GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 651 - 675 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Keratan sulfate degradation
  • ACAN
  • AGC1
  • CSPG1
  • ELNR1
  • FM
  • FMOD
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GNS
  • HEXA
  • HEXB
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • MSK16
  • OGN
  • OIF
  • OMD
  • PRELP
  • SLRR2A
  • SLRR2B
  • SLRR2C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SLRR3A
Homo sapiens (human)
MPS VII - Sly syndrome
  • GUSB
Homo sapiens (human)
CaM pathway
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
Homo sapiens (human)
Defective AVP does not bind AVPR2 and causes neurohypophyseal diabetes insipidus (NDI)
  • ADHR
  • ARVP
  • AVP
  • AVPR2
  • DIR
  • DIR3
  • V2R
  • VP
Homo sapiens (human)
Primitive streak formation
  • BMP2B
  • BMP4
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DPC4
  • DVR4
  • EOMES
  • FAST1
  • FAST2
  • FOXH1
  • GSC
  • KIAA1113
  • LEF1
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MIXL
  • MIXL1
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • POU5F1
  • RFG7
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SOX2
  • T
  • TBP2
  • TBPL2
  • TBR2
  • TBXT
  • TCF1
  • TCF7
  • TIF1G
  • TRF3
  • TRIM33
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating ER-stress associated genes
  • ATF4
  • CBP
  • CREB2
  • CREBBP
  • EP300
  • MAFK
  • NFE2L2
  • NRF2
  • P300
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCP
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALAS3
  • ALASE
  • ALASH
  • ALB
  • ASB
  • BCRP
  • BCRP1
  • COX10
  • COX15
  • CPO
  • CPOX
  • CPX
  • FECH
  • HMBS
  • MXR
  • PBGD
  • PPOX
  • UPS
  • UROD
  • UROS
Homo sapiens (human)
Defective MGAT2 causes CDG-2a
  • MGAT2
Homo sapiens (human)
Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin
  • AGBL1
  • AGBL2
  • AGBL3
  • AGBL4
  • AGBL5
  • AGTPBP1
  • C18orf10
  • C19orf20
  • C20orf125
  • C22orf7
  • C6orf104
  • C9orf20
  • CCDC23
  • CCP1
  • CCP2
  • CCP3
  • CCP4
  • CCP5
  • CCP6
  • CSTPP2
  • KIAA0153
  • KIAA0173
  • KIAA0998
  • KIAA1035
  • KIAA1036
  • LRRC49
  • NICN1
  • NNA1
  • STAMP
  • SVBP
  • TPGS1
  • TPGS2
  • TTL
  • TTL.6
  • TTLL1
  • TTLL10
  • TTLL11
  • TTLL12
  • TTLL13
  • TTLL13P
  • TTLL2
  • TTLL3
  • TTLL4
  • TTLL5
  • TTLL6
  • TTLL7
  • TTLL8
  • TTLL9
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA6
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • TUBB8
  • TUBB8B
  • VASH
  • VASH1
  • VASH2
  • VASHL
Homo sapiens (human)
APEX1-Independent Resolution of AP Sites via the Single Nucleotide Replacement Pathway
  • LIG3
  • MMH
  • MUTM
  • NEIL1
  • NEIL2
  • OGG1
  • OGH1
  • PNKP
  • POLB
  • XRCC1
Homo sapiens (human)
Negative regulation of activity of TFAP2 (AP-2) family transcription factors
  • AP2TF
  • C18orf5
  • FOR
  • KCTD1
  • KCTD15
  • SDR41C1
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TFAP2B
  • TFAP2BL1
  • TFAP2C
  • TFAP2D
  • TFAP2E
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • WOX1
  • WWOX
Homo sapiens (human)
RHOQ GTPase cycle
  • ABCC7
  • ARHDH9
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP34
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGAP7
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • ARHQ
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • ASCT2
  • BND7
  • BORG1
  • BORG2
  • BORG4
  • BORG5
  • BT
  • C11orf59
  • C6orf114
  • CAL
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42GAP
  • CEP1
  • CEP2
  • CEP3
  • CEP4
  • CFTR
  • CIP4
  • COOL1
  • CPNE8
  • CRIB1
  • CTNNG
  • DEPDC1B
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DP3
  • EPB72
  • FBP17
  • FIG
  • FNBP1
  • FNBP2
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GJAL
  • GOPC
  • GRAF
  • GRF1
  • GRIT
  • GRLF1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • ITSN
  • ITSN1
  • JUP
  • KIAA0051
  • KIAA0142
  • KIAA0147
  • KIAA0148
  • KIAA0424
  • KIAA0451
  • KIAA0456
  • KIAA0554
  • KIAA0599
  • KIAA0621
  • KIAA0712
  • KIAA1124
  • KIAA1142
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1556
  • KIAA1639
  • KIAA1722
  • KIAA1723
  • LAMTOR1
  • LAP4
  • M7V1
  • MPP7
  • MSE55
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • OBSCN
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • P190A
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PDRO
  • PIXB
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RASL7A
  • RDR
  • RDRC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RHOQ
  • RICH1
  • RICS
