GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1326 - 1350 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Defective SLC7A7 causes lysinuric protein intolerance (LPI)
  • MDU1
  • SLC3A2
  • SLC7A7
Homo sapiens (human)
Basigin interactions
  • ASC1
  • ATP1B
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BAT1
  • BSG
  • CAML1
  • CAV
  • CAV1
  • CD43
  • CD98LC
  • CLG
  • CYPA
  • FNRB
  • GMA
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • KIAA0245
  • L1CAM
  • LAT1
  • LAT2
  • MAG
  • MCT1
  • MCT3
  • MCT4
  • MDF2
  • MDU1
  • MIC5
  • MMP1
  • MPE16
  • MSK12
  • MSK18
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A1
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Homo sapiens (human)
Defective SLC3A1 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A9 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • ASC1
  • ASCT1
  • ASCT2
  • ATA1
  • ATA2
  • ATA3
  • ATRC1
  • ATRC3
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BAT1
  • BGT1
  • C14orf69
  • CAT3
  • CD98LC
  • ERR
  • G17
  • JM24
  • KIAA0245
  • KIAA1382
  • LAT1
  • LAT2
  • LAT3
  • LAT4
  • M7V1
  • MCT10
  • MDU1
  • MPE16
  • NAT1
  • NAT2
  • NAT3
  • NBAT
  • NTT73
  • ORNT3
  • PAT1
  • PAT2
  • PAT4
  • PB39
  • POV1
  • RDR
  • RDRC
  • REC1L
  • SAT1
  • SAT2
  • SATT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC16A10
  • SLC1A4
  • SLC1A5
  • SLC25A29
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • SLC36A4
  • SLC38A1
  • SLC38A2
  • SLC38A3
  • SLC38A4
  • SLC38A5
  • SLC3A1
  • SLC3A2
  • SLC43A1
  • SLC43A2
  • SLC6A12
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A20
  • SLC6A6
  • SLC7A1
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A3
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SN1
  • SN2
  • SNAT1
  • SNAT2
  • SNAT3
  • SNAT4
  • SNAT5
  • TAT1
  • TRAMD1
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Defective MAOA causes BRUNS
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Clearance of dopamine
  • DAT1
  • MAOA
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIP1
  • MAOA
  • OCT1
  • OCT2
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVMT
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VMAT2
Homo sapiens (human)
Enzymatic degradation of Dopamine by monoamine oxidase
  • COMT
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • COMT
  • COMT2
  • LRTOMT
  • MAOA
  • TOMT
Homo sapiens (human)
Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB
  • MAOA
  • MAOB
Homo sapiens (human)
Sensory perception of salty taste
  • CALHM1
  • CALHM3
  • DNACH
  • FAM26A
  • FAM26C
  • SCNN1
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
