GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 726 - 750 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Mitochondrial translation termination
  • AIP
  • AKIP
  • AURKAIP1
  • BMRP
  • BRIP1
  • C10orf34
  • C11orf4
  • C15orf4
  • C20orf193
  • C21orf101
  • C21orf92
  • C2orf1
  • C3orf5
  • C6orf14
  • CHCHD1
  • DAP3
  • DS1
  • EFG2
  • ERAL1
  • GADD45GIP1
  • GFM2
  • HERA
  • ICT1
  • IMOGN38
  • KGD4
  • KIAA0104
  • KIAA0264
  • L23MRP
  • LIECG2
  • LIP2
  • MAAT1
  • MRL3
  • MRP63
  • MRP64
  • MRPL1
  • MRPL10
  • MRPL11
  • MRPL12
  • MRPL13
  • MRPL14
  • MRPL15
  • MRPL16
  • MRPL17
  • MRPL18
  • MRPL19
  • MRPL2
  • MRPL20
  • MRPL21
  • MRPL22
  • MRPL23
  • MRPL24
  • MRPL25
  • MRPL27
  • MRPL28
  • MRPL3
  • MRPL30
  • MRPL31
  • MRPL32
  • MRPL33
  • MRPL34
  • MRPL35
  • MRPL36
  • MRPL37
  • MRPL38
  • MRPL39
  • MRPL4
  • MRPL40
  • MRPL41
  • MRPL42
  • MRPL43
  • MRPL44
  • MRPL45
  • MRPL46
  • MRPL47
  • MRPL48
  • MRPL49
  • MRPL5
  • MRPL50
  • MRPL51
  • MRPL52
  • MRPL53
  • MRPL54
  • MRPL55
  • MRPL57
  • MRPL58
  • MRPL59
  • MRPL7
  • MRPL8
  • MRPL9
  • MRPS10
  • MRPS11
  • MRPS12
  • MRPS14
  • MRPS15
  • MRPS16
  • MRPS17
  • MRPS18A
  • MRPS18B
  • MRPS18C
  • MRPS2
  • MRPS21
  • MRPS22
  • MRPS23
  • MRPS24
  • MRPS25
  • MRPS26
  • MRPS27
  • MRPS28
  • MRPS29
  • MRPS30
  • MRPS31
  • MRPS32
  • MRPS33
  • MRPS34
  • MRPS35
  • MRPS36
  • MRPS37
  • MRPS38
  • MRPS39
  • MRPS5
  • MRPS6
  • MRPS7
  • MRPS9
  • MRRF
  • MTRF1A
  • MTRF1L
  • NCM1
  • NLVCF
  • NOF1
  • OXA1L
  • PDCD9
  • PLINP1
  • PRG6
  • PTCD3
  • RPL23L
  • RPML12
  • RPML2
  • RPML25
  • RPML27
  • RPML28
  • RPML3
  • RPML31
  • RPML32
  • RPML5
  • RPML8
  • RPMS11
  • RPMS12
  • RPMS13
  • RPMS15
  • RPMS16
  • RPMS17
  • RPMS21
  • RPMS22
  • RPMS25
  • RPMS6
  • RPMS9
  • RPSM12
  • URIM
Homo sapiens (human)
Reversal of alkylation damage by DNA dioxygenases
  • ABH5
  • ALKBH5
  • FTO
  • KIAA1752
  • OFOXD1
Homo sapiens (human)
Lactose synthesis
  • B4GALT1
  • GGTB2
  • GLUT1
  • LALBA
  • LYZL7
  • SLC2A1
Homo sapiens (human)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • KIAA0935
  • LAMAN
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANA
  • MANA1
  • MANB
  • MANB1
  • MANBA
Homo sapiens (human)
Cell-extracellular matrix interactions
  • ABPL
  • FBLIM1
  • FBLP1
  • FERMT2
  • FLN
  • FLN1
  • FLN2
  • FLNA
  • FLNC
  • ILK
  • ILK1
  • ILK2
  • KIND2
  • LIMS1
  • LIMS2
  • MIG2
  • MXRA2
  • PARVA
  • PARVB
  • PINCH
  • PINCH1
  • PINCH2
  • PLEKHC1
  • VASP
Homo sapiens (human)
Localization of the PINCH-ILK-PARVIN complex to focal adhesions
  • FNRB
  • ILK
  • ILK1
  • ILK2
  • ITGB1
  • MDF2
  • MSK12
  • MXRA2
  • PARVA
  • PXN
Homo sapiens (human)
ALPK1 signaling pathway
  • ALPK1
  • KIAA0733
  • KIAA1527
  • LAK
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • RNF85
  • RPS27A
  • T2BP
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TIFA
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Other interleukin signaling
  • C16orf77
  • C17orf33
  • CASP3
  • CD4
  • CPP32
  • CRFB4
  • CSF1
  • CSF1R
  • CSF3
  • CSF3R
  • D21S58
  • D21S66
  • FMS
  • GCSF
  • GCSFR
  • HTPZP2
  • IFNL1
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL16
  • IL28RA
  • IL29
  • IL32
  • IL34
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • LICR2
  • MBN
  • NK4
  • PRTN3
  • PTPRZ
  • PTPRZ1
  • PTPRZ2
  • PTPZ
  • SDC
  • SDC1
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • STX3
  • STX3A
  • STX4
  • STX4A
  • STXBP2
  • SYB2
  • TAIF
  • TXLN
  • TXLNA
  • TYK2
  • UNC18B
  • VAMP2
  • ZCYTO21
Homo sapiens (human)
Cilium Assembly
  • ATAT1
  • C6orf134
  • HDAC6
  • KIAA0901
  • MEC17
Homo sapiens (human)
Sensory perception of salty taste
  • CALHM1
  • CALHM3
  • DNACH
  • FAM26A
  • FAM26C
  • SCNN1
