GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1851 - 1875 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Drug resistance in ERBB2 TMD/JMD mutants
  • CDC37
  • CDC37A
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • HER2
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
Homo sapiens (human)
Regulation of PTEN localization
  • API3
  • BIRC4
  • HAUSP
  • IAP3
  • KIAA0093
  • MMAC1
  • MYL
  • NEDD4
  • NEDD4-1
  • PML
  • PP8675
  • PTEN
  • RNF71
  • RPF1
  • RPS27A
  • TEP1
  • TRIM19
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • XIAP
Homo sapiens (human)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 12
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • HORK3
  • P2RY12
Homo sapiens (human)
Chylomicron clearance
  • APOB
  • APOE
  • ARH
  • HTGL
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPC
Homo sapiens (human)
Loss of MECP2 binding ability to 5mC-DNA
  • HDAC1
  • RPD3L1
  • SIN3A
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated NF-kB activation
  • A4
  • AD1
  • AGER
  • APP
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FIP3
  • HMG1
  • HMGB1
  • IFIH1
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KBRAS1
  • KBRAS2
  • KIAA1271
  • LYT10
  • MAD3
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MAVS
  • MDA5
  • MEKK
  • MEKK1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • RAGE
  • RELA
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • S100A12
  • S100B
  • SAA1
  • TCF16
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • TRIP9
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • ASC1
  • ASCT1
  • ASCT2
  • ATA1
  • ATA2
  • ATA3
  • ATRC1
  • ATRC3
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BAT1
  • BGT1
  • C14orf69
  • CAT3
  • CD98LC
  • ERR
  • G17
  • JM24
  • KIAA0245
  • KIAA1382
  • LAT1
  • LAT2
  • LAT3
  • LAT4
  • M7V1
  • MCT10
  • MDU1
  • MPE16
  • NAT1
  • NAT2
  • NAT3
  • NBAT
  • NTT73
  • ORNT3
  • PAT1
  • PAT2
  • PAT4
  • PB39
  • POV1
  • RDR
  • RDRC
  • REC1L
  • SAT1
  • SAT2
  • SATT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC16A10
  • SLC1A4
  • SLC1A5
  • SLC25A29
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • SLC36A4
  • SLC38A1
  • SLC38A2
  • SLC38A3
  • SLC38A4
  • SLC38A5
  • SLC3A1
  • SLC3A2
  • SLC43A1
  • SLC43A2
  • SLC6A12
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A20
  • SLC6A6
  • SLC7A1
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A3
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SN1
  • SN2
  • SNAT1
  • SNAT2
  • SNAT3
  • SNAT4
  • SNAT5
  • TAT1
  • TRAMD1
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Activation of gene expression by SREBF (SREBP)
  • ACAC
  • ACACA
  • ACACB
  • ACC1
  • ACC2
  • ACCA
  • ACCB
  • AIB3
  • ANG1
  • ARC205
  • BAF60C
  • BHLHD2
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CYP51
  • CYP51A1
  • D7SR
  • DHCR7
  • DRIP205
  • DRIP230
  • ELOVL6
  • ERG1
  • FACE
  • FADS5
  • FAS
  • FASN
  • FDFT1
  • FDPS
  • FPS
  • GGPS1
  • GPAM
  • GPAT1
  • HAP3
  • HCA137
  • HELZ2
  • HMGCS
  • HMGCS1
  • IDI1
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA1293
  • KIAA1560
  • KIAA1769
  • KISH2
  • LCE
  • LSS
  • MED1
  • MPD
  • MTF1
  • MVD
  • MVK
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • NR1C1
  • NR2B1
  • OSC
  • PBP
  • PIMT
  • PMKI
  • PMVK
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAP250
  • RB18A
  • RXRA
  • SC5D
  • SC5DL
  • SCD
  • SCD1
  • SCDOS
  • SMARCD3
  • SP1
  • SQLE
  • SRC1
  • SRC2
  • SREBF2
  • SREBP2
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • TIF2
  • TM7SF2
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
  • TSFP1
Homo sapiens (human)
Nuclear import of Rev protein
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • CHC1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNB1
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NPM
  • NPM1
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP2
  • RCC1
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Synthesis and processing of ENV and VPU
  • FUR
  • FURIN
  • PACE
  • PCSK3
  • env
  • vpu
Homo sapiens (human)
Metabolism of serotonin
  • ALDH2
  • ALDM
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Mitochondrial calcium ion transport
  • AKAP1
  • AKAP149
  • C10orf42
  • C22orf32
  • CALC
  • CBARA1
  • CCDC109A
  • CCDC109B
  • EFHA1
  • EFHA2
  • EMRE
