GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 557 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • FURIN
  • GAS6
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
Bos taurus (cattle)
Regulation of ornithine decarboxylase (ODC)
  • AZIN1
  • NQO1
  • OAZ1
  • OAZ2
  • ODC
  • ODC1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • SUG1
  • TRAP2
Bos taurus (cattle)
Regulation of insulin secretion
  • ABCC8
  • CACNA1C
  • CACNA1D
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNB3
  • GLUT1
  • GLUT2
  • KCNJ11
  • PRKACA
  • PRKACB
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • SLC2A1
  • SLC2A2
Bos taurus (cattle)
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF)
  • KPNB1
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • RAN
  • SCAP
  • SREBF1
  • SREBF2
Bos taurus (cattle)
Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • BAIAP2
  • BRK1
  • BTK
  • C22H3ORF10
  • CD247
  • CD3G
  • CDC42
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO2
  • ERK2
  • FCGR1A
  • FCGR2B
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FCGRIII
  • GRB2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • LIMK1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH2
  • MYH9
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO5A
  • MYO9B
  • NCK1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • NF2
  • PAK1
  • PRKM1
  • PTK2
  • SYK
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
Bos taurus (cattle)
Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation
  • AIK
  • AIRK1
  • ARK1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRIP1
  • BTAK
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN2
  • CDKN5
  • CHEK2
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • DNA2
  • DYRK2
  • EXO1
  • HIPK1
  • HIPK2
  • HUS1
  • IAK1
  • KAT5
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK5
  • MDM2
  • MRE11
  • NBN
  • NCK5A
  • NIR
  • NOC2L
  • NUAK1
  • PIN1
  • PLK3
  • PRKAA1
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • PSSALRE
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC5
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RPA1
  • RPA2
  • RPA3
  • RPS27A
  • SSRP1
  • STK11
  • STK15
  • STK6
  • SUPT16H
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF15
  • TAF2
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TBP
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • TP53
  • TP53INP1
  • TP53RK
  • TPX2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WRN
Bos taurus (cattle)
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • APOB
  • CD14
  • CD36
  • FGA
  • FGB
  • GSDMD
  • GSDME
  • HMG1
  • HMGB1
  • LBP
  • LY96
  • MD-2
  • PAS4
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TLR4
  • TLR6
  • TLR7
Bos taurus (cattle)
Regulation of RUNX3 expression and activity
  • CBFB
  • EP300
  • MDM2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX3
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SRC
  • SUG1
  • TGFB1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Regulation of RUNX2 expression and activity
  • CUL1
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSMF1
  • RPS27A
  • RUNX2
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • STUB1
  • SUG1
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Bos taurus (cattle)
Regulation of PTEN stability and activity
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • FRK
  • MKRN1
  • NEDD4
  • OTUD3
  • PREX2
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • RNF146B
  • RPS27A
  • STUB1
  • SUG1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TRAP2
  • TRIM27
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP13
  • WWP2
  • XIAP
Bos taurus (cattle)
Regulation of NF-kappa B signaling
  • CASP8
  • CHUK
  • IKBIP
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKIP
  • IKKA
  • LRRC14
  • N4BP1
  • NEMO
  • NLRC5
  • NLRX1
  • RPS27A
  • TRAF2
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP14
Bos taurus (cattle)
Regulation of KIT signaling
  • CBL
  • FYN
  • GRB2
  • KIT
  • KITLG
  • LCK
  • LYN
  • PTPN6
  • SCF
  • SH2B2
  • SOS1
  • SRC
  • YES1
Bos taurus (cattle)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP1
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PAPPA2
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Regulation of IFNG signaling
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • JAK1
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTPN2
  • SOCS1
  • SOCS3
  • STAT1
Bos taurus (cattle)
Regulation of IFNA/IFNB signaling
  • IF1AG1
  • IF1AG8
  • IFNAC
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNAR2
  • JAK1
  • LOC100335490
  • LOC523244
  • LOC618947
  • LOC783912
  • PTPN1
  • PTPN11
  • PTPN6
  • STAT1
  • STAT2
  • TYK2
Bos taurus (cattle)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • LGR5
  • LRP5
  • LRP6
  • RNF43
  • RPS27A
  • RSPO1
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RSPO4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP8
  • WNT3A
Bos taurus (cattle)
Regulation of Complement cascade
  • ADIB
  • BF
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C4A
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C9
  • CD19
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHR5
  • CFI
  • CLU
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • ELANE
  • F2
  • GPR77
  • LOC100336868
  • LOC107131209
  • LOC519737
  • LOC616002
  • SERPING1
  • VTN
Bos taurus (cattle)
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • AMOT
  • ANGPTL4
  • CDH11
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
Bos taurus (cattle)
Regulated proteolysis of p75NTR
  • ADAM17
  • APH1A
  • APH1B
  • NCSTN
  • NFKB1
  • NGFR
  • PEN2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • RELA
  • TRAF6
Bos taurus (cattle)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCB11
  • ABCC3
  • ALB
  • FABP6
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • OSTA
  • OSTB
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B3
  • STARD5
Bos taurus (cattle)
Receptor-type tyrosine-protein phosphatases
  • LOC101901895
  • LRRC4B
  • NTRK3
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • PPFIBP1
  • PPFIBP2
  • PTPRD
  • PTPRF
  • PTPRS
  • SLITRK1
  • SLITRK2
  • SLITRK3
  • SLITRK4
  • SLITRK5
  • SLITRK6
Bos taurus (cattle)
Receptor Mediated Mitophagy
  • ATG12
  • ATG5
  • CK2A1
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • FUNDC1
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3
  • MAP1LC3A
  • MAP1LC3B
  • PGAM5
  • SRC
  • ULK1
Bos taurus (cattle)
Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway
  • CGA
  • CHST10
  • CHST8
  • FUCA1
  • FUT6
  • FUT8
  • LHB
  • MAN2A1
  • MAN2A2
  • MGAT2
Bos taurus (cattle)
RUNX3 regulates WNT signaling
  • CTNNB1
  • LEF1
  • RUNX3
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
Bos taurus (cattle)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • SERPINB13
Bos taurus (cattle)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024