GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 926 - 950 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Defective SLC4A1 causes hereditary spherocytosis type 4 (HSP4), distal renal tubular acidosis (dRTA) and dRTA with hemolytic anemia (dRTA-HA)
  • AE1
  • DI
  • EPB3
  • SLC4A1
Homo sapiens (human)
Sensory processing of sound by inner hair cells of the cochlea
  • ACZ
  • AIE75
  • ATP2B1
  • BSN
  • C20orf145
  • C6orf32
  • C9orf75
  • CABP1
  • CABP2
  • CACH3
  • CACN4
  • CACNA1D
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNL1A2
  • CACNLB2
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CASK
  • CCHL1A2
  • CDH23
  • CIB2
  • CLIC5
  • CLN4
  • CMYA3
  • DAL1
  • DFNB25
  • DFNB31
  • DFNB36
  • DFNB59
  • DIFF48
  • DNAJC5
  • EPB41L1
  • EPB41L3
  • EPS8
  • EPS8L2
  • EPS8R2
  • ESPN
  • ESPNL
  • EZR
  • FAM65B
  • FER1L2
  • FSCN2
  • GRXCR1
  • GRXCR2
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNQ4
  • KIAA0338
  • KIAA0386
  • KIAA0434
  • KIAA0558
  • KIAA0559
  • KIAA0987
  • KIAA1526
  • KIAA1774
  • KIAA1812
  • KIP2
  • LHFPL5
  • LIN2
  • LRRC52
  • MSN
  • MYH9
  • MYO15
  • MYO15A
  • MYO1C
  • MYO3A
  • MYO3B
  • MYO7A
  • MYSB
  • NEAS
  • OTOF
  • PCDH15
  • PCLO
  • PJVK
  • PL48
  • PLS1
  • PMCA1
  • PTK9
  • PTK9L
  • RAB3A
  • RDX
  • RIPOR2
  • SANS
  • SLC17A8
  • SLO
  • SNAP
  • SNAP25
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • STRC
  • STX1
  • STX1A
  • SYB2
  • SYN1
  • SYP
  • TMC1
  • TMC2
  • TMHS
  • TMIE
  • TPRN
  • TWF1
  • TWF2
  • USH1B
  • USH1C
  • USH1F
  • USH1G
  • VAMP2
  • VGLUT3
  • VIL2
  • WHRN
  • XIRP2
  • ZNF231
Homo sapiens (human)
2-LTR circle formation
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • G22P1
  • G22P2
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • LIG4
  • PSIP1
  • PSIP2
  • XRCC4
  • XRCC5
  • XRCC6
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Nuclear Envelope Breakdown
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • EDMD
  • EMD
  • LEMD2
  • LEMD3
  • MAN1
  • STA
  • VRK1
Homo sapiens (human)
Integration of provirus
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KPNA1
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RCH2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
APOBEC3G mediated resistance to HIV-1 infection
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Autointegration results in viral DNA circles
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Integration of viral DNA into host genomic DNA
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Laminin interactions
  • CD49B
  • COL18A1
  • FNRB
  • HSPG2
  • ITGA1
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB4
  • KIAA0533
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMC3
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LAMS
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK18
  • MSK8
  • NID
  • NID1
  • NID2
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Proton-coupled monocarboxylate transport
  • BSG
  • EMB
  • MCT1
  • MCT2
  • MCT3
  • MCT4
  • SLC16A1
  • SLC16A3
  • SLC16A7
  • SLC16A8
Homo sapiens (human)
Defective SLC16A1 causes symptomatic deficiency in lactate transport (SDLT)
  • BSG
  • MCT1
  • SLC16A1
Homo sapiens (human)
STAT5 activation downstream of FLT3 ITD mutants
  • ASH
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • CAP20
  • CD135
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • FLK2
  • FLT3
  • GAB2
  • GRB2
  • KIAA0571
  • MDA6
  • NOX4
  • PIC1
  • PIM1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RENOX
  • SDI1
  • SHPTP2
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STK1
  • WAF1
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1-mediated effects on programmed cell death
  • 3a
  • 7a
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • E
  • sM
Homo sapiens (human)
FLT3 Signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BCL2L11
  • BIM
  • CD135
  • CDKN1B
  • FKHRL1
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • GAB2
  • GADS
  • GRAP2
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB2L
  • GRBIR
  • GRID
