GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 726 - 750 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Prostanoid ligand receptors
  • CRTH2
  • DL1R
  • GPR44
  • PRIPR
  • PTGDR
  • PTGDR2
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
Homo sapiens (human)
Signaling by SCF-KIT
  • APRF
  • CHEK1
  • CHK1
  • CLG4B
  • CMA1
  • CYH
  • CYM
  • FER
  • FES
  • FMI
  • FPS
  • FYN
  • GAB2
  • GADS
  • GRAP
  • GRAP2
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB2L
  • GRB7
  • GRBIR
  • GRID
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIAA0207
  • KIAA0571
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • MMP9
  • NRAS
  • PCP2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PSCTK4
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPRO
  • PTPRU
  • RAC1
  • SCFR
  • SHPTP2
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TC25
  • TEC
  • TYK3
  • VAV
  • VAV1
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II Transcription Termination
  • ALY
  • ALYREF
  • ASF
  • BAT1
  • BEF
  • C1orf77
  • C22orf19
  • CASC3
  • CBP20
  • CBP80
  • CDC40
  • CFIM25
  • CHTOP
  • CLP1
  • COD
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • CXorf3
  • DDX38
  • DDX39
  • DDX39A
  • DDX39B
  • DDX48
  • DHX38
  • EHB3
  • EIF4A3
  • FIP1
  • FIP1L1
  • FOP
  • FYTTD1
  • HBP
  • HCC1
  • HEAB
  • HPR1
  • HRS
  • KIAA0111
  • KIAA0224
  • KIAA0663
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA0983
  • KIAA1141
  • KIAA1367
  • KIAA1649
  • LDC2
  • LSM10
  • LSM11
  • LUZP4
  • MAGOH
  • MAGOH2
  • MAGOHA
  • MAGOHB
  • MLN51
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NIF3L1BP1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PBSCF
  • PBSCG
  • PCF11
  • PDIP46
  • POLDIP3
  • PRP16
  • PRP17
  • PRPF17
  • RBM8
  • RBM8A
  • RENT3B
  • RHE
  • RNPS1
  • SARNP
  • SF2
  • SF2P33
  • SFRS1
  • SFRS11
  • SFRS2
  • SFRS3
  • SFRS4
  • SFRS5
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SFRS9
  • SLBP
  • SLU7
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • SPK
  • SRM160
  • SRP20
  • SRP30C
  • SRP40
  • SRP55
  • SRP75
  • SRRM1
  • SRSF1
  • SRSF11
  • SRSF2
  • SRSF3
  • SRSF4
  • SRSF5
  • SRSF6
  • SRSF7
  • SRSF9
  • SYMPK
  • THOC1
  • THOC2
  • THOC3
  • THOC4
  • THOC5
  • THOC6
  • THOC7
  • U2AF1
  • U2AF1-RS3
  • U2AF1L3
  • U2AF1L4
  • U2AF2
  • U2AF35
  • U2AF65
  • U2AFBP
  • UAP56
  • UIF
  • UPF3B
  • UPF3X
  • WDC146
  • WDR33
  • WDR58
  • ZC3H11A
  • ZC3HDC11A
  • ZFP100
  • ZNF473
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PC
  • AGPAT11
  • AGPAT7
  • AYTL1
  • AYTL2
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • IPLA22
  • IPLA2G
  • LPCAT1
  • LPCAT2
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT2
  • MBOAT5
  • OACT2
  • OACT5
  • PFAAP3
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2G6
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PLB
  • PLB1
  • PLBD1
  • PLPLA9
  • PNPLA8
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
  • TMEM86B
Homo sapiens (human)
Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • ARL2
  • ARL2BP
  • BART
  • BART1
  • CNT1
  • CNT2
  • CNT3
  • DER12
  • ENT1
  • ENT2
  • ENT3
  • ENT4
  • HNP36
  • PMAT
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SLC28A1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • SLC29A3
  • SLC29A4
Homo sapiens (human)
Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization
  • BLZF1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK2
  • GOLGA2
  • GOLPH5
  • GOLPH6
  • GORASP1
  • GORASP2
  • GRASP65
  • JEM1
  • MAPK1
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB2
  • RAB2A
  • USO1
  • VDP
Homo sapiens (human)
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK
  • BMK1
  • CCKBR
  • CCKRB
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • GAS
  • GAST
  • ISPK1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
Homo sapiens (human)
NrCAM interactions
  • ANK
  • ANK1
  • AXT
  • CNTN2
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • KIAA0343
  • KIAA1232
  • NRCAM
  • NRP2
  • PSD95
