GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 268 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF17
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF4C
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR2
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB2
  • HRAS
  • KGF
  • KRAS
  • NRAS
  • PTPN11
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
Regulation of TNFR1 signaling
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • CASP8
  • CASP9
  • CHUK
  • CLIP3
  • CYLD
  • IKBKB
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IRF9
  • MADD
  • MIB2
  • OPTN
  • OTUD1
  • OTUD7B
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIPK1
  • RPS27A
  • SPATA2
  • SPPL2A
  • SPPL2B
  • STUB1
  • TAX1BP1
  • TBK1
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAIP3
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2L3
  • ULK1
  • USP2
  • USP21
  • USP4
  • XIAP
Canis familiaris (dog)
Costimulation by the CD28 family
  • AILIM
  • BTLA
  • GRB2
  • ICOS
  • ICOSLG
  • LOC100856339
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN11
  • PTPN6
  • TNFRSF14
Canis familiaris (dog)
TNFs bind their physiological receptors
  • CD27
  • CD70
  • EDA
  • EDAR
  • EDARADD
  • LTA
  • MIIP
  • TNFB
  • TNFRSF11B
  • TNFRSF13B
  • TNFRSF14
  • TNFRSF17
  • TNFRSF18
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF4
  • TNFRSF6B
  • TNFRSF9
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF13
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF18
  • TNFSF4
  • TNFSF8
  • TNLG1D
  • TNLG2A
  • TNLG2B
  • TNLG3A
  • TNLG7A
Canis familiaris (dog)
Activation of the phototransduction cascade
  • CNGA1
  • CNGB1
  • GNAT1
  • GNB1
  • GNGT1
  • PDBS
  • PDE6A
  • PDE6B
  • PDE6G
  • PDEA
  • PDEB
  • PDEG
  • RHO
Canis familiaris (dog)
MAP2K and MAPK activation
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • F8VWF
  • FN1
  • HRAS
  • IL17RD
  • ITGA2B
  • ITGB3
  • KRAS
  • KSR1
  • KSR2
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK2
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP1
  • RAF1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • SRC
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • WDR83
Canis familiaris (dog)
Extracellular matrix organization
  • FN1
Canis familiaris (dog)
The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision)
  • ABCA4
  • CYP4V2
  • DHRS9
  • HSD17B6
  • LRAT
  • MYO7A
  • RBP1
  • RBP3
  • RBP4
  • RDH10
  • RDH12
  • RDH16
  • RDH5
  • RHO
  • RLBP1
  • RPE65
  • SDR9C7
  • STRA6
  • TTR
Canis familiaris (dog)
Stimuli-sensing channels
  • ANO1
  • ANO2
  • ANO3
  • ANO4
  • ANO5
  • ANO6
  • ANO7
  • ANO8
  • ANO9
  • ASIC1
  • ASIC2
  • ASIC3
  • ASIC4
  • ASIC5
  • ASPH
  • BEST1
  • BEST2
  • BEST3
  • BEST4
  • BSND
  • CALM2
  • CLCA1
  • CLCA2
  • CLCA4
  • CLCN1
  • CLCN2
  • CLCN4
  • CLCN5
  • CLCN6
  • CLCN7
  • CLCNK
  • CLCNKA
  • CLIC2
  • LOC119880472
  • NALCN
  • NEDD4L
  • OSTM1
  • RAF1
  • RPS27A
  • RYR1
  • RYR2
  • RYR3
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
  • SGK1
  • SGK3
  • SLC17A2
  • SLC9B1
  • SLC9B2
  • SLC9C2
  • SRI
  • STOM
  • STOML3
  • TPCN1
  • TPCN2
  • TRDN
  • TTYH1
  • TTYH2
  • TTYH3
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • UNC79
  • UNC80
  • WWP1
Canis familiaris (dog)
Formation of the cornified envelope
  • CAPN1
  • CAPNS1
  • CASP14
  • CSTA
  • DSC1
  • DSC3
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • EVPL
  • FLG
  • FURIN
  • JUP
  • KAZN
  • KLK12
  • KLK13
  • KLK14
  • LIPJ
  • LIPK
  • LIPM
  • LIPN
  • LOC119876865
  • PCSK6
  • PERP
  • PI3
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • PRSS8
  • RPTN
  • SPINK6
  • TCHH
  • TGM1
  • cystatin A
Canis familiaris (dog)
Histamine receptors
  • HRH1
  • HRH2
  • HRH3
  • HRH4
Canis familiaris (dog)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • CTNS
  • GLAST
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC25A26
  • SLC32A1
Canis familiaris (dog)
Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX)
  • ABCC1
  • ALOX15
  • ALOX5
  • ALOX5AP
  • CYP4A11
  • CYP4A37
  • CYP4A39
  • CYP4B1
  • CYP4F22
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT1
  • LOC119863926
  • LTA4H
  • LTC4S
  • MRP1
Canis familiaris (dog)
Apoptotic execution phase
  • BCAP31
  • CASP8
  • DNM1L
  • LOC119868890
  • STK24
Canis familiaris (dog)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • KL
Canis familiaris (dog)
Negative regulation of MET activity
  • CBL
  • EPS15
  • GRB2
  • HGF
  • HGS
  • LRIG1
  • MET
  • PTPN1
  • PTPN2
  • PTPRJ
  • RPS27A
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3KBP1
  • STAM
  • STAM2
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • USP8
Canis familiaris (dog)
Surfactant metabolism
  • ABCA3
  • ADGRF5
  • ADORA2A
  • ADRA2A
  • ADRA2C
  • CCDC59
  • CKAP4
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CTSH
  • GATA6
  • LMCD1
  • LOC610540