  • SBC2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SH3D1A
  • SLC1A5
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SNX26
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • STARD12
  • STB2
  • STEAP3
  • STOM
  • STOT
  • STP
  • SYB3
  • SYDE1
  • TC10
  • TCGAP
  • TFRC
  • TRIP10
  • TSAP6
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VARTUL
  • WASL
  • WWP2
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Signaling by ERBB2 ECD mutants
  • CDC37
  • CDC37A
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • GAB1
  • GRB1
  • HER1
  • HER2
  • HRAS
  • HRAS1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NEU
  • NGL
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
Homo sapiens (human)
NS1 Mediated Effects on Host Pathways
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • G1P2
  • ISG15
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • KPNA2
  • KPNA3
  • KPNA4
  • KPNA5
  • KPNA7
  • KPNB1
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NS
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • QIP1
  • QIP2
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH1
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SRP1
  • TMEM48
  • TPR
  • UCRP
Homo sapiens (human)
Defective C1GALT1C1 causes TNPS
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • C6orf205
  • CA125
  • COSMC
  • DRCC1
  • KIAA1359
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • PUM
  • RECC
  • SBEM
  • SMUC
Homo sapiens (human)
Folding of actin by CCT/TriC
  • 99D8.1
  • ACTB
  • C21orf112
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTH
  • CCTQ
  • CCTZ
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • NIP7-1
  • SRB
  • TCP1
  • TRIC5
Homo sapiens (human)
Activation of caspases through apoptosome-mediated cleavage
  • APAF1
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CASP9
  • CPP32
  • CYC
  • CYCS
  • IAP3
  • KIAA0413
  • MCH3
  • MCH6
  • XIAP
Homo sapiens (human)
Adherens junctions interactions
  • ANG
  • CADM1
  • CADM2
  • CADM3
  • CDH1
  • CDH10
  • CDH11
  • CDH11L
  • CDH12
  • CDH13
  • CDH14
  • CDH15
  • CDH17
  • CDH18
  • CDH2
  • CDH24
  • CDH3
  • CDH4
  • CDH5
  • CDH6
  • CDH7
  • CDH7L1
  • CDH8
  • CDH9
  • CDHE
  • CDHH
  • CDHN
  • CDHP
  • CTNNA1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • CTNNG
  • DP3
  • HVEB
  • HVEC
  • IGSF4
  • IGSF4A
  • IGSF4B
  • IGSF4D
  • JUP
  • KIAA0384
  • LNIR
  • NCAD
  • NECL1
  • NECL2
  • NECL3
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PRR1
  • PRR2
  • PRR3
  • PRR4
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL3
  • PVRL4
  • RNASE5
  • SYNCAM
  • SYNCAM3
  • TSLC1
  • TSLL1
  • UVO
Homo sapiens (human)
Serine biosynthesis
  • C5orf12
  • DIFF33
  • KIAA1253
  • PGDH3
  • PHGDH
  • PSA
  • PSAT1
  • PSPH
  • SERINC1
  • SERINC2
  • SERINC3
  • SERINC4
  • SERINC5
  • SRR
  • TDE1
  • TDE1L
  • TDE2
  • TDE2L
Homo sapiens (human)
Prevention of phagosomal-lysosomal fusion
  • CORO1
  • CORO1A
  • HGS
  • HRS
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB7
  • RAB7A
  • RPS27A
  • Rv1410c
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS33B
  • cfp7
  • esxG
  • esxH
  • lpd
  • lpdC
  • lpp-27
  • lprG
  • mptpA
  • ndk
  • ndkA
  • ptpA
  • sapM
  • secA2
Homo sapiens (human)
rRNA modification in the mitochondrion
  • FJH1
  • FTSJ2
  • MRM1
  • MRM2
  • MRM3
  • MTERF4
  • MTERFD2
  • NSUN4
  • RNMTL1
  • TFB1M
Homo sapiens (human)
Post-transcriptional silencing by small RNAs
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • CAGH26
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
Ephrin signaling
  • ARHGEF7
  • COOL1
  • DRT
  • EFL3
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • ELK
  • EPHB1
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • EPHT2
  • EPHT3
  • EPLG2
  • EPLG5
  • EPLG8
  • EPTH3
  • ERK
  • ETK2
  • FYN
  • GIT1
  • GRB4
  • HEK2
  • HEK5
  • HEK6
  • HTK
  • HTKL
  • KIAA0142
  • LERK2
  • LERK5
  • LERK8
  • MDA9
  • MLCB
  • MRLC3
  • MYK1
  • MYL12A
  • NCK2
  • NET
  • OPHN3
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK3BP
  • PIXB
  • RAC1
  • RLC
  • SDCBP
  • SYCL
  • TC25
  • TYRO11
  • TYRO5
  • TYRO6
Homo sapiens (human)
Neurofascin interactions
  • ANK
  • ANK1
  • CASPR
  • CNTN1
  • CNTNAP1
  • DBCN
  • DCX
  • KIAA0343
  • KIAA0756
  • LISX
  • MDA9
  • NFASC
  • NRCAM
  • NRXN4
  • SDCBP
  • SYCL
Homo sapiens (human)
Molybdenum cofactor biosynthesis
  • GPH
  • GPHN
  • KIAA1385
  • MCBPE
  • MOCO1
  • MOCOS
  • MOCS2
  • MOCS3
  • UBA4
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024