GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 551 - 575 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
IRE1alpha activates chaperones
  • ERN1
  • GRP78
  • HSPA5
  • IRE1
Homo sapiens (human)
NEIL3-mediated resolution of ICLs
  • NEIL3
Homo sapiens (human)
Defective Base Excision Repair Associated with NEIL3
  • NEIL3
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-2 modulates autophagy
  • 3a
  • 7a
  • KIAA0770
  • KIAA1475
  • M
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • RNF108
  • TLP
  • TUFM
  • UVRAG
  • VAM6
  • VPS11
  • VPS16
  • VPS18
  • VPS33A
  • VPS33B
  • VPS39
  • VPS41
  • VPS45
  • VPS45A
  • VPS45B
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1 modulates host translation machinery
  • 1a
  • CCG2
  • D6S218E
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EF1A
  • FAU
  • FTE1
  • HNRNPA1
  • HNRPA1
  • LAMBR
  • LAMR1
  • LENG7
  • MFTL
  • MPS1
  • N
  • RIG
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • SCAR
  • UBA80
  • UBCEP1
  • rep
Homo sapiens (human)
Peptide chain elongation
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF2
  • EF1A
  • EF2
  • FAU
  • FTE1
  • LAMBR
  • LAMR1
  • LENG7
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Eukaryotic Translation Elongation
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF1A1P5
  • EEF1A2
  • EEF1AL
  • EEF1AL3
  • EEF1B
  • EEF1B2
  • EEF1D
  • EEF1G
  • EF1A
  • EF1B
  • EF1D
  • EF1G
  • LENG7
  • STN
Homo sapiens (human)
Defective SLC4A4 causes renal tubular acidosis, proximal, with ocular abnormalities and mental retardation (pRTA-OA)
  • NBC
  • NBC1
  • NBCE1
  • SLC4A4
Homo sapiens (human)
Elastic fibre formation
  • DANCE
  • ELN
  • FBLN5
  • FBN
  • FBN1
  • FBN2
  • FBN3
  • FNRA
  • FNRB
  • FUR
  • FURIN
  • GP3A
  • ITGA5
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB6
  • KIAA1776
  • LOX
  • LOXC
  • LOXL
  • LOXL1
  • LOXL2
  • LOXL3
  • LOXL4
  • MAGP1
  • MAGP2
  • MDF2
  • MFAP2
  • MFAP5
  • MSK12
  • MSK8
  • PACE
  • PCSK3
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • C20orf54
  • ENPP1
  • FLAD1
  • GPR172A
  • GPR172B
  • M6S1
  • NPPS
  • PAR1
  • PAR2
  • PC1
  • PDNP1
  • RFK
  • RFT1
  • RFT2
  • RFT3
  • RFVT3
  • SLC52A1
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
  • CD39
  • CD39L1
  • CD39L2
  • CD39L3
  • CD39L4
  • ENTPD1
  • ENTPD2
  • ENTPD3
  • ENTPD4
  • ENTPD5
  • ENTPD6
  • ENTPD7
  • ENTPD8
  • IL6ST2
  • KIAA0392
  • LALP1
  • LALP70
  • LYSAL1
  • PCPH
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade
  • EEA1
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • RBSN
  • TLR9
  • VPS15
  • VPS34
  • ZFYVE2
  • ZFYVE20
Homo sapiens (human)
ERK/MAPK targets
  • BMK1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • ELK1
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • ISPK1
  • MAPK1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • MEF2
  • MEF2A
  • MEF2C
  • MSK1
  • MXI2
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PRKM1
  • PRKM11
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA5
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
Homo sapiens (human)
Inhibition of membrane repair
  • HGS
  • HRS
  • cfp7
  • esxG
  • esxH
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Signaling by RNF43 mutants
  • C2orf31
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • RNF43
  • WNT3A
Homo sapiens (human)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • C20orf182
  • C2orf31
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • GPR48
  • GPR49
  • GPR67
  • KIAA0055
  • KIAA1133
  • LGR4
  • LGR5
  • LGR6
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • PWTSR
  • RNF203
  • RNF43
  • RPS27A
  • RSPO1
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RSPO4
  • THSD2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBPY
  • USP8
  • WNT3A
  • ZNRF3
Homo sapiens (human)
Downregulation of ERBB2:ERBB3 signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • ERBB2
  • FLRF
  • GGF
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • KIAA0055
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRDP1
  • NRG1
  • NRG2
  • NTAK
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • RNF41
  • RPS27A
  • SMDF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBPY
  • USP8
Homo sapiens (human)
Myoclonic epilepsy of Lafora
  • EPM2A
  • EPM2B
  • GYG
  • GYG1
  • GYS
  • GYS1
  • NHLRC1
  • PPP1R3C
  • PPP1R5
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Regulation of PTEN localization
  • API3
  • BIRC4
  • HAUSP
  • IAP3
  • KIAA0093
  • MMAC1
  • MYL
  • NEDD4
  • NEDD4-1
  • PML
  • PP8675
  • PTEN
  • RNF71
  • RPF1
  • RPS27A
  • TEP1
  • TRIM19
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • XIAP
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression to limit cholesterol uptake
  • BZF1
  • IDOL
  • LXRA
  • LXRB
  • MYLIP
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • RXRA
  • RXRB
  • UNR
Homo sapiens (human)
Downregulation of ERBB4 signaling
  • ITCH
  • KIAA0093
  • NEDD4
  • NEDD4-1
  • RPF1
  • RPS27A
  • SRC
  • SRC1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWP1
Homo sapiens (human)
IRF3 mediated activation of type 1 IFN
  • C20orf183
  • DLM1
  • DTX4
  • IRF3
  • KIAA0937
  • NAK
  • NALP4
  • NLRP4
  • PAN2
  • PYPAF4
  • RNF155
  • RNH2
  • TBK1
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA
  • ABS
  • C20orf183
  • DDX41
  • DLM1
  • DTX4
  • ERIS
  • HT2A
  • IRF3
  • KIAA0937
  • MITA
  • NAK
  • NALP4
  • NLRP4
  • PAN2
  • PYPAF4
  • RNF109
  • RNF155
  • RNF81
  • RNH2
  • RO52
  • RPS27A
  • SSA1
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
  • TRIM21
  • TRIM32
  • TRIM56
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZBP1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024