  • NAPSA
  • P2RY2
  • PGA
  • PGNA
  • RDC8
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SLC34A1
  • SLC34A2
  • TTF1
  • ZDHHC2
Canis familiaris (dog)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
Canis familiaris (dog)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APLP2
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • COA5
  • CP
  • CSF1
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FGA
  • FGF23
  • FGF8B
  • FN1
  • FSTL1
  • FSTL3
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC102156332
  • LOC481722
  • LOC607874
  • LTBP1
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MIA3
  • MXRA8
  • NOTUM
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • QSOX1
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SERPINA1
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • STC2
  • TGOLN2
  • TIMP1
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Canis familiaris (dog)
SHC-mediated cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • GRB2
  • HRAS
  • KL
  • KRAS
  • NRAS
  • SHC1
  • SOS1
Canis familiaris (dog)
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • CANX
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTRN1
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSE
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DLA-DMA
  • DLA-DMB
  • DLA-DOA
  • DLA-DQA1
  • DLA-DRA
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DQB2
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF18A
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF26A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KIF3A
  • KIF3C
  • KIF4A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIFAP3
  • KLC1
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100856399
  • LOC119868747
  • LOC119876190
  • LOC612266
  • OSBPL1A
  • PHLPP2
  • QTRT1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SEC13
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
Canis familiaris (dog)
Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins
  • AQP1
  • AQP2
  • AQP3
  • AQP4
  • AVP
  • AVPR2
  • GNAS
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG11
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG8
  • GNGT1
  • GNGT2
  • LOC119863873
  • MYO5B
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11FIP2
Canis familiaris (dog)
Negative regulation of FGFR1 signaling
  • ANOS1
  • CBL
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF17
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF3A
  • FGF4
  • FGF4B
  • FGF5
  • FGF6
  • FGF7A
  • FGF7B
  • FGF8
  • FGF8B
  • FGF9
  • FGFR1
  • FRS2
  • GRB2
  • KL
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PTPN11
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
Canis familiaris (dog)
Ub-specific processing proteases
  • ABCC7
  • ADRB2
  • ADRM1
  • AR
  • ARRB1
  • ARRB2
  • ATXN7
  • AXIN1
  • AXIN2
  • BECN1
  • BIRC2
  • BIRC3
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCP110
  • CDC20
  • CDC25A
  • CDK16
  • CFTR
  • CLSPN
  • CYLD
  • FKBP8
  • FOXO4
  • GATA3
  • H2AC1
  • H2AC13
  • H2AC14
  • H2AC16
  • H2AC19
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2BC10
  • H2BC15
  • H2BC2
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • HGS
  • HIF1A
  • IDE
  • IFIH1
  • IKBKG
  • IL33
  • KAT2A
  • KEAP1
  • LOC100686569
  • LOC100687259
  • LOC100688437
  • LOC119867694
  • LOC119867696
  • LOC119867718
  • LOC119868881
  • LOC119869165
  • LOC119869175
  • LOC119869178
  • LOC119869187
  • LOC119869258
  • LOC119874734
  • LOC482940
  • LOC610717
  • MAP3K7
  • MAT2B
  • MDM2
  • MDM4
  • MMAC1
  • MUL1
  • MYC
  • Madh3
  • NFKBIA
  • OTUB1
  • POLB
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA7
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTEN
  • PTRH2
  • RCE1
  • RHOT1
  • RIPK1
  • RNF123
  • RNF128
  • RNF146
  • RPS27A
  • RUVBL1
  • SIAH2
  • SMAD1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD7
  • SMURF2
  • STAM2
  • SUDS3
  • TAB1
  • TADA2B
  • TADA3
  • TAF10
  • TAF9B
  • TGFBR1
  • TNKS
  • TNKS2
  • TOMM20
  • TOMM70
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRRAP
  • UBA52
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP2
  • USP10
  • USP12
  • USP13
  • USP14
  • USP15
  • USP16
  • USP18
  • USP19
  • USP2
  • USP20
  • USP21
  • USP22
  • USP26
  • USP28
  • USP3
  • USP30
  • USP33
  • USP34
  • USP37
  • USP4
  • USP42
  • USP44
  • USP47
  • USP48
  • USP49
  • USP5
  • USP7
  • USP8
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
  • WDR20
  • WDR48
  • p53
Canis familiaris (dog)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • GAB2
  • GRB2
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL3
  • IL5
  • IL5RA
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • LOC100856339
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PTPN6
  • SHC1
  • SHIP2
  • SOS1
Canis familiaris (dog)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024