  • LETM1
  • MCU
  • MCUB
  • MICU1
  • MICU2
  • MICU3
  • NCKX6
  • NCLX
  • NCX3
  • PRKA1
  • SLC24A6
  • SLC8A3
  • SLC8B1
  • SMDT1
  • VDAC
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of DPAn-3 SPMs
  • COX2
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Cytosolic tRNA aminoacylation
  • AARS
  • AARS1
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • CARS
  • CARS1
  • DARS
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • FARS
  • FARSA
  • FARSB
  • FARSL
  • FARSLA
  • FARSLB
  • FRSB
  • G7A
  • GARS
  • GARS1
  • GLNS
  • HARS
  • HARS1
  • HRS
  • IARS
  • IARS1
  • IFI53
  • IOPPP
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • LARS
  • LARS1
  • MARS
  • MARS1
  • NARS
  • NARS1
  • NRS
  • P18
  • PARS
  • PP
  • PPA1
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • SARS
  • SARS1
  • SCYE1
  • SERS
  • TARS
  • TARS1
  • VARS
  • VARS1
  • VARS2
  • WARS
  • WARS1
  • WRS
  • YARS
  • YARS1
Homo sapiens (human)
SUMO is proteolytically processed
  • KIAA1331
  • SENP1
  • SENP2
  • SENP5
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Defective ABCB11 causes PFIC2 and BRIC2
  • ABCB11
  • BSEP
Homo sapiens (human)
Defective visual phototransduction due to RDH5 loss of function
  • CRALBP
  • HSD17B9
  • RDH1
  • RDH5
  • RLBP1
  • SDR9C5
Homo sapiens (human)
FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis
  • ADRM1
  • AIK
  • AIRK1
  • ARK1
  • AURA
  • AURKA
  • AYK1
  • BTAK
  • C7orf76
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBL18
  • FBL6
  • FBL7
  • FBXL18
  • FBXL7
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IAK1
  • KIAA0107
  • KIAA0840
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • STK15
  • STK6
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • BUB1B
  • BUB3
  • BUBR1
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • KIAA1406
  • MAD2
  • MAD2L1
  • MAD3L
  • NEK2
  • NEK2A
  • NLK1
  • RPS27A
  • SFT
  • SSK1
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating tumorigenic genes
  • AREG
  • AREGB
  • BCL2
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • CBP
  • CREBBP
  • EGF
  • EP300
  • MAFK
  • NFE2L2
  • NOTCH1
  • NRF2
  • P300
  • PDGF1
  • PDGFA
  • SDGF
  • SP1
  • TAN1
  • TSFP1
Homo sapiens (human)
Activation of RAC1 downstream of NMDARs
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK1
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • GIT1
  • KIAA0787
  • RAC1
  • TC25
Homo sapiens (human)
Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors
  • A15
  • ADTAA
  • AP2A1
  • CLAPA1
  • DXS1692E
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR2
  • GLUR3
  • GLUR4
  • GLURC
  • GRIA1
  • GRIA2
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GRIP1
  • GRIP2
  • GluA2
  • GluA3
  • GluA4
  • KIAA1719
  • MXS1
  • NSF
  • PICK1
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCABP
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCG
  • TM4SF2
  • TSPAN7
Homo sapiens (human)
EGR2 and SOX10-mediated initiation of Schwann cell myelination
  • ACOD4
  • ADGRG6
  • ADGRV1
  • BAF190A
  • BHLHD2
  • BRG1
  • BRN2
  • CYP51
  • CYP51A1
  • DAG1
  • DMDL
  • DREG
  • DRP1
  • DRP2
  • EGR2
  • GAS3
  • GMA
  • GPR126
  • GPR98
  • HDAC2
  • HMGCR
  • KIAA0686
  • KIAA1620
  • KIAA1943
  • KROX20
  • LAMA2
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMC1
  • LAMM
  • MADER
  • MAG
  • MASS1
  • MBP
  • MPZ
  • NAB1
  • NAB2
  • OCT6
  • OCT7
  • OTF6
  • OTF7
  • PMP22
  • POU3F1
  • POU3F2
  • PRX
  • SCD2
  • SCD4
  • SCD5
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • SOX10
  • SREBF2
  • SREBP2
  • TAZ
  • TCF13
  • TEAD1
  • TEF1
  • UTRN
  • VIGR
  • VLGR1
  • WWTR1
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
LDL clearance
  • AADACL1
  • ACACT
  • ACACT1
  • ACACT2
  • ACAT
  • ACAT1
  • ACAT2
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • APOB
  • ARH
  • CES3
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HE1
  • HIP9
  • HYPJ
  • ILDR3
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • KIAA1363
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPA
  • LISCH
  • LSR
  • NARC1
  • NCEH1
  • NPC1
  • NPC2
  • PCSK9
  • SOAT
  • SOAT1
  • SOAT2
  • STAT
Homo sapiens (human)
Defective DNA double strand break response due to BARD1 loss of function
  • BARD1
  • BRCA1
  • RNF53
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024