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
Homo sapiens (human)
Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB
  • MAOA
  • MAOB
Homo sapiens (human)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • COMT
  • COMT2
  • LRTOMT
  • MAOA
  • TOMT
Homo sapiens (human)
Enzymatic degradation of Dopamine by monoamine oxidase
  • COMT
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIP1
  • MAOA
  • OCT1
  • OCT2
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVMT
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VMAT2
Homo sapiens (human)
Clearance of dopamine
  • DAT1
  • MAOA
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Defective MAOA causes BRUNS
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • ASC1
  • ASCT1
  • ASCT2
  • ATA1
  • ATA2
  • ATA3
  • ATRC1
  • ATRC3
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BAT1
  • BGT1
  • C14orf69
  • CAT3
  • CD98LC
  • ERR
  • G17
  • JM24
  • KIAA0245
  • KIAA1382
  • LAT1
  • LAT2
  • LAT3
  • LAT4
  • M7V1
  • MCT10
  • MDU1
  • MPE16
  • NAT1
  • NAT2
  • NAT3
  • NBAT
  • NTT73
  • ORNT3
  • PAT1
  • PAT2
  • PAT4
  • PB39
  • POV1
  • RDR
  • RDRC
  • REC1L
  • SAT1
  • SAT2
  • SATT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC16A10
  • SLC1A4
  • SLC1A5
  • SLC25A29
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • SLC36A4
  • SLC38A1
  • SLC38A2
  • SLC38A3
  • SLC38A4
  • SLC38A5
  • SLC3A1
  • SLC3A2
  • SLC43A1
  • SLC43A2
  • SLC6A12
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A20
  • SLC6A6
  • SLC7A1
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A3
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SN1
  • SN2
  • SNAT1
  • SNAT2
  • SNAT3
  • SNAT4
  • SNAT5
  • TAT1
  • TRAMD1
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Defective SLC3A1 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A9 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)
Basigin interactions
  • ASC1
  • ATP1B
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • BAT1
  • BSG
  • CAML1
  • CAV
  • CAV1
  • CD43
  • CD98LC
  • CLG
  • CYPA
  • FNRB
  • GMA
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGB1
  • KIAA0245
  • L1CAM
  • LAT1
  • LAT2
  • MAG
  • MCT1
  • MCT3
  • MCT4
  • MDF2
  • MDU1
  • MIC5
  • MMP1
  • MPE16
  • MSK12
  • MSK18
  • PPIA
  • PPIL2
  • SLC16A1
  • SLC16A3
  • SLC16A8
  • SLC3A2
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SPN
Homo sapiens (human)
Defective SLC7A7 causes lysinuric protein intolerance (LPI)
  • MDU1
  • SLC3A2
  • SLC7A7
Homo sapiens (human)
Selenoamino acid metabolism
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • DARS
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • GLNS
  • IARS
  • IARS1
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • LARS
  • LARS1
  • MARS
  • MARS1
  • P18
  • PARS
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • SCYE1
Homo sapiens (human)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ANPEP
  • APN
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CAPER
  • CD13
  • CES1
  • CES2
  • CGL2
  • CMA1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CPSD
  • CTSD
  • CTSG
  • CTSGL2
  • CTSZ
  • CYH
  • CYM
  • DCP
  • DCP1
  • ELDF10
  • ENPEP
  • EPN
  • GZMH
  • MME
  • PCPB
  • PEPN
  • REN
  • SERPINA8
  • SES1
Homo sapiens (human)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport
  • C15orf6
  • CDRC2
  • PDRC2
  • RH50
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
  • RHGK
Homo sapiens (human)
Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen
  • AE1
  • AQP1
  • CA1
  • CA2
  • CA4
  • CHIP28
  • CYB5R1
  • CYB5R2
  • CYB5R4
  • CYB5RL
  • DI
  • EPB3
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • NCB5OR
  • NQO3A2
  • RH50
  • RHAG
  • SLC4A1
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024