Homo sapiens (human)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • C6orf134
  • HDAC6
  • KIAA0901
  • MEC17
Homo sapiens (human)
Other interleukin signaling
  • C16orf77
  • C17orf33
  • CASP3
  • CD4
  • CPP32
  • CRFB4
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • D21S58
  • D21S66
  • FMS
  • GCSF
  • GCSFR
  • HTPZP2
  • IFNL1
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL16
  • IL28RA
  • IL29
  • IL32
  • IL34
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • LICR2
  • MBN
  • NK4
  • PRTN3
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
  • SDC
  • SDC1
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • STX3
  • STX3A
  • STX4
  • STX4A
  • STXBP2
  • SYB2
  • TAIF
  • TXLN
  • TXLNA
  • TYK2
  • UNC18B
  • VAMP2
  • ZCYTO21
Homo sapiens (human)
ALPK1 signaling pathway
  • ALPK1
  • KIAA0733
  • KIAA1527
  • LAK
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • RNF85
  • RPS27A
  • T2BP
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions
  • FNRB
  • ILK
  • ILK1
  • ILK2
  • ITGB1
  • MDF2
  • MSK12
  • MXRA2
  • PARVA
  • PXN
Homo sapiens (human)
Cell-extracellular matrix interactions
  • ABPL
  • FBLIM1
  • FBLP1
  • FERMT2
  • FLN
  • FLN1
  • FLN2
  • FLNA
  • FLNC
  • ILK
  • ILK1
  • ILK2
  • KIND2
  • LIMS1
  • LIMS2
  • MIG2
  • MXRA2
  • PARVA
  • PARVB
  • PINCH
  • PINCH1
  • PINCH2
  • PLEKHC1
  • VASP
Homo sapiens (human)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • KIAA0935
  • LAMAN
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANA
  • MANA1
  • MANB
  • MANB1
  • MANBA
Homo sapiens (human)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GGTB2
  • GLUT1
  • LALBA
  • LYZL7
  • SLC2A1
Homo sapiens (human)
Reversal of alkylation damage by DNA dioxygenases
  • ABH5
  • ALKBH5
  • FTO
  • KIAA1752
  • OFOXD1
Homo sapiens (human)
Mitochondrial translation termination
  • AIP
  • AKIP
  • AURKAIP1
  • BMRP
  • BRIP1
  • C10orf34
  • C11orf4
  • C15orf4
  • C20orf193
  • C21orf101
  • C21orf92
  • C2orf1
  • C3orf5
  • C6orf14
  • CHCHD1
  • DAP3
  • DS1
  • EFG2
  • ERAL1
  • GADD45GIP1
  • GFM2
  • HERA
  • ICT1
  • IMOGN38
  • KGD4
  • KIAA0104
  • KIAA0264
  • L23MRP
  • LIECG2
  • LIP2
  • MAAT1
  • MRL3
  • MRP63
  • MRP64
  • MRPL1
  • MRPL10
  • MRPL11
  • MRPL12
  • MRPL13
  • MRPL14
  • MRPL15
  • MRPL16
  • MRPL17
  • MRPL18
  • MRPL19
  • MRPL2
  • MRPL20
  • MRPL21
  • MRPL22
  • MRPL23
  • MRPL24
  • MRPL25
  • MRPL27
  • MRPL28
  • MRPL3
  • MRPL30
  • MRPL31
  • MRPL32
  • MRPL33
  • MRPL34
  • MRPL35
  • MRPL36
  • MRPL37
  • MRPL38
  • MRPL39
  • MRPL4
  • MRPL40
  • MRPL41
  • MRPL42
  • MRPL43
  • MRPL44
  • MRPL45
  • MRPL46
  • MRPL47
  • MRPL48
  • MRPL49
  • MRPL5
  • MRPL50
  • MRPL51
  • MRPL52
