GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 126 - 150 of 557 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
MHC class II antigen presentation
  • ACTR10
  • ACTR1A
  • ACTR1B
  • AP1B1
  • AP1G1
  • AP1M1
  • AP1M2
  • AP1S1
  • AP1S2
  • AP1S3
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ARP10
  • BLA-DQB
  • BOLA-DMA
  • BOLA-DMB
  • BOLA-DOA
  • BOLA-DQA1
  • BOLA-DQA2
  • BOLA-DQA5
  • BOLA-DRA
  • BOLA-DRB2
  • BOLA-DRB3
  • BOLA-DYA
  • BOLA-DYB
  • BoLA-DIB
  • BoLA-DOB
  • BoLA-DRA
  • BoLA-DYB
  • CANX
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CD74
  • CENPE
  • CLTA
  • CLTC
  • CTSA
  • CTSB
  • CTSC
  • CTSD
  • CTSF
  • CTSH
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSS
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN6
  • DMB
  • DNCL1
  • DNM1
  • DNM3
  • DYB
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HLA-DMB
  • HLA-DRA
  • IFI30
  • KIF11
  • KIF15
  • KIF20A
  • KIF22
  • KIF23
  • KIF2B
  • KIF3A
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KLC1
  • KLC2
  • KLC3
  • KLC4
  • LAG3
  • LGMN
  • LOC100848815
  • OSBPL1A
  • RACGAP1
  • RILP
  • SAR1B
  • SEC13
  • SEC13L1
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SH3GL2
  • SPTBN2
  • canx
Bos taurus (cattle)
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • ARF1
  • GBF1
  • SNAP23
  • STX4
  • SYB2
  • VAMP2
  • VAMP8
Bos taurus (cattle)
VxPx cargo-targeting to cilium
  • ARF4
  • CNGA2
  • CNGA4
  • CNGB1
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • GBF1
  • PKD2
  • RAB11A
  • RAB11FIP3
  • RAB3IP
  • RAB8A
  • RHO
  • SEC6
  • TRPP2
Bos taurus (cattle)
Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network
  • ARFIP2
  • ARFRP1
  • ARL1
  • COG1
  • COG2
  • COG3
  • COG4
  • COG5
  • COG6
  • COG7
  • COG8
  • GCC1
  • GCC2
  • GOLGA1
  • GOLGA4
  • IGF2R
  • M6PR
  • M6PRBP1
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PLIN3
  • RAB6A
  • RAB6B
  • RAB9A
  • RAB9B
  • RABEPK
  • RGP1
  • RHOBTB3
  • RIC1
  • SCOC
  • SNAPB
  • STX10
  • STX16
  • STX6
  • SYS1
  • TMF1
  • VAMP4
  • VPS51
  • VPS52
  • VPS53
  • VPS54
  • VTI1A
Bos taurus (cattle)
Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane
  • AAC1
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • ARL2
  • ARL2BP
  • BART1
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SLC28A1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • SLC29A3
  • SLC29A4
Bos taurus (cattle)
Retinoid metabolism and transport
  • AGRN
  • AKR1B10
  • AKR1C4
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA4
  • APOB
  • APOC2
  • APOC3
  • APOE
  • BCO1
  • BCO2
  • CLPS
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPIHBP1
  • LOC101906939
  • LOC506594
  • LOC538060
  • LOC782061
  • LOC782884
  • LOC785762
  • LPL
  • LRAT
  • LRP1
  • LRP10
  • LRP12
  • LRP2
  • LRP8
  • PNLIP
  • RBP1
  • RBP2
  • RBP4
  • RDH11
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC4
  • TTR
Bos taurus (cattle)
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX)
  • AKR1C4
  • CBR1
  • CYP8
  • HPGDS
  • LOC506594
  • LOC538060
  • LOC782061
  • LOC782884
  • LOC785762
  • PTGDS
  • PTGES
  • PTGES2
  • PTGES3
  • PTGIS
  • PTGS1
  • PTGS2
  • TBXAS1
Bos taurus (cattle)
HSF1-dependent transactivation
  • AKT1S1
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CRYA2
  • CRYAB
  • DNAJB1
  • GBL
  • HSBP1
  • HSC70
  • HSF1
  • HSP70-1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSPA1A
  • HSPA1L
  • HSPA8
  • HSPB8
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • LST8
  • MLST8
  • MTOR
  • RPTOR
Bos taurus (cattle)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG12
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • DPAGT1
  • LOC107132045
  • MPDU1
Bos taurus (cattle)
Cell surface interactions at the vascular wall
  • AMICA1
  • APOB
  • CAR
  • CD177
  • CD18
  • CD2
  • CD44
  • CD47
  • CD48
  • CD58
  • CD74
  • CD84
  • CEACAM1
  • CXADR
  • EPCAM
  • EPCR
  • ESAM
  • F11R
  • F2
  • FCAMR
  • FCER1G
