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC4
  • SELE
  • SELP
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SPN
  • TGFB1
  • THBD
  • TREM1
Bos taurus (cattle)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG12
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • DPAGT1
  • LOC107132045
  • MPDU1
Bos taurus (cattle)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CRYA2
  • CRYAB
  • DNAJB1
  • GBL
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • LST8
  • MLST8
  • MTOR
  • RPTOR
Bos taurus (cattle)

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Last updated: August 19, 2024