  • MRPL53
  • MRPL54
  • MRPL55
  • MRPL57
  • MRPL58
  • MRPL59
  • MRPL7
  • MRPL8
  • MRPL9
  • MRPS10
  • MRPS11
  • MRPS12
  • MRPS14
  • MRPS15
  • MRPS16
  • MRPS17
  • MRPS18A
  • MRPS18B
  • MRPS18C
  • MRPS2
  • MRPS21
  • MRPS22
  • MRPS23
  • MRPS24
  • MRPS25
  • MRPS26
  • MRPS27
  • MRPS28
  • MRPS29
  • MRPS30
  • MRPS31
  • MRPS32
  • MRPS33
  • MRPS34
  • MRPS35
  • MRPS36
  • MRPS37
  • MRPS38
  • MRPS39
  • MRPS5
  • MRPS6
  • MRPS7
  • MRPS9
  • MRRF
  • MTRF1A
  • MTRF1L
  • NCM1
  • NLVCF
  • NOF1
  • OXA1L
  • PDCD9
  • PLINP1
  • PRG6
  • PTCD3
  • RPL23L
  • RPML12
  • RPML2
  • RPML25
  • RPML27
  • RPML28
  • RPML3
  • RPML31
  • RPML32
  • RPML5
  • RPML8
  • RPMS11
  • RPMS12
  • RPMS13
  • RPMS15
  • RPMS16
  • RPMS17
  • RPMS21
  • RPMS22
  • RPMS25
  • RPMS6
  • RPMS9
  • RPSM12
  • URIM
Homo sapiens (human)
Mitochondrial translation initiation
  • AIP
  • AKIP
  • AURKAIP1
  • BMRP
  • BRIP1
  • C10orf34
  • C11orf4
  • C15orf4
  • C20orf193
  • C21orf101
  • C21orf92
  • C2orf1
  • C3orf5
  • C6orf14
  • CHCHD1
  • DAP3
  • DS1
  • ERAL1
  • FMT
  • FMT1
  • GADD45GIP1
  • HERA
  • ICT1
  • IMOGN38
  • KGD4
  • KIAA0104
  • KIAA0264
  • L23MRP
  • LIECG2
  • LIP2
  • MAAT1
  • MRL3
  • MRP63
  • MRP64
  • MRPL1
  • MRPL10
  • MRPL11
  • MRPL12
  • MRPL13
  • MRPL14
  • MRPL15
  • MRPL16
  • MRPL17
  • MRPL18
  • MRPL19
  • MRPL2
  • MRPL20
  • MRPL21
  • MRPL22
  • MRPL23
  • MRPL24
  • MRPL25
  • MRPL27
  • MRPL28
  • MRPL3
  • MRPL30
  • MRPL31
  • MRPL32
  • MRPL33
  • MRPL34
  • MRPL35
  • MRPL36
  • MRPL37
  • MRPL38
  • MRPL39
  • MRPL4
  • MRPL40
  • MRPL41
  • MRPL42
  • MRPL43
  • MRPL44
  • MRPL45
  • MRPL46
  • MRPL47
  • MRPL48
  • MRPL49
  • MRPL5
  • MRPL50
  • MRPL51
  • MRPL52
  • MRPL53
  • MRPL54
  • MRPL55
  • MRPL57
  • MRPL58
  • MRPL59
  • MRPL7
  • MRPL8
  • MRPL9
  • MRPS10
  • MRPS11
  • MRPS12
  • MRPS14
  • MRPS15
  • MRPS16
  • MRPS17
  • MRPS18A
  • MRPS18B
  • MRPS18C
  • MRPS2
  • MRPS21
  • MRPS22
  • MRPS23
  • MRPS24
  • MRPS25
  • MRPS26
  • MRPS27
  • MRPS28
  • MRPS29
  • MRPS30
  • MRPS31
  • MRPS32
  • MRPS33
  • MRPS34
  • MRPS35
  • MRPS36
  • MRPS37
  • MRPS38
  • MRPS39
  • MRPS5
  • MRPS6
  • MRPS7
  • MRPS9
  • MTFMT
  • MTIF2
  • MTIF3
  • NCM1
  • NLVCF
  • NOF1
  • OXA1L
  • PDCD9
  • PLINP1
  • PRG6
  • PTCD3
  • RPL23L
  • RPML12
  • RPML2
  • RPML25
  • RPML27
  • RPML28
  • RPML3
  • RPML31
  • RPML32
  • RPML5
  • RPML8
  • RPMS11
  • RPMS12
  • RPMS13
  • RPMS15
  • RPMS16
  • RPMS17
  • RPMS21
  • RPMS22
  • RPMS25
  • RPMS6
  • RPMS9
  • RPSM12
  • URIM
Homo sapiens (human)
Mitochondrial translation elongation
  • AIP
  • AKIP
  • AURKAIP1
  • BMRP
  • BRIP1
  • C10orf34
  • C11orf4
  • C15orf4