  • FN1
  • FYN
  • GAS6
  • GLG1
  • GPC1
  • IGJ
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAM1
  • JAM2
  • JAML
  • JCHAIN
  • LOC100336941
  • LYN
  • MERTK
  • MIF
  • OLR1
  • PECAM1
  • PPBP
  • PROC
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC4
  • SELE
  • SELP
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SPN
  • TGFB1
  • THBD
  • TREM1
Bos taurus (cattle)
Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell
  • AMICA1
  • B2M
  • BOLA
  • BOLA-NC1
  • C3
  • C5H12ORF53
  • CAR
  • CD18
  • CD19
  • CD1B5
  • CD200
  • CD200R
  • CD200R1
  • CD22
  • CD247
  • CD300A
  • CD300LB
  • CD300LF
  • CD300LG
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD40
  • CD40LG
  • CD81
  • CD8A
  • CD8B
  • CD99
  • CLEC4G
  • CLM9
  • CLP1
  • COLEC12
  • CRTAM
  • CXADR
  • DAP10
  • FCGR1A
  • HCST
  • ICAM1
  • ICAM3
  • ICAM5
  • IFITM3
  • ITGA4
  • ITGAL
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB7
  • JAML
  • KIR2DL1
  • KIR2DL5A
  • KIR2DS1
  • KIR3DL2
  • KIR3DS1
  • KLRF1
  • KLRK1
  • LOC100138951
  • LOC100850276
  • LOC100852061
  • LOC112443864
  • LOC112444847
  • LOC512286
  • LOC515418
  • LOC526163
  • LOC534578
  • LOC613699
  • LOC616254
  • LOC618268
  • LOC618463
  • LOC777594
  • LOC783508
  • MIC2
  • NCR3
  • NCR3LG1
  • NECTIN2
  • NPDC1
  • OSCAR
  • PIANP
  • PILRA
  • SIGLEC1
  • SIGLEC10
  • SLAMF6
  • SLAMF7
  • TNFRSF5
  • TRAV29-1
  • TREM1
  • TREML1
  • TREML2
  • ULBP13
  • ULBP17
  • ULBP21
  • VCAM1
Bos taurus (cattle)
Adherens junctions interactions
  • AFDN
  • ANG2
  • CADM1
  • CADM2
  • CADM3
  • CDH1
  • CDH10
  • CDH11
  • CDH12
  • CDH13
  • CDH15
  • CDH17
  • CDH18
  • CDH2
  • CDH24
  • CDH3
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH7
  • CDH8
  • CTNNA1
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • JUP
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PVRL4
  • RAA2
Bos taurus (cattle)
Miscellaneous transport and binding events
  • ADD1
  • ADD2
  • ADD3
  • ANKH
  • AZGP1
  • CTNS
  • DMT
  • DMTN
  • EPB49
  • LLRC8A
  • LOC104972276
  • LRRC8A
  • LRRC8B
  • LRRC8C
  • LRRC8D
  • LRRC8E
  • MAGT1
  • MRS2
  • NIPA1
  • NIPA2
  • NIPAL1
  • NIPAL2
  • NIPAL3
  • NIPAL4
  • PIP
  • SLC66A1
  • TUSC3
Bos taurus (cattle)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • AAK1
  • ADRB2
  • ADRBK1
  • ADRBK2
  • AGTR1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • AREG
  • ARRB1
  • ARRB2
  • AVP
  • AVPR2
  • BTC
  • CBL
  • CD3D
  • CD3G
  • CD4
  • CFTR
  • CHRM2
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTLB
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSN3
  • DAB2
  • DVL2
  • EGFR
  • EPGN
  • EPN1
  • EPN2
  • EPS15
  • EPS15L1
  • EREG
  • FCHO1
  • FCHO2
  • GPS1
  • GRB2
  • GRK2
  • GRK3
  • HBEGF
  • HGS
  • IGF2R
  • IL7R
  • ITSN1
  • ITSN2
  • KIAA0319
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LOC782101
  • LRP2
  • M6PR
  • NECAP1
  • NECAP2
  • NEDD8
  • REPS1
  • RPS27A
  • SCARB2
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • SLC18A3
  • SLC2A8
  • SNAP91
  • STAM
  • STAM2
  • STON1
  • STON2
  • SYB2
  • SYT1
  • SYT11
  • SYT8
  • SYT9
  • TACR1
  • TF
  • TFRC
  • TGFA
  • TOR1A
  • TOR1B
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBQLN1
  • UBQLN2
  • VAMP2
  • VAMP4
  • VAMP8
  • WNT5A
Bos taurus (cattle)
LDL clearance
  • AADACL1
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • CES3
  • CLTA
  • CLTC
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • NCEH1
  • NPC2
  • SOAT1
  • SOAT2
Bos taurus (cattle)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CAV1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FRAT2
  • FZD1
  • FZD2
  • FZD5
  • GSK3B
  • LRP5
  • LRP6
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WNT1
  • WNT3A
  • WNT8A
  • WNT8B
Bos taurus (cattle)
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • AMER1
  • APC
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB1
  • FRAT2
  • GSK3B
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