  • TAG1
  • TAX1
  • VEGF165R2
Homo sapiens (human)
quizartinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Defective SLC29A3 causes histiocytosis-lymphadenopathy plus syndrome (HLAS)
  • ENT3
  • SLC29A3
Homo sapiens (human)
COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic
  • ACTR10
  • ACTR11
  • ACTR1A
  • AGPAT3
  • ARP10
  • ARP11
  • BICD1
  • BICD2
  • CAPAA3
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CPLA2
  • CTRN1
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN50
  • DCTN6
  • DHC1
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • GALNT1
  • GALNT2
  • GSG3
  • HDLC1
  • KIAA0066
  • KIAA0325
  • KIAA0699
  • KIAA0839
  • LIC2
  • LIS1
  • LPAAT3
  • MDCR
  • MDS
  • PAFAH1B1
  • PAFAH1B2
  • PAFAH1B3
  • PAFAHA
  • PAFAHB
  • PAFAHG
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G6
  • PLPLA9
  • RAB18
  • RAB3GAP
  • RAB3GAP1
  • RAB3GAP2
  • RAB6
  • RAB6A
  • RAB6B
  • WS3
Homo sapiens (human)
Loss of Function of FBXW7 in Cancer and NOTCH1 Signaling
  • CUL1
  • EMC19
  • NOTCH1
  • OCP2
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • SKP1
  • SKP1A
  • TAN1
  • TCEB1L
Homo sapiens (human)
Prolactin receptor signaling
  • BTRC
  • BTRCP
  • CSH1
  • CUL1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GH1
  • GH2
  • GHR
  • JAK2
  • OCP2
  • PRL
  • PRLR
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • SHPTP2
  • SKP1
  • SKP1A
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TCEB1L
Homo sapiens (human)
Pregnenolone biosynthesis
  • ADX
  • ADXR
  • AKR1B1
  • ALDR1
  • ALR2
  • BZRAP1
  • BZRP
  • CAB1
  • CYP11A
  • CYP11A1
  • FDX1
  • FDX1L
  • FDX2
  • FDXR
  • KIAA0612
  • MBR
  • MENTHO
  • MLN64
  • RBP1
  • RIMBP1
  • STAR
  • STARD1
  • STARD3
  • STARD3NL
  • STARD4
  • STARD6
  • TSPO
  • TSPOAP1
Homo sapiens (human)
Defective visual phototransduction due to OPN1MW loss of function
  • GCP
  • OPN1MW
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
Hh mutants are degraded by ERAD
  • ADRM1
  • C2orf30
  • C7orf76
  • DER2
  • DERL2
  • DSS1
  • ERLEC1
  • FLANA
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HRD1
  • HSPC
  • KIAA0107
  • KIAA1810
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OS9
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SHH
  • SUG1
  • SUG2
  • SYVN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSA305
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
  • X
  • XTP3TPB
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Linoleic acid (LA) metabolism
  • ABCD1
  • ACSL1
  • ALD
  • CIG30
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
FGFR3b ligand binding and activation
  • FGF1
  • FGF18
  • FGF20
  • FGF9
  • FGFA
Homo sapiens (human)
Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB
  • MAOA
  • MAOB
Homo sapiens (human)
Defective ABCD4 causes MAHCJ
  • ABCD4
  • C6orf209
  • LMBRD1
  • NESI
  • PXMP1L
Homo sapiens (human)
KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA
  • AKT1
  • CML28
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSL4
  • CSPB1
  • DAN
  • DCP2
  • DIS3
  • EXOSC1
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • FUBP2
  • KHSRP
  • KIAA0116
  • KIAA1008
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MTR3
  • MXI2
  • NUDT20
  • OIP2
  • PARN
  • PKB
  • PMSCL1
  • PRKM11
  • RAC
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKI6
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Sperm Motility And Taxes
  • C14orf161
  • C19orf15
  • CATSPER1
  • CATSPER2
  • CATSPER3
  • CATSPER4
  • CATSPERB
  • CATSPERD
  • CATSPERG
  • HVCN1
  • KCNMA3
  • KCNMC1
  • KCNU1
  • SLO3
  • TMEM146
  • VSOP
Homo sapiens (human)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGFB
  • FGFR5
  • FGFRL1
  • FHFR
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • SPRED1
  • SPRED2
Homo sapiens (human)
Reduction of cytosolic Ca++ levels
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CNC
  • KIAA1087
  • MXRA1
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • PMCA1
  • PMCA2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024