  • C20orf193
  • C21orf101
  • C21orf92
  • C2orf1
  • C3orf5
  • C6orf14
  • CHCHD1
  • DAP3
  • DS1
  • EFG
  • EFG1
  • ERAL1
  • GADD45GIP1
  • GFM
  • GFM1
  • HERA
  • ICT1
  • IMOGN38
  • KGD4
  • KIAA0104
  • KIAA0264
  • L23MRP
  • LIECG2
  • LIP2
  • MAAT1
  • MRL3
  • MRP63
  • MRP64
  • MRPL1
  • MRPL10
  • MRPL11
  • MRPL12
  • MRPL13
  • MRPL14
  • MRPL15
  • MRPL16
  • MRPL17
  • MRPL18
  • MRPL19
  • MRPL2
  • MRPL20
  • MRPL21
  • MRPL22
  • MRPL23
  • MRPL24
  • MRPL25
  • MRPL27
  • MRPL28
  • MRPL3
  • MRPL30
  • MRPL31
  • MRPL32
  • MRPL33
  • MRPL34
  • MRPL35
  • MRPL36
  • MRPL37
  • MRPL38
  • MRPL39
  • MRPL4
  • MRPL40
  • MRPL41
  • MRPL42
  • MRPL43
  • MRPL44
  • MRPL45
  • MRPL46
  • MRPL47
  • MRPL48
  • MRPL49
  • MRPL5
  • MRPL50
  • MRPL51
  • MRPL52
  • MRPL53
  • MRPL54
  • MRPL55
  • MRPL57
  • MRPL58
  • MRPL59
  • MRPL7
  • MRPL8
  • MRPL9
  • MRPS10
  • MRPS11
  • MRPS12
  • MRPS14
  • MRPS15
  • MRPS16
  • MRPS17
  • MRPS18A
  • MRPS18B
  • MRPS18C
  • MRPS2
  • MRPS21
  • MRPS22
  • MRPS23
  • MRPS24
  • MRPS25
  • MRPS26
  • MRPS27
  • MRPS28
  • MRPS29
  • MRPS30
  • MRPS31
  • MRPS32
  • MRPS33
  • MRPS34
  • MRPS35
  • MRPS36
  • MRPS37
  • MRPS38
  • MRPS39
  • MRPS5
  • MRPS6
  • MRPS7
  • MRPS9
  • NCM1
  • NLVCF
  • NOF1
  • OXA1L
  • PDCD9
  • PLINP1
  • PRG6
  • PTCD3
  • RPL23L
  • RPML12
  • RPML2
  • RPML25
  • RPML27
  • RPML28
  • RPML3
  • RPML31
  • RPML32
  • RPML5
  • RPML8
  • RPMS11
  • RPMS12
  • RPMS13
  • RPMS15
  • RPMS16
  • RPMS17
  • RPMS21
  • RPMS22
  • RPMS25
  • RPMS6
  • RPMS9
  • RPSM12
  • TSFM
  • TUFM
  • URIM
Homo sapiens (human)
The NLRP3 inflammasome
  • A4
  • AD1
  • APP
  • ASC
  • C1orf7
  • CARD5
  • CASP1
  • CD2BP1
  • CIAS1
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • LYT10
  • MEF
  • MEFV
  • MRS1
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX1
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RELA
  • SUGT1
  • TMS1
  • TRDX
  • TRIM20
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
  • TXNIP
  • VDUP1
  • hla
  • hly
Homo sapiens (human)
Gluconeogenesis
  • ALDA
  • ALDB
  • ALDC
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • C10orf134
  • ENO1
  • ENO1L1
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • FBP
  • FBP1
  • FBP2
  • G3PP
  • G6PC
  • G6PC1
  • G6PC2
  • G6PC3
  • G6PT
  • G6PT1
  • GAPD
  • GAPD2
  • GAPDH
  • GAPDH2
  • GAPDHS
  • GAPDS
  • GPI
  • IGRP
  • MBPB1
  • MPB1
  • PC
  • PCK1
  • PCK2
  • PEPCK1
  • PEPCK2
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGAMA
  • PGAMM
  • PGK1
  • PGK2
  • PGKA
  • PGKB
  • SLC37A1
  • SLC37A4
  • TPI
  • TPI1
  • UGRP
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024