GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 51 - 75 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
PTK6 Down-Regulation
  • BRK
  • C20orf148
  • PTK6
  • PTP1B
  • PTPN1
  • SRMS
Homo sapiens (human)
Maturation of protein E
  • E
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Deadenylation of mRNA
  • C2orf29
  • CAF1
  • CALIF
  • CCR4
  • CCR4B
  • CCR4a
  • CDC36
  • CDC39
  • CNOT1
  • CNOT10
  • CNOT11
  • CNOT2
  • CNOT3
  • CNOT4
  • CNOT6
  • CNOT6L
  • CNOT7
  • CNOT8
  • CNOT9
  • DAN
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • HS2
  • KIAA0111
  • KIAA0191
  • KIAA0691
  • KIAA0710
  • KIAA1007
  • KIAA1194
  • KIAA1711
  • KIAA1741
  • LENG2
  • NOT1
  • NOT2
  • NOT3
  • NOT4
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PAIP1
  • PAN2
  • PAN3
  • PARN
  • POP2
  • RCD1
  • RQCD1
  • TAB182
  • TNKS1BP1
  • TUT4
  • TUT7
  • USP52
  • ZCCHC11
  • ZCCHC6
Homo sapiens (human)
Defective Mismatch Repair Associated With MSH3
  • DUC1
  • DUG
  • MSH2
  • MSH3
Homo sapiens (human)
Ribosomal scanning and start codon recognition
  • CCG2
  • D6S218E
  • DDX2A
  • DDX2B
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4C
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • EIF5
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0038
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • PCID1
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • TRIP1
  • UBA80
  • UBCEP1
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)
Interleukin-12 signaling
  • ERBA2L
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12R
  • IL12RB
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • NKSF1
  • NKSF2
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
  • STAT4
  • SYBL1
  • TYK2
  • VAMP7
Homo sapiens (human)
EPHB-mediated forward signaling
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARC16
  • ARC20
  • ARC21
  • ARC34
  • ARC41
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGEF28
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • CDC42
  • CFL
  • CFL1
  • DUET
  • DUO
  • FAK
  • FAK1
  • FYN
  • GAP
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • HAPIP
  • HRAS
  • HRAS1
  • HSPG1
  • ITSN
  • ITSN1
  • JTK8
  • KALRN
  • KIAA0619
  • KIAA1998
  • LIMK
  • LIMK1
  • LIMK2
  • LYN
  • NMDAR1
  • NMDAR2B
  • PAK1
  • PTK2
  • RAC1
  • RASA
  • RASA1
  • RGNEF
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SDC2
  • SH3D1A
  • SOP2L
  • TC25
  • TIAM1
  • TRAD
  • WASL
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Transport of Ribonucleoproteins into the Host Nucleus
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • KPNB1
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Defective F8 secretion
  • F8
  • F8C
Homo sapiens (human)
Syndecan interactions
  • ACTN1
  • CASK
  • CD49B
  • FGF2
  • FGFB
  • FNRB
  • GP3A
  • HSPG1
  • HXB
  • ITGA2
  • ITGA6
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB4
  • ITGB5
  • KIAA0468
  • LIN2
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • SBDN
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TGFB
  • TGFB1
  • THBS1
  • TNC
  • TRAPPC4
  • TSP
  • TSP1
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
  • CD39
  • CD39L1
  • CD39L2
  • CD39L3
  • CD39L4
  • ENTPD1
  • ENTPD2
  • ENTPD3
  • ENTPD4
  • ENTPD5
  • ENTPD6
  • ENTPD7
  • ENTPD8
  • IL6ST2
  • KIAA0392
  • LALP1
  • LALP70
  • LYSAL1
  • PCPH
Homo sapiens (human)
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer
  • DPC4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
Homo sapiens (human)
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC)
  • BBC1
  • CBP20
  • CBP80
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • ERF1
  • ERF3A
  • ERF3B
  • ETF1
  • FAU
  • FTE1
  • GSPT1
  • GSPT2
  • KIAA0221
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEDD6
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • QM
  • RENT1
  • RF1
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SUP45L1
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UPF1
Homo sapiens (human)
MPS IV - Morquio syndrome A
  • GALNS
Homo sapiens (human)
p75NTR recruits signalling complexes
  • CARDIAK
  • DXS1179E
  • IKBKB
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • MYD88
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • ORCA
  • OSIL
  • PRKCI
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TNFRSF16
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
PI3K events in ERBB2 signaling
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • GAB1
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • SMDF
Homo sapiens (human)
Oleoyl-phe metabolism
  • PM20D1
Homo sapiens (human)
GSD XV
  • GYG
  • GYG1
  • GYS
  • GYS1
Homo sapiens (human)
VEGFR2 mediated vascular permeability
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • C20orf97
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV
  • CAV1
  • CDH5
  • CTMP
  • CTNNA1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • CTNNG
  • DP3
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • JUP
  • KIAA0384
  • KIAA1999
  • LST8
  • M
  • MAPKAP1
  • MIP1
  • MLST8
  • MTOR
  • N
  • NIPK
  • NOS3
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PDK1
  • PDPK1
  • PKB
  • PKBG
  • PROTOR1
  • PRR5
  • RAC
  • RAC1
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RICTOR
  • SIN1
  • SKIP3
  • TC25
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
Homo sapiens (human)
Defective SLC9A9 causes autism 16 (AUTS16)
  • NHE9
  • SLC9A9
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation by the AP-2 (TFAP2) family of transcription factors
  • AP2TF
  • APOE
  • DEK
  • TFAP2
  • TFAP2A
Homo sapiens (human)
Signaling by ERBB4
  • BTC
  • DLG4
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • GABRA1
  • GABRB1
  • GABRB2
  • GABRB3
  • GABRG2
  • GABRG3
  • GABRQ
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HGL
  • HRGA
  • NDF
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PSD95
  • SMDF
Homo sapiens (human)
Synthesis of wybutosine at G37 of tRNA(Phe)
  • C1orf171
  • C2orf60
  • KIAA0547
  • KIAA1393
  • LCMT2
  • RSAFD1
  • TRM12
  • TRM5
  • TRMT12
  • TRMT5
  • TYW1
  • TYW2
  • TYW3
  • TYW4
  • TYW5
Homo sapiens (human)
NCAM signaling for neurite out-growth
  • BSPECV
  • ERK1
  • ERK2
  • FAK
  • FAK1
  • FYN
  • HRAS
  • HRAS1
  • HUBSPECV
  • HUSPECV
  • KIAA0302
  • KIAA1642
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MSK1
  • NCAM
  • NCAM1
  • NEAS
  • NRAS
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTK2
  • PTPA
  • PTPRA
  • PTPRL2
  • RPS6KA5
  • SCA5
  • SOS1
  • SPTA
  • SPTA1
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTB1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN3
  • SPTBN4
  • SPTBN5
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type G (botG)
  • SVP65
  • SYB1
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • VAMP1
  • VAMP2
  • botG
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024