Bos taurus (cattle)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • APC
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • FNTA
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PTK2
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
Bos taurus (cattle)
Ovarian tumor domain proteases
  • APC
  • ARHA
  • CARD15
  • CDC2
  • CDK1
  • CDKN1
  • ESR
  • ESR1
  • IKBKG
  • NEMO
  • NOD2
  • NR3A1
  • OTUB1
  • OTUB2
  • OTUD3
  • OTUD7A
  • OTUD7B
  • PTEN
  • RHO12
  • RHOA
  • RIPK1
  • RIPK2
  • RNF128
  • RPS27A
  • TNIP1
  • TNIP2
  • TNIP3
  • TP53
  • TRAF3
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2D1
  • VCP
  • VCPIP1
  • YOD1
  • ZRANB1
Bos taurus (cattle)
Peptide ligand-binding receptors
  • ACKR1
  • AGT
  • AGTR1
  • AGTR2
  • APLN
  • APLNR
  • BDKRB2
  • BRS3
  • C3
  • C3AR1
  • C5
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • CCK
  • CCKBR
  • CORT
  • CXCL8
  • ECE1
  • ECE2
  • EDN1
  • EDN2
  • EDN3
  • EDNRA
  • EDNRB
  • F2
  • F2R
  • F2RL1
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GAL
  • GALN
  • GALR1
  • GALR2
  • GALR3
  • GPR10
  • GPR37
  • GPR37L1
  • GPR73L1
  • GPR77
  • GPR8
  • GRP
  • GRPR
  • IL8
  • KISS1
  • KISS1R
  • KNG1
  • LOC112445811
  • MC1R
  • MC2R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MCHR1
  • MCHR2
  • MLN
  • MLNR
  • MSHR
  • NLN
  • NMBR
  • NMS
  • NMUR1
  • NMUR2
  • NPB
  • NPBWR1
  • NPBWR2
  • NPS
  • NPSR1
  • NPY
  • NPY1R
  • NPY2R
  • NPY4R
  • NPY5R
  • NTS
  • NTSR1
  • NTSR2
  • OPRD1
  • OPRK1
  • OPRL1
  • OPRM1
  • PDYN
  • PENK
  • PKR2
  • PMCH
  • PNOC
  • POMC
  • PPY
  • PPYR1
  • PRLHR
  • PROK1
  • PROK2
  • PROKR2
  • PSAP
  • PYY
  • SERPINA8
  • SST
  • SSTR1
  • SSTR2
  • SSTR5
  • TRH
  • TRHR
  • mln
Bos taurus (cattle)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGF1
  • IGF2
  • IGFBP1
  • IGFBP2
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PAPPA2
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Post-translational protein phosphorylation
  • ADAM10
  • AFP
  • AHSG
  • ALB
  • AMBN
  • AMELX
  • AMTN
  • ANO8
  • APOA1
  • APOA2
  • APOA5
  • APOB
  • APOE
  • APOL3
  • APP
  • BMP15
  • BMP4
  • BPIFB2
  • C3
  • C4A
  • CALU
  • CCN1
  • CDH2
  • CHGB
  • CHGC
  • CHRDL1
  • CKAP4
  • CP
  • CSF1
  • CSPG2
  • CST3
  • DMP1
  • DNAJC3
  • ENAM
  • F5
  • FAM20A
  • FAM20C
  • FBN1
  • FETUA
  • FGA
  • FGF23
  • FN1
  • FSTL1
  • FUCA2
  • GAS6
  • GOLM1
  • GPC3
  • GRP94
  • HRC
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • IGFBP1
  • IGFBP3
  • IGFBP4
  • IGFBP5
  • IGFBP7
  • IL6
  • ITIH2
  • KNG1
  • KTN1
  • LGALS1
  • LOC107131209
  • LOC112442231
  • LOC112446726
  • LOC510193
  • LOC515697
  • LOC518495
  • LOC521214
  • LOC524576
  • LOC531557
  • LOC786352
  • LOC788334
  • LTBP1
  • MADM
  • MATN3
  • MBTPS1
  • MEGF6
  • MELTF
  • MEN1
  • MEPE
  • MFGE8
  • MGAT4A
  • MIA3
  • MXRA8
  • NUCB1
  • P4HB
  • PDIA6
  • PENK
  • PI
  • PNPLA2
  • PRKCSH
  • PROC
  • PRSS23
  • RCN1
  • SCG2
  • SCG3
  • SCOTIN
  • SDC2
  • SERPINA1
  • SERPINA10
  • SERPIND1
  • SHISA5
  • SPARCL1
  • SPP1
  • SPP2
  • SPP24
  • STC2
  • TF
  • TMEM132A
  • TNC
  • TRA1
  • VCAN
  • VGF
  • VWA1
  • WFS1
Bos taurus (cattle)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH1
  • ASAH2
  • CTSA
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • M6PR
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • PSAP
  • SMPD1
  • SMPD3
  • SMPD4
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
The activation of arylsulfatases
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSE
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSK
  • ARSL
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
Bos taurus (cattle)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BGN
  • CSPG2
  • CSPG4
  • CSPG5
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • HYAL3
  • IDS
  • IDUA
  • NCAN
  • VCAN
Bos taurus (cattle)

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Last updated: August 19, 2024