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0207
  • KIAA0571
  • KIP1
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PKB
  • PKBG
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC
  • SHPTP2
  • SOS1
  • STK1
  • p27
Homo sapiens (human)
RUNX3 regulates BCL2L11 (BIM) transcription
  • AML2
  • BCL2L11
  • BIM
  • CBFA3
  • DPC4
  • FKHRL1
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • MADH3
  • MADH4
  • PEBP2A3
  • RUNX3
  • SMAD3
  • SMAD4
Homo sapiens (human)
Nuclear events stimulated by ALK signaling in cancer
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AILIM
  • AIM
  • APRF
  • BCL2A1
  • BCL2L5
  • BFL1
  • BHLHA38
  • CCNB
  • CCNB1
  • CEBPB
  • CGL1
  • CSPB
  • CTLA1
  • CUL1
  • CXXC9
  • DNMT
  • DNMT1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • EMC19
  • ERK1
  • ERK2
  • FKHL16
  • FOXM1
  • GRB
  • GRS
  • GZMB
  • HBPA1
  • HCP
  • HDAC1
  • HFH11
  • ICOS
  • IL10R
  • IL10RA
  • IRF4
  • JUNB
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MOV10
  • MPP2
  • MUM1
  • NIPA
  • NPM
  • NPM1
  • OCP2
  • PFP
  • PRF1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RB1
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS6
  • SKP1
  • SKP1A
  • SRK
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • TCEB1L
  • TCF5
  • TNRC6C
  • TWIST
  • TWIST1
  • WIN
  • ZAP70
  • ZC3HC1
Homo sapiens (human)
AKT phosphorylates targets in the cytosol
  • AKT1
  • AKT1S1
  • AKT2
  • AKT3
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L8
  • CAP20
  • CASP9
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CHUK
  • CIP1
  • GSK3A
  • GSK3B
  • IKKA
  • KIP1
  • MCH6
  • MDA6
  • MDM2
  • MKRN1
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • PRAS40
  • RAC
  • RNF61
  • SDI1
  • TCF16
  • TSC2
  • TSC4
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
Translation of Replicase and Assembly of the Replication Transcription Complex
  • 1a
  • 8b
  • 9b
  • BC2
  • BECN1
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • GT197
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • NEDF
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • UVRAG
  • VPS15
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS34
  • rep
Homo sapiens (human)
Translation of Replicase and Assembly of the Replication Transcription Complex
  • BC2
  • BECN1
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • GT197
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • NEDF
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • UVRAG
  • VPS15
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS34
  • rep
Homo sapiens (human)
Pre-NOTCH Processing in Golgi
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • B4GALT1
  • CGS23
  • FUR
  • FURIN
  • GGTB2
  • INT3
  • LFNG
  • MFNG
  • NANTA3
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • PACE
  • PCSK3
  • RAB6
  • RAB6A
  • RFNG
  • RNP24
  • SEL1L
  • SIAT10
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL6
  • STZ
  • TAN1
  • TMED2
  • TSA305
Homo sapiens (human)
Nephron development
  • BRN1
  • DLL1
  • HNF1B
  • HNF4
  • HNF4A
  • IRX1
  • IRX2
  • IRXA1
  • IRXA2
  • JAG1
  • JAGL1
  • LFNG
  • LHX1
  • LIM-1
  • LIM1
  • NR2A1
  • OTF8
  • POU3F3
  • TCF14
  • TCF2
  • WNT14B
  • WNT15
  • WNT4
  • WNT9B
  • WT1
Homo sapiens (human)
Defective LFNG causes SCDO3
  • INT3
  • LFNG
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • TAN1
Homo sapiens (human)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • ADAM2
  • ADAM20
  • ADAM21
  • ADAM30
  • B4GALT1
  • FTNB
  • GGTB2
  • HYAL3
  • MUC9
  • OGP
  • OVGP1
  • PH20
  • SPAM1
  • ZP1
  • ZP2
  • ZP3
  • ZP3A
  • ZP3B
  • ZP4
  • ZPA
  • ZPB
  • ZPC
Homo sapiens (human)
Defective B4GALT1 causes CDG-2d
  • B4GALT1
  • GGTB2
Homo sapiens (human)
O-linked glycosylation
  • AGO61
  • B3GALNT2
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • C3orf39
  • DAG1
  • EOGTL
  • GTDC2
  • GYLTL1B
  • KIAA0609
  • LARGE
  • LARGE1
  • LARGE2
  • MGAT1.2
  • POMGNT1
  • POMGNT2
  • POMK
  • POMT1
  • POMT2
  • SGK196
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